产酶溶杆菌OH11中第二信使c-di-GMP调控抗菌物质HSAF生物合成的信号通路研究
发布时间：2021-02-23 11:17
溶杆菌属由Christensen和Cook于1978年建立新属,属于黄单胞科,γ-变形菌门。该属细菌具有基因组DNAG+C%含量高、无鞭毛、产生多种次生代谢抗菌物质等特点,且在自然环境中广泛存在。近年来,随着越来越多的抗菌活性物质从溶杆菌中被分离鉴定出来,溶杆菌作为新型抗生素的重要来源逐渐引起科研工作者的广泛重视。产酶溶杆菌OH11分离自辣椒根际土壤,对多种病原真菌、卵菌、细菌具有良好的拮抗作用。HSAF（Heat Stable Anti-fungal Factor）是分离自产酶溶杆菌OH11中的热稳定性抗真菌因子,能够通过干扰丝状真菌鞘脂合成从而抑制靶标真菌的生长。HSAF的生物合成基因簇也已被报道,它由一个杂合的PKS/NRPS负责合成。随着OH11全基因组测序的完成,产酶溶杆菌成为溶杆菌中被研究的最为深入的一个种。环二鸟苷酸c-di-GMP广泛存在于细菌中,被归为第二信使的一种,能够调控细菌一系列重要的生理生化功能,如胞外多糖合成、生物膜形成、运动性和致病性等。c-di-GMP在细菌体内由含有GGDEF/GGEEF结构域的鸟苷酸环化酶（diguanylate cyclase,DG...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：138 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1 溶杆菌简介
1.1 溶杆菌的分类及特征
1.2 溶杆菌的次级代谢抗菌产物
2 环二鸟苷酸c-di-GMP简介
2.1 c-di-GMP的发现
2.2 c-di-GMP的合成与代谢
2.3 c-di-GMP的受体
2.4 c-di-GMP调控次级代谢产物合成的研究进展
3 展望
4 本研究的目的与意义
第二章 产酶溶杆菌OH11中与HSAF生物合成相关的c-di-GMP代谢酶的鉴定
1 材料方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 c-di-GMP参与HSAF生物合成调控
2.2 产酶溶杆菌OH11中含有26个c-di-GMP代谢蛋白
2.3 19个c-di-GMP代谢蛋白参与调控了HSAF的产量
3 小结与讨论
第三章 c-di-GMP信号通路调控HSAF生物合成机制研究
1 材料方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 LchP特异性调控HSAF的生物合成
2.2 LchP通过其PDE活性正向调控HSAF的生物合成
2.3 c-di-GMP合成蛋白LchD与LchP协同调控HSAF生物合成
2.4 转录因子Clp位于LchP信号通路下游调控HSAF生物合成
2.5 Clp通过与LchP互作促进其PDE酶活
2.6 c-di-GMP浓度影响Clp与HSAF合成基因启动子的结合
2.7 转录因子Clp位于DSF-c-di-GMP信号通路下游调控HSAF生物合成
3 小结和讨论
第四章 全文总结
1 总结
2 论文创新点
3 展望
3.1 这个信号通路对HSAF的调控是特异性的吗?
3.2 c-di-GMP降解酶LchP、合成酶LchD以及受体Clp互作的生物学意义是什么?
3.3 为什么Clp蛋白位于两套c-di-GMP信号系统下游调控HSAF生物合成?
3.4 为什么LchP在大肠杆菌中表现DGC活性而在产酶溶杆菌中表现PDE活性?
3.5 c-di-GMP信号参与调控抗生素合成的意义在哪里?
参考文献
附录一 缩写说明
附录二 附图
附录三 RpfF与Clp共同调控基因
附录四 溶液配制
致谢
攻读学位期间发表的学术论文目录
【参考文献】：
期刊论文
[1]产酶溶杆菌OH11代谢产物HSAF对梨树腐烂病的防治效果[J]. 程超,赵延存,李红旭,何锋,曹素芳,杨晓蕾,钱国良,刘凤权. 中国生物防治学报. 2017(01)
博士论文
[1]抗生素溶杆菌中吩嗪类物质的鉴定及其生物合成机制研究[D]. 赵杨扬.南京农业大学 2016
[2]产酶溶杆菌转录因子LeClp调控几丁质酶和次级代谢产物生物合成的机制研究[D]. 徐会永.南京农业大学 2016
硕士论文
[1]产酶溶杆菌第二信使c-di-GMP代谢相关蛋白的酶活检测及其功能研究[D]. 霍翠梅.南京农业大学 2016
[2]一种新型生防菌菌株OH11的鉴定和生防效果研究[D]. 姜英华.南京农业大学 2006
本文编号：3047500
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：138 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1 溶杆菌简介
1.1 溶杆菌的分类及特征
1.2 溶杆菌的次级代谢抗菌产物
2 环二鸟苷酸c-di-GMP简介
2.1 c-di-GMP的发现
2.2 c-di-GMP的合成与代谢
2.3 c-di-GMP的受体
2.4 c-di-GMP调控次级代谢产物合成的研究进展
3 展望
4 本研究的目的与意义
第二章 产酶溶杆菌OH11中与HSAF生物合成相关的c-di-GMP代谢酶的鉴定
1 材料方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 c-di-GMP参与HSAF生物合成调控
2.2 产酶溶杆菌OH11中含有26个c-di-GMP代谢蛋白
2.3 19个c-di-GMP代谢蛋白参与调控了HSAF的产量
3 小结与讨论
第三章 c-di-GMP信号通路调控HSAF生物合成机制研究
1 材料方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 LchP特异性调控HSAF的生物合成
2.2 LchP通过其PDE活性正向调控HSAF的生物合成
2.3 c-di-GMP合成蛋白LchD与LchP协同调控HSAF生物合成
2.4 转录因子Clp位于LchP信号通路下游调控HSAF生物合成
2.5 Clp通过与LchP互作促进其PDE酶活
2.6 c-di-GMP浓度影响Clp与HSAF合成基因启动子的结合
2.7 转录因子Clp位于DSF-c-di-GMP信号通路下游调控HSAF生物合成
3 小结和讨论
第四章 全文总结
1 总结
2 论文创新点
3 展望
3.1 这个信号通路对HSAF的调控是特异性的吗?
3.2 c-di-GMP降解酶LchP、合成酶LchD以及受体Clp互作的生物学意义是什么?
3.3 为什么Clp蛋白位于两套c-di-GMP信号系统下游调控HSAF生物合成?
3.4 为什么LchP在大肠杆菌中表现DGC活性而在产酶溶杆菌中表现PDE活性?
3.5 c-di-GMP信号参与调控抗生素合成的意义在哪里?
参考文献
附录一 缩写说明
附录二 附图
附录三 RpfF与Clp共同调控基因
附录四 溶液配制
致谢
攻读学位期间发表的学术论文目录
【参考文献】：
期刊论文
[1]产酶溶杆菌OH11代谢产物HSAF对梨树腐烂病的防治效果[J]. 程超,赵延存,李红旭,何锋,曹素芳,杨晓蕾,钱国良,刘凤权. 中国生物防治学报. 2017(01)
博士论文
[1]抗生素溶杆菌中吩嗪类物质的鉴定及其生物合成机制研究[D]. 赵杨扬.南京农业大学 2016
[2]产酶溶杆菌转录因子LeClp调控几丁质酶和次级代谢产物生物合成的机制研究[D]. 徐会永.南京农业大学 2016
硕士论文
[1]产酶溶杆菌第二信使c-di-GMP代谢相关蛋白的酶活检测及其功能研究[D]. 霍翠梅.南京农业大学 2016
[2]一种新型生防菌菌株OH11的鉴定和生防效果研究[D]. 姜英华.南京农业大学 2006
本文编号：3047500
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