浙江省某医院住院儿童下呼吸道病毒性病原学研究
发布时间:2021-05-20 14:26
第一部分临床评价多重荧光RT-PCR检测16种呼吸道病毒及亚型的方法呼吸道病毒是引起肺炎的主要病原,快速检测病原对呼吸道传染病的诊疗和控制有重要的作用。本研究利用临床363份痰液样本评价多重荧光RT-PCR(7组)检测16种呼吸道病毒及亚型的方法,使用我们己建立的电泳两管法检测16种呼吸道病毒作为参考标准,两种方法检测病毒的一致达97.00%,电泳两管法多重RT-PCR检测鼻病毒、副流感病毒3型、人偏肺病毒和人冠状病毒OC43的灵敏度略高于多重荧光RT-PCR,但多重荧光RT-PCR方法更便捷、迅速、简单、不易污染,适用在基层医疗和地方疾控系统监测呼吸道病毒。第二部分浙江省某医院住院儿童下呼吸道感染病毒相关研究每年在全球范围内,呼吸道病毒是导致人类发病和死亡的最主要原因之一,特别是老人和儿童。目前在中国有很多关于呼吸道病原的报道,但是相对缺乏严格的临床诊断标准和系统全面的分析,也缺乏详细的病原学信息。我们的研究基于常规监测浙江省某医院住院儿童下呼吸道感染病毒等病原体数据,从2017年2月到2019年1月,一共纳入了 1926例呼吸道感染患儿,主要以3岁以下儿童为主,检测阳性的样本一共有...
【文章来源】:中国疾病预防控制中心北京市
【文章页数】:108 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 临床评价多重荧光RT-PCR检测16种呼吸道病毒及亚型的方法
1. 引言
1.1 核酸扩增技术的概述
1.2 检测呼吸道病原的常规方法和技术
2. 材料和方法
2.1 主要试剂和仪器
2.2 临床样本及核酸提取
2.3 临床评价mqRT-PCR法检测16种呼吸道病毒及亚型的方法
3. 结果
3.1 临床标本检测结果及验证结果
4. 讨论
5. 本章小结
第二部分 浙江省某医院住院儿童下呼吸道感染的病毒性病原学研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 试剂和仪器
2.2 临床样本
2.3 多重RT-PCR检测检测16种呼吸道病毒及亚型
2.4 支原体、衣原体、人巨细胞病毒、EB病毒核酸和IgM检测
2.5 统计学方法
3. 结果
3.1 下呼吸道感染住院儿童病原体的检出结果
3.2 下呼吸道感染住院儿童病例对照研究结果
4. 讨论
5. 本章小结
第三部分 不同提取试剂盒对呼吸道临床样本的宏病毒分析的影响的研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 主要试剂和仪器
2.2 临床样本
2.3 提取样本核酸
2.4 荧光定量RT-PCR检测
2.5 二代测序
2.6 生物信息学分析
3. 结果
3.1 荧光定量RT-PCR对试剂盒效率的评价
3.2 NGS检测结果对试剂盒效率的评价
4. 讨论
5. 本章小结
第四部分 浙江省某医院住院儿童副流感病毒3型的全基因组分析研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 临床样本
2.2 生物信息学软件分析
3. 结果
3.1 18样本临床样本二代测序测序结果
3.2 18份样本呼吸道病毒进化分析
4. 讨论
5. 本章小结
全文总结
参考文献
综述
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]Simultaneous virus identification and characterization of severe unexplained pneumonia cases using a metagenomics sequencing technique[J]. Xiaohui Zou,Guangpeng Tang,Xiang Zhao,Yan Huang,Tao Chen,Mingyu Lei,Wenbing Chen,Lei Yang,Wenfei Zhu,Li Zhuang,Jing Yang,Zhaomin Feng,Dayan Wang,Dingming Wang,Yuelong Shu. Science China(Life Sciences). 2017(03)
本文编号:3197911
【文章来源】:中国疾病预防控制中心北京市
【文章页数】:108 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 临床评价多重荧光RT-PCR检测16种呼吸道病毒及亚型的方法
1. 引言
1.1 核酸扩增技术的概述
1.2 检测呼吸道病原的常规方法和技术
2. 材料和方法
2.1 主要试剂和仪器
2.2 临床样本及核酸提取
2.3 临床评价mqRT-PCR法检测16种呼吸道病毒及亚型的方法
3. 结果
3.1 临床标本检测结果及验证结果
4. 讨论
5. 本章小结
第二部分 浙江省某医院住院儿童下呼吸道感染的病毒性病原学研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 试剂和仪器
2.2 临床样本
2.3 多重RT-PCR检测检测16种呼吸道病毒及亚型
2.4 支原体、衣原体、人巨细胞病毒、EB病毒核酸和IgM检测
2.5 统计学方法
3. 结果
3.1 下呼吸道感染住院儿童病原体的检出结果
3.2 下呼吸道感染住院儿童病例对照研究结果
4. 讨论
5. 本章小结
第三部分 不同提取试剂盒对呼吸道临床样本的宏病毒分析的影响的研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 主要试剂和仪器
2.2 临床样本
2.3 提取样本核酸
2.4 荧光定量RT-PCR检测
2.5 二代测序
2.6 生物信息学分析
3. 结果
3.1 荧光定量RT-PCR对试剂盒效率的评价
3.2 NGS检测结果对试剂盒效率的评价
4. 讨论
5. 本章小结
第四部分 浙江省某医院住院儿童副流感病毒3型的全基因组分析研究
1. 引言
2. 材料和方法
2.1 临床样本
2.2 生物信息学软件分析
3. 结果
3.1 18样本临床样本二代测序测序结果
3.2 18份样本呼吸道病毒进化分析
4. 讨论
5. 本章小结
全文总结
参考文献
综述
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]Simultaneous virus identification and characterization of severe unexplained pneumonia cases using a metagenomics sequencing technique[J]. Xiaohui Zou,Guangpeng Tang,Xiang Zhao,Yan Huang,Tao Chen,Mingyu Lei,Wenbing Chen,Lei Yang,Wenfei Zhu,Li Zhuang,Jing Yang,Zhaomin Feng,Dayan Wang,Dingming Wang,Yuelong Shu. Science China(Life Sciences). 2017(03)
本文编号:3197911
本文链接:https://www.wllwen.com/linchuangyixuelunwen/3197911.html
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