不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析

发布时间：2022-12-04 02:05

　　目的:分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法:将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库,利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析,并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果:肺泡灌洗液病毒群落组成中,指环病毒科占主体地位（19.4%）,其次为圆环病毒科（11.0%）,藻去氧核糖核酸病毒科（11.0%）,人类内源性递转录病毒科（10.2%）,痘病毒科（4.9%）,逆转录病毒科（3.2%）,帚状病毒科（2.3%）,小RNA病毒科（0.6%）;并发现了4株序列较长的细环病毒,根据细环病毒开放阅读框1进行系统进化分析,显示其与已知的细环病毒在核酸水平上有一定的差异。通过对细环病毒及鼻病毒阳性样本的筛选,发现细环病毒阳性率为11.3%,鼻病毒阳性率为10.0%。结论:应用病毒宏基因组学技术成功解析出不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落组成,病毒群落中指环病毒科占比最高,其中细环病毒因发热导致的炎性环境以及患者免疫力低下而大量增殖。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 肺泡灌洗液样本的采集
    1.2 病毒宏基因组文库构建及深度测序
        1.2.1 高通量文库的构建[4-5]
        1.2.2 文库的扩增、纯化与测序
        1.2.3 文库测序结果的生物信息学分析
    1.3 病毒基因组扩增及阳性样本筛选
        1.3.1 肺泡灌洗液中病毒核酸的提取
        1.3.2 PCR引物设计及扩增测序
2 结果
    2.1 肺泡灌洗液文库中病毒群落组成
    2.2 细环病毒阳性样本筛选结果及系统进化分析
    2.3 鼻病毒阳性样本筛选结果
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]人兽共患痘病毒病流行现状及其宿主谱研究进展[J]. 周涛,贾怀杰,何小兵,房永祥,景志忠.  中国人兽共患病学报. 2012(02)
[2]中西医结合治疗小儿流感病毒性肺炎临床疗效观察[J]. 张桂菊,赵红梅,吴金勇,袭雷鸣,张葆青.  山东医药. 2015(05)
[3]病毒宏基因组学方法鉴定出小熊猫粪便中一株新型指环状病毒[J]. 郭靓骅,吴孔菊,华修国,崔立,张文,齐敦武.  上海交通大学学报(农业科学版). 2018(01)
[4]不明原因发热流行病学及临床特征分析[J]. 嵇玮嘉,颜学兵.  中华医院感染学杂志. 2019(24)

硕士论文
[1]鼠肠道病毒宏基因组学研究[D]. 李旺.江苏大学 2016



本文编号：3707403