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河北省结核分枝杆菌临床分离株二线抗结核药物耐药特征及相关基因分析

发布时间:2021-05-24 05:15
  目的 调查河北省结核分枝杆菌二线抗结核药物耐药表型及耐药相关基因突变分布特征,分析耐二线抗结核药物菌株基因分型特点,探讨耐二线抗结核药物菌株表型、耐药相关基因突变及基因分型三者之间的关系,为了解结核病的流行趋势、制定预防控制措施、快速诊断耐药结核病、优化抗结核治疗方案等提供科学依据。方法 对2014年112月在河北省收集的316株耐药结核分枝杆菌(指至少对异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素中的一种抗结核药物耐药)和100株泛敏感结核分枝杆菌进行传代复苏,将成功复苏的菌株通过比例法罗氏固体药敏试验对氟喹诺酮类药物(氧氟沙星、左氧氟沙星)和二线注射类药物(卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星)等共5种二线抗结核药物进行药物敏感性试验检测。运用一代DNA测序技术对二线抗结核药物耐药相关基因gyrA、gyrB、rrs、eis启动子区、tlyA进行序列分析。采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术和分枝杆菌散在重复单位-数目可变串联重复序列(Mycobacterial interspersed repetitive units-variable number tand... 

【文章来源】:华北理工大学河北省

【文章页数】:69 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
abstract
英文缩略表
引言
第1章 结核分枝杆菌临床分离株对二线抗结核药物耐药表型分析
    1.1 材料与方法
        1.1.1 主要材料
        1.1.2 菌株筛选
        1.1.3 菌株传代复苏
        1.1.4 比例法药物敏感性试验
        1.1.5 本文中所涉及的相关定义
        1.1.6 数据管理与统计分析
    1.2 结果
        1.2.1 菌株传代复苏结果
        1.2.2 纳入本研究结核病患者一般情况
        1.2.3 五种二线抗结核药物(OFX、LVX、KAN、AMK和 CAP)菌株耐药表型特征
        1.2.4 五种二线抗结核药物(OFX、LVX、KAN、AMK和 CAP)菌株交叉耐药特征
        1.2.5 初治与复治结核患者二线抗结核药物耐药特征分析
        1.2.6 二线抗结核药物菌株耐药表型与MDR-TB、Pre-XDR-TB及XDR-TB之间关联性分析
    1.3 讨论
    1.4 小结
    参考文献
第2章 结核分枝杆菌临床分离株对二线抗结核药物耐药相关基因分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 主要材料
        2.1.2 菌株来源
        2.1.3 基因组DNA提取
        2.1.4 引物设计与合成
        2.1.5 PCR反应条件
        2.1.6 琼脂糖凝胶电泳
        2.1.7 DNA测序与序列比对
        2.1.8 基因分型
        2.1.9 主要生物信息分析工具
        2.1.10 统计分析与计算公式
    2.2 结果
        2.2.1 耐FQs菌株与gyrA、gyrB基因突变
        2.2.2 耐SLIDs菌株与rrs、eis启动子区、tlyA基因突变
        2.2.3 表型耐药与基因型耐药的关系分析
        2.2.4 DNA测序技术在预测耐二线抗结核菌株表型耐药的诊断价值
        2.2.5 五种二线抗结核药物耐药率、耐药相关基因突变率与北京基因型的关系
        2.2.6 耐二线抗结核药物菌株和XDR菌株的传播模式分析
    2.3 讨论
    2.4 小结
    参考文献
第3章 综述 结核分枝杆菌原发性和获得性耐药机制及诊断方法新进展
    3.1 结核分枝杆菌耐药机制
        3.1.1 原发性耐药机制
        3.1.2 获得性耐药机制
    3.2 结核分枝杆菌耐药性诊断方法
        3.1.1 表型试验
        3.1.2 Xpert MTB/RIF
        3.1.3 线性探针试验(LPAs)
        3.1.4 测序技术
    3.3 结语
    参考文献
结论
附录A 二线抗结核药物耐药相关基因特征性测序结果
致谢
导师简介
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作者简介
学位论文数据集


【参考文献】:
期刊论文
[1]结核分枝杆菌耐异烟肼突变基因及分子检测方法研究进展[J]. 李芊璘,冯福民,戴二黑.  天津医药. 2017(12)
[2]重庆市耐多药结核分枝杆菌gyrA与rrs基因突变特征分析[J]. 胡彦,杨春,逄宇,卢楠,刘洁,沈静,朱大冕,冯鑫.  中国人兽共患病学报. 2016(11)
[3]安徽省420株结核分枝杆菌对一线和二线抗结核药物药敏结果分析[J]. 徐东芳,王庆,李孳,李东方.  中国人兽共患病学报. 2014(01)
[4]部分抗结核分枝杆菌药物的耐药机理研究进展[J]. 丁海榕,秦川,占玲俊.  中国防痨杂志. 2013(08)
[5]结核分枝杆菌耐氨基糖苷类和多肽类抗结核药物分子机制的研究进展[J]. 宋艳华,高孟秋.  中华结核和呼吸杂志. 2012 (07)
[6]2009年上海市耐药肺结核患者二线抗结核药物耐药状况调查[J]. 沈鑫,李静,高谦,徐飚,梅建.  中华结核和呼吸杂志. 2011 (06)
[7]2004~2007年山东省部分结核分枝杆菌耐药情况检测分析[J]. 王海英,王燕,于春宝,左云,王俊玲,刘志敏.  预防医学论坛. 2008(12)
[8]中日合作对河南省结核菌二线药物耐药监测研究[J]. 张国龙,杜长梅,苍泽卓也,池田雄史,王伟,石瑞如.  医药论坛杂志. 2005(19)



本文编号:3203618

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