基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱用于细菌鉴定和同源性分析能力的实验研究
发布时间:2021-05-21 17:48
目的:研究基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对细菌鉴定和耐药菌同源性分析方面在临床实验室应用的可行性。方法:收集2015年1月至2016年1月我院临床标本分离获得的非重复样本,共440株。首先,利用VITEK 2全自动微生物鉴定及药敏系统(采用传统生化反应技术)和VITEK MS全自动快速微生物质谱仪(采用MALDI-TOF MS技术)对这些株细菌进行鉴定。然后,将上述方法鉴定结果不一致菌株再用细菌核糖体16S rRNA基因序列分析进行鉴定;同时,对基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪在检测周转时间(Turn-around time,TAT)方面的优势进行评价。此外,收集2017年10月12月,经改良Hodge实验(Modified Hodge test,MHT)筛选为阳性的肺炎克雷伯菌95株。利用多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)、Mi...
【文章来源】:军事科学院北京市
【文章页数】:47 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
缩略语表
摘要
Abstract
前言
第一部分 仪器与试剂
1.1 菌株来源
1.1.1 MALDI-TOF MS鉴定所用菌株
1.1.2 MALDI-TOF MS对CRKP同源性分析所用菌株
1.1.3 VITEK MS全自动快速微生物质谱检测系统校准菌株
1.1.4 实验质控菌株
1.2 主要试剂配制方法
1.2.1 菌株保存培养基
1.2.2 70%甲酸溶液
1.2.3 标准溶剂
1.2.4 HCCA溶液
1.3 主要试剂
1.4 主要仪器
第二部分 MALDI-TOF MS用于鉴定常见细菌能力的研究
2.1 实验设计及技术路线
2.2 VITEK2鉴定分析
2.2.1 主要操作步骤
2.2.2 实验结果
2.3 MALDI-TOF MS鉴定分析
2.3.1 主要操作步骤
2.3.2 实验结果
2.4 16S rRNA基因分析方法对15株不一致菌株的鉴定分析
2.4.1 主要操作步骤
2.4.2 实验结果
2.5 讨论
第三部分 MALDI-TOF MS对CRKP同源性分析能力的研究
3.1 实验设计及技术路线
3.2 改良Hodge实验(MHT)
3.2.1 主要步骤
3.3 多位点序列分型(MLST)
3.3.1 主要步骤
3.3.2 实验结果
3.4 MALDI-TOF MS同源性分析
3.4.1 主要操作步骤
3.4.2 95株CRKP鉴定得分
3.4.3 95株CRKP聚类分析结果
3.5 讨论
第四章 结论与展望
参考文献
附录A 同源性分析质谱靶板位点编号与样本编号对应表
附录B 95株CRKP MALDI-TOF MS鉴定得分详表
作者在学期间取得的学术成果
主要简历
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]2013-2017年医院感染现患率调查分析[J]. 余淑霞,许婷,马鸿云. 中华医院感染学杂志. 2018(08)
[2]2014-2017年某三级甲等综合医院医院感染现患率的变化趋势分析[J]. 李璐,索继江,高岩,谢丽君,刘伯伟,姚宏武,刘运喜. 中华医院感染学杂志. 2018(08)
[3]某医院2014年-2016年住院患者医院感染综合性监测[J]. 孟冬梅,田立芝,李冠华,王联群. 中华医院感染学杂志. 2018(06)
[4]重症监护病房院内获得性感染的临床分析[J]. 齐志丽,刘培,庄海舟,段美丽. 首都医科大学学报. 2018(01)
[5]社区及院内耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染的临床特征比较及耐药性分析[J]. 弓清梅,张延军,宋璐. 中国药物与临床. 2018(01)
[6]MALDI-TOF MS直接鉴定血培养阳性标本中的病原菌[J]. 方毅,张景皓,赵虎. 老年医学与保健. 2017(06)
[7]多重耐药鲍曼不动杆菌的临床流行特征[J]. 韩蕾,雷金娥,祁杰,徐纪茹,韩少山. 西安交通大学学报(医学版). 2017(06)
[8]2016年中国CHINET细菌耐药性监测[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪复,蒋晓飞,徐英春,张小江,张朝霞,季萍,谢轶,康梅,王传清,王爱敏,徐元宏,沈继录,孙自镛,陈中举,倪语星,孙景勇,褚云卓,田素飞,胡志东,李金,俞云松,林洁,单斌,杜艳,郭素芳,魏莲花,邹凤梅,张泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,苏丹虹,汪瑞忠,房华,俞碧霞,赵勇,龚萍,郭大文,赵金英,刘文恩,李艳明,金炎,邵春红,温开镇,张贻荣,徐雪松,鄢超,喻华,黄湘宁,王山梅,楚亚菲,张利侠,马娟,周树平,周艳,朱镭,孟晋华. 中国感染与化疗杂志. 2017(05)
[9]3种鉴定系统在微生物室间质量评价中的应用和比较[J]. 陈蓉,居颺,刘战民. 检验医学. 2017(05)
[10]耐药性细菌碳青霉烯酶检测方法研究进展[J]. 徐建民,陈水平,陈建魁. 标记免疫分析与临床. 2017(03)
硕士论文
[1]耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性及同源性研究[D]. 谢思.南方医科大学 2017
本文编号:3200122
【文章来源】:军事科学院北京市
【文章页数】:47 页
【学位级别】:硕士
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缩略语表
摘要
Abstract
前言
第一部分 仪器与试剂
1.1 菌株来源
1.1.1 MALDI-TOF MS鉴定所用菌株
1.1.2 MALDI-TOF MS对CRKP同源性分析所用菌株
1.1.3 VITEK MS全自动快速微生物质谱检测系统校准菌株
1.1.4 实验质控菌株
1.2 主要试剂配制方法
1.2.1 菌株保存培养基
1.2.2 70%甲酸溶液
1.2.3 标准溶剂
1.2.4 HCCA溶液
1.3 主要试剂
1.4 主要仪器
第二部分 MALDI-TOF MS用于鉴定常见细菌能力的研究
2.1 实验设计及技术路线
2.2 VITEK2鉴定分析
2.2.1 主要操作步骤
2.2.2 实验结果
2.3 MALDI-TOF MS鉴定分析
2.3.1 主要操作步骤
2.3.2 实验结果
2.4 16S rRNA基因分析方法对15株不一致菌株的鉴定分析
2.4.1 主要操作步骤
2.4.2 实验结果
2.5 讨论
第三部分 MALDI-TOF MS对CRKP同源性分析能力的研究
3.1 实验设计及技术路线
3.2 改良Hodge实验(MHT)
3.2.1 主要步骤
3.3 多位点序列分型(MLST)
3.3.1 主要步骤
3.3.2 实验结果
3.4 MALDI-TOF MS同源性分析
3.4.1 主要操作步骤
3.4.2 95株CRKP鉴定得分
3.4.3 95株CRKP聚类分析结果
3.5 讨论
第四章 结论与展望
参考文献
附录A 同源性分析质谱靶板位点编号与样本编号对应表
附录B 95株CRKP MALDI-TOF MS鉴定得分详表
作者在学期间取得的学术成果
主要简历
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]2013-2017年医院感染现患率调查分析[J]. 余淑霞,许婷,马鸿云. 中华医院感染学杂志. 2018(08)
[2]2014-2017年某三级甲等综合医院医院感染现患率的变化趋势分析[J]. 李璐,索继江,高岩,谢丽君,刘伯伟,姚宏武,刘运喜. 中华医院感染学杂志. 2018(08)
[3]某医院2014年-2016年住院患者医院感染综合性监测[J]. 孟冬梅,田立芝,李冠华,王联群. 中华医院感染学杂志. 2018(06)
[4]重症监护病房院内获得性感染的临床分析[J]. 齐志丽,刘培,庄海舟,段美丽. 首都医科大学学报. 2018(01)
[5]社区及院内耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染的临床特征比较及耐药性分析[J]. 弓清梅,张延军,宋璐. 中国药物与临床. 2018(01)
[6]MALDI-TOF MS直接鉴定血培养阳性标本中的病原菌[J]. 方毅,张景皓,赵虎. 老年医学与保健. 2017(06)
[7]多重耐药鲍曼不动杆菌的临床流行特征[J]. 韩蕾,雷金娥,祁杰,徐纪茹,韩少山. 西安交通大学学报(医学版). 2017(06)
[8]2016年中国CHINET细菌耐药性监测[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪复,蒋晓飞,徐英春,张小江,张朝霞,季萍,谢轶,康梅,王传清,王爱敏,徐元宏,沈继录,孙自镛,陈中举,倪语星,孙景勇,褚云卓,田素飞,胡志东,李金,俞云松,林洁,单斌,杜艳,郭素芳,魏莲花,邹凤梅,张泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,苏丹虹,汪瑞忠,房华,俞碧霞,赵勇,龚萍,郭大文,赵金英,刘文恩,李艳明,金炎,邵春红,温开镇,张贻荣,徐雪松,鄢超,喻华,黄湘宁,王山梅,楚亚菲,张利侠,马娟,周树平,周艳,朱镭,孟晋华. 中国感染与化疗杂志. 2017(05)
[9]3种鉴定系统在微生物室间质量评价中的应用和比较[J]. 陈蓉,居颺,刘战民. 检验医学. 2017(05)
[10]耐药性细菌碳青霉烯酶检测方法研究进展[J]. 徐建民,陈水平,陈建魁. 标记免疫分析与临床. 2017(03)
硕士论文
[1]耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性及同源性研究[D]. 谢思.南方医科大学 2017
本文编号:3200122
本文链接:https://www.wllwen.com/linchuangyixuelunwen/3200122.html
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