人体肠道可培养细菌的初步探索及一株肠道细菌新种的分类鉴定

发布时间：2021-11-04 06:14

　　背景:人体肠道微生物与宿主的健康和疾病状态息息相关,近年来高通量测序和组学技术的发展将人们对肠道菌群的认知和理解引领到一个新的高度。但同时,分离获得更多的肠道细菌纯培养物的局限性和重要性也日益彰显。一方面,由于肠道菌群的高度多样性和复杂性以及传统培养方法的限制,目前得到的肠道细菌种类仅占肠道细菌总量的极少数,且多数细菌的功能是未知的;另一方面,获得更多的细菌纯培养物并确定其分类和功能,是人体微生物组研究的物质基础,对解析肠道菌群与宿主共生的机制具有重要意义。目的:1、分析不同培养条件下的菌群特征及肠道可培养细菌的初步探索;2、对分离得到的可疑新菌种用多相分类学方法进行鉴定,确定其系统发育学地位;3、对分类错误的[Clostridium]hiranonis进行重新分类,完善微生物分类学系统。方法及结果:本研究第一部分首先通过对不同培养条件下菌群数据的分析,说明不同培养条件对体外培养肠道菌群多样性及结构的影响;其次利用多重培养条件以及质谱和16S rRNA基因测序等多种鉴定手段,从人体粪便样本中分离培养出185种不同的肠道细菌。这些细菌分别来自厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：107 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１肠道细菌分离培养的基本流程??Ｆｉｇ．?２－１?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｆｏｒ?ｉｓｏｌａｔｉｏｎ?ａｎｄ?ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ?ｂａｃｔｅｒｉａ??

＿ｔｒｅｅ?和?Ｓｈａｎｎｏｎ?四??个指数均显示个体Ｃ的ａ多样性明显高于个体Ａ和个体Ｂ的ｃｉ多样性（图２－３）；??且３个个体的３多样中基于Ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄ＋ｕｎｉｆｒａｃ的ＰＣｏＡ图显示个体间菌群有??显著差异（图２－４）。这提示，个体来源不同的样本在不同条件下培养后的菌群??仍存在个体差异。因此后续分析不同培养条件的肠道菌群特征时将Ａ、Ｂ、Ｃ?３个??个体的样品分开分析。??ｐｖａｌｕｅ?＜０．００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０?００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０?００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０．００１??｜?）?Ｋ〇ｉ?２２￡ｆ?１?Ｉ?????４００??Ａ?Ｂ?Ｃ?ＡＢＣ?ＡＢＣ?Ｂ?￣Ｃ??图２－３来源不同个体的培养样品的ａ多样性比较??Ｆｉｇ．２－３?Ｃｏｍｐａｒｉｓｉｏｎ?ｏｆ?ａ－ｄｉｖｅｒｓｉｔ＼；?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｒｏｍ?ｄｉｆｌｅｒｅｎｌ?ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓ??注：Ａ、Ｂ、Ｃ分别表示来源三个不同个体的样品??１９??

从基于Ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄ＋ｕｎｉｆｒａｃ距离的ＰＣｏＡ图（图２－６）可以看出，来源于同??一个体的样品，经过不同培养基培养后的菌群结构存在显著差异。筛选相对丰??度＞１％的细菌构建菌群结构堆积图（图２－７），可以看出，来源于同一个体的样品??在不同培养基中培养后的菌群结构不同，其中在缺乏碳源、氮源的营养缺乏的??ＰＢＳ和Ｓａｌｉｎｅ中，二者培养后的菌群组成结构和各种细菌的相对比例较相似，??区分于其中四种培养基。??Ａ?＾?￥＝５?Ｂ?．?．￥０：４６?ｃ?￥?＝??？?．．．??？?＇?？?？?３」??＿＿，＿＿，?，＿＿，＿

【参考文献】：
期刊论文
[1]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy.  World Journal of Gastroenterology. 2015(29)



本文编号：3475160