我国四省人腺病毒4型的基因特征分析

发布时间：2021-04-06 23:28

　　研究目的在分子水平上初步探讨我国大陆地区流行HAdV-4病毒株的基因特征与分子进化规律,为我国HAdV-4疫情的监测、相关疾病的诊断与防控以及疫苗研究提供基础数据。研究方法对2013～2015年间在发热呼吸道症候群监测病例中鉴定为HAdV-4阳性的临床标本进行病毒分离,对HAdV-4病毒分离株分别进行三个靶基因（Penton base、Hexon和Fiber）以及全基因组（Whole-genome sequences,WGS）序列扩增和测定,同时下载GenBank数据库中所有我国及全球流行HAdV-4病毒株的上述基因序列,构建基因数据库,并使用相关生物信息学分析软件进行基因特征和分子进化分析。研究结果（1）从2013～2015年间的发热呼吸道症候群监测病例获得HAdV-4病毒分离株共计6株,分别来自陕西（2株）、云南（2株）、吉林（1株）和山东（1株）,覆盖我国东北、华东、西北和西南部地区;（2）基因亲缘性关系分析结果显示,全球流行HAdV-4病毒株可划分为HAdV-4p和HAdV-4a两个进化分支,我国大陆地区自2008年至今流行的HAdV4病毒株均属于HAdV-4a进化分支,与全球... 

【文章来源】：安徽理工大学安徽省

【文章页数】：71 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ扩增产物的凝胶电泳鉴定结果??１：?Ｓｈａｎｄｏｎｇ２０１４－１６１４?标本的?ＰＣＲ?产物；２：?Ｙｕｎｎａｎ２０１４－２（）０８?标本的?ＰＣＲ?产物；３：阳??

７５０．?１０００?ａｎｄ?２０００；?５：?ＥＸ－ＮＣ：?６：ＮＣ??３．３．２斤：列测定结采??以标本Ｓｈａｎｄｏｎｇ２０１４－Ｉ６１４卜＿游引物Ａｄｉ测得的部分序列为例（图４），所??Ｙｊ?ｖｌｊ株均获得良好的碱基峰图。??３．３．３?ＨＡｄＶ毒株的初步型别鉴定??将获得的病毒株Ｌ〇〇Ｐ２基因片段原始核苷酸序列，经Ｓｅｑｕｅｎｃｈｅｒ?５．０软件序??列整理后，与腺病毒Ａ？Ｇ?７个亚属共３０种基因型代表株进行系统发育分析，共??鉴定出６株ＨＡｄＶ－４病毒株，用于本实验的研究，初步基因定型鉴定结果见图５。??－１５－??

ｂａｓｅ、Ｈｅｘｏｎ－１、Ｈｅｘｏｎ＿２?和?Ｆｉｂｅｒ?为例，长度分别为?２０７０ｂｐ、１６８９ｂｐ、１４４０?和??１７０６ｂｐ〇经１％琼脂糖凝胶电泳鉴定后在相应大小范围能看到清晰的阳性条带，??如图６所示。??■〇?麵：■囉｜：＿＿獨：：??誦…??７５０＾??ＳＯＯＢ＾＾ｊ?ａ?＇＂％＂?＇＾４．．；?ｆ－?＇?－ｆｔ??ｌ?〇〇?■■??图６?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ扩增三个靶基因产物的凝胶电泳鉴定结果（以标本川丨１１２０１４－３３７２扩增??结果为例）??１：?ＤＮＡ分子量对照（ＤＬ５０００）：阳性条带自下往上分别为１００，?２５０，５００，?７５０，?１０００，??１５００．２０００．３０００?和?５０００；?２：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２?标本的?ＰｅｎｔｏｎｂａｓｅＰＣＲ?产物；３：Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２??标本的?Ｈｅｘｏｎ－１?ＰＣＲ?产物；４：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２?标本的?Ｈｅｘｏｎ－２ＰＣＲ?产物；５：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２??标本的ＲｂｅｒＰＣＲ产物；６：阴性对照??Ｆｉｇ?６?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ?ａｍｐｌｉｃｏｎｓ??１：?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ（ＤＬ５０００）

【参考文献】：
期刊论文
[1]2012-2015年青海省445例发热呼吸道症候群病例人腺病毒感染特征分析[J]. 李红,刘高山,石燕,牛培华,姜双应,徐莉立,陆柔剑,赵生仓,谭文杰.  中华预防医学杂志. 2017 (07)
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本文编号：3122352