ADAMTS4和ADAMTS5基因多态性与冠心病相关性研究
发布时间:2020-08-05 15:29
【摘要】:目的:探讨ADAMTS4和ADAMTS5基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)和冠心病(coronary artery disease,CAD)的相关性。方法:以PCR反应为基础,用SSCP技术以及RFLP技术检测307例 CAD 患者和 315 例对照的 rs4233367,rs2830585 和 rs229072 SNP多态性位点基因型的分布情况。结果:SNPrs2830585在CAD组和对照组中基因型频率为CC(87.0%vs 78.4%)、CT(12.7%vs 20.6%)和TT(0.3%vs 1.0%),差异有统计学意义(χ2=8.291,P=0.016),两组间T等位基因频率分别为6.7%和11.3%,差异有统计学意义(χ2=8.004,P=0.005),经过Logistic回归分析后,rs2830585的CT+TT基因型组间差异依然有统计学意义(OR=1.777,95%CI:1.071~2.949,P=0.026)。SNPrs4233367、SNPrs229072在CAD组和对照组中无论基因型还是等位基因频率均无统计学意义差异(P0.05)。结论:ADAMTS5基因rs2830585多态性位点与CAD发病相关,C等位基因可能是CAD发生的易感基因。
【学位授予单位】:重庆医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R541.4;R440
【图文】:
使用Haploview软件对SNPrs2830585和rs229072位点做连锁不平衡分析。数逡逑据结果显示,rs2830585和rs229072两个位点之间^<0.8,提示相互之间不存在连逡逑锁不平衡现象。分析结果见图1。方块颜色深浅表示连锁程度的高低,颜色越深连逡逑13逡逑
预计逦504.2逦111.6逦6.2逦1120逦124逦0.134逦0.714逡逑2.4邋ADAMTS4和ADAMTS5基因3个SNP位点结果分析逡逑SNPrs4233367、rs2830585和rs229072的PCR扩增产物大小及特异性见图2。逡逑1、2为rs4233367的产物电泳结果,片段为677bp;邋3、4为rs2830585的产物电泳逡逑结果,片段为201bp;邋5、6为rs229072的产物电泳结果,片段为262bp。逡逑r—n逡逑M邋为邋Marker;邋1,2邋为邋SNPrs4233367;邋3,4邋为邋SNPrs2830585;邋5,6邋为邋rs229072;逡逑图2邋ADAMTS4和ADAMTSS基因PCR产物电泳图逡逑Fig.2邋Electrophoregram邋of邋SNPrs4233367,邋SNPrs2830585邋and邋SNPrs229072邋PCR逡逑amplification逡逑15逡逑
SNPrs4233367邋的邋PCR邋产物用邋FastDigest邋Smal邋酶切后可得到邋417bp邋和邋260bp逡逑的两个片段,未被酶切的获得一个片段,为TT型,部分被酶切的获得三个片段,逡逑为CT型,被完全酶切的获得两个片段,为CC型,结果见图30ADAMTS5邋rs2830585逡逑检测到CC、CT和TT3种基因型,结果见图4。rs229072检测到AA、AT和TT3逡逑种基因型,结果见图5。逡逑2000|逡逑100l逡逑M邋为邋Marker;邋1,4.5:邋CT邋型;2,6,7:邋CC邋型;3:邋TT邋型;逡逑图3邋SNPrs4233367酶切产物电泳图逡逑Fig.3邋Electrophoregram邋of邋SNPrs4233367邋enzyme-digested邋fragments逡逑1,2:为邋CT邋型;3,5,6,邋7,8:为邋CC邋型;4:为邋TT邋型逡逑图邋4邋SNP邋rs2830585邋的邋PCR-SSCP邋电泳图逡逑Fig.4邋Electrophoregram邋of邋SNPrs283058S邋PCR-SSCP邋amplification逡逑1,2:为邋AT邋型;3,邋4,邋5,邋6:为邋AA邋型;7:为邋TT邋型逡逑图邋5邋SNPrs229072邋的邋PCR-SSCP邋电泳图逡逑Fig.5邋Electrophoregram邋of邋SNPrs229072邋PCR-SSCP邋amplification逡逑16逡逑
本文编号:2781681
【学位授予单位】:重庆医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R541.4;R440
【图文】:
使用Haploview软件对SNPrs2830585和rs229072位点做连锁不平衡分析。数逡逑据结果显示,rs2830585和rs229072两个位点之间^<0.8,提示相互之间不存在连逡逑锁不平衡现象。分析结果见图1。方块颜色深浅表示连锁程度的高低,颜色越深连逡逑13逡逑
预计逦504.2逦111.6逦6.2逦1120逦124逦0.134逦0.714逡逑2.4邋ADAMTS4和ADAMTS5基因3个SNP位点结果分析逡逑SNPrs4233367、rs2830585和rs229072的PCR扩增产物大小及特异性见图2。逡逑1、2为rs4233367的产物电泳结果,片段为677bp;邋3、4为rs2830585的产物电泳逡逑结果,片段为201bp;邋5、6为rs229072的产物电泳结果,片段为262bp。逡逑r—n逡逑M邋为邋Marker;邋1,2邋为邋SNPrs4233367;邋3,4邋为邋SNPrs2830585;邋5,6邋为邋rs229072;逡逑图2邋ADAMTS4和ADAMTSS基因PCR产物电泳图逡逑Fig.2邋Electrophoregram邋of邋SNPrs4233367,邋SNPrs2830585邋and邋SNPrs229072邋PCR逡逑amplification逡逑15逡逑
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【参考文献】
相关期刊论文 前2条
1 魏凡华;张玉颖;于修平;;基质金属蛋白酶ADAMTS的研究进展[J];中国细胞生物学学报;2014年08期
2 李蕾;陈黎明;赵传艳;崔连群;;血管内皮生长因子对血管内皮细胞ADAMTS5、ADAMTS4及MMP-9表达的影响[J];中国老年学杂志;2013年19期
本文编号:2781681
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