番茄褪绿病毒RT-PCR检测方法的优化及环保酵素对番茄褪绿病毒病抗性影响的研究
【学位单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:S436.412.11
【部分图文】:
图 1-1 ToCV RNA1/2 基因组结构示意图Figure. 1-1 Schematic representation of the genomic structure of the RNA 1/2 of ToCVRNA 2 长8244 nt,编码9个开放阅读框,蛋白功能主要包括病毒的组装、运动以及传播。ORF 1,即p4,编码一个分子量为3.9 KDa,起跨膜蛋白功能并且富含疏水残基的小蛋白质。ORF 2,即Hsp70h,编码59 KDa的蛋白质,该蛋白高度保守,与病毒的组装和运动有关。ORF 3,即p8,编码7.6 KDa的蛋白质,该区域发现具有与毛形病毒属的其他成员相似大小的基因,相同的基因组位置和序列以及中心保守的氨基酸序列。ORF 4,即p59,编码59.4 KDa的蛋白质,这些蛋白质是病毒在细胞与细胞之间运动和组装必不可少的。ORF 5,即p9,编码9.3 kDa蛋白质,具有与毛形病毒属其他成员等同的蛋白质编码位置,且具有35-45%相似的氨基酸。ORF 6,即CP,编码28.9 kDa的高度保守蛋白质。ORF 7,即CPm,编码76.0 kDa蛋白质,具有与病毒传播有关的功能。ORF 8,即p27,编码27.0 kDa的蛋白质,具有与同属其他成员相似大小和基因组位置的蛋白质,但它们之间的氨基酸相似性相对较低。ORF 9,即p7,编码一个小的7.5kDa蛋白质,具有富含疏水残基的跨膜结构域,但没有与任何已知蛋白质具有相似性,并且在其他毛形病毒属的成员基因组中也没有等同物(G. Lozano et al. 2006)。
图 3-3 To-CP-F/R-1 和 SDLC-HSP-F/R 最适引物浓度筛选(Marker:Trans5K Plus DNAmarker;A:表示引物 To-CP-F/R-1;B:表示引物 SDLC-HSP-F/R;1~10:依次表示引物浓度分别为 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10 μM。)Figure 3-3 Screening primer concentrations on PCR detection of To-CP-F/R-1 and SDLC-HSP-F/R(Marker: Trans5K Plus DNAmarker; A: indicates primer To-CP-F/R-1; B: indicates primerSDLC-HSP-F/R; 1~10: Primer concentrations is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 μM , respectively .)
第三章 结果与分析μM 时,引物 To-CP-F/R-1 的退火温度在 48.0~64.0℃范围内扩增效果最佳(图 3-4),引物 SDLC-HSP-F/R 的退火温度最适范围是 40.9~64.3℃。高于、低于这个温度范围均影响扩增效率。图 3-3 To-CP-F/R-1 和 SDLC-HSP-F/R 最适引物浓度筛选(Marker:Trans5K Plus DNAmarker;A:表示引物 To-CP-F/R-1;B:表示引物 SDLC-HSP-F/R;1~10:依次表示引物浓度分别为 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10 μM。)Figure 3-3 Screening primer concentrations on PCR detection of To-CP-F/R-1 and SDLC-HSP-F/R(Marker: Trans5K Plus DNAmarker; A: indicates primer To-CP-F/R-1; B: indicates primerSDLC-HSP-F/R; 1~10: Primer concentrations is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 μM , respectively .)
【相似文献】
相关期刊论文 前10条
1 李艳;姜俊;赵红星;王勇;;番茄褪绿病毒病研究进展[J];农业科技通讯;2017年05期
2 吴韵雅;杨葳;刘敏敏;杨硕;欧阳波;;山东寿光蔬菜种业集团示范园部分番茄品种褪绿病毒感染分析[J];长江蔬菜;2017年02期
3 ;番茄褪绿病毒病怎么治[J];农业知识;2015年02期
4 黄红霞;;番茄褪绿病毒研究进展[J];南方农业;2018年06期
5 王子崇;杨红丽;;番茄褪绿病毒病的发生与防治[J];长江蔬菜;2015年15期
6 王志荣;王孝宣;杜永臣;高建昌;国艳梅;黄泽军;;番茄褪绿病毒病研究进展[J];园艺学报;2016年09期
7 赵汝娜;王蓉;师迎春;张桂娟;原锴;范在丰;周涛;;侵染甜椒的番茄褪绿病毒的分子鉴定[J];植物保护;2014年01期
8 刘珊珊;彭斌;吴会杰;柳唐镜;孔祥义;施艳;古勤生;;海南省和河南省发生甜瓜褪绿黄化病的分子鉴定[J];果树学报;2013年02期
9 周涛;杨普云;赵汝娜;师迎春;原锴;范在丰;;警惕番茄褪绿病毒在我国的传播和危害[J];植物保护;2014年05期
10 魏家鹏;;日光温室番茄褪绿病毒病综合防控技术[J];农村百事通;2017年07期
相关硕士学位论文 前7条
1 马瑞丽;番茄褪绿病毒RT-PCR检测方法的优化及环保酵素对番茄褪绿病毒病抗性影响的研究[D];西北农林科技大学;2019年
2 刘雪雪;黄瓜果皮褪绿进程与商品果货架品质和种子发育的关系[D];西北农林科技大学;2018年
3 袁梓洢;光照改善乙烯褪绿蜜橘果实着色效果的机理研究[D];西南大学;2017年
4 高利利;番茄褪绿病毒的分子鉴定及荧光定量PCR检测体系的建立与应用[D];山东农业大学;2016年
5 王毅;龙里烟叶黄化褪绿研究[D];湖南农业大学;2014年
6 刘华珍;侵染梨的一种新的Emaravirus属病毒鉴定及特性研究[D];华中农业大学;2017年
7 冯佳;番茄褪绿病毒RT-PCR检测方法的优化应用及肥城桃2种病毒的鉴定[D];山东农业大学;2016年
本文编号:2859709
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/2859709.html