维系圈养北极狐（Vulpes lagopus）有限种群遗传多样性的管理策略
发布时间：2021-02-23 21:47
为避免我国有限北极狐种群遗传多样性的流失,推动我国圈养小种群的遗传管理工作,本研究将利用微卫星分子标记,以北极狐为例,根据后代遗传质量的预测判定最佳的配对方案,为圈养小种群遗传多样性保护工作提供参考。此外,虽然微卫星标记在近缘物种间具有一定通用性,可被跨物种使用,但测试其多态性的过程非常繁琐。本研究亦将采用混合模板扩增的方法,快速简便地测试微卫星位点的多态性,为开展群体遗传学分析获得有用的微卫星标记。主要结果如下:1.用10个四碱基微卫星位点的引物,以10只北极狐的DNA为材料,分别随机抽取2个、3个、5个、8个和全部10个样品进行等量混合作为模板,扩增产物用全自动测序仪进行电泳分型。所有等位基因的电泳信号峰都清晰可辨。与单一模板扩增相比,混合模板扩增时,所有位点的复等位基因都能稳定地显示出来,不同批次试验之间的重现性达到100%。信号峰面积与等位基因频率呈线性正相关,由此可以推断待测位点的基因频率分布情况。最高信号峰与最低信号峰的面积的比值与混合样品数呈正相关,与多态信息含量呈负相关,提示混合样品的数量存在一定限度,到一定限度时低频等位基因无法检出。同时,通过这一关系,也可以推测位点...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
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【参考文献】：
期刊论文
[1]毛皮动物选育及生产性能遗传参数研究进展[J]. 张志明,刘宗岳,丛波,刘琳玲,宋兴超,杨福合. 特产研究. 2016(02)
[2]Simultaneous polyandry and heteropaternity in tiger（Panthera tigris altaica）:Implications for conservation of genetic diversity in captive populations of felids[J]. LIU Dan,MA Yue,LI HuiYi,XU YanChun,ZHANG Yan,DAHMER Thomas,BAI SuYing,WANG Jian. Chinese Science Bulletin. 2013(18)
[3]北极狐人工授精的优点和注意事项[J]. 闫大任. 畜牧与饲料科学. 2013(01)
[4]微卫星DNA标记在蓝狐单亲亲权鉴定中的应用[J]. 白玉妍,刘思宇,唐澜,贾竞波,刘志平. 经济动物学报. 2010(03)
[5]人工饲养蓝狐微卫星DNA的多态性[J]. 傅凯,白素英,金煜. 东北林业大学学报. 2010(02)
[6]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 中国水产科学. 2008(01)
[7]北极狐人工授精技术具体操作方法[J]. 朱丽艳,李建军,韩正田. 特种经济动植物. 2006(10)
[8]微卫星标记及其在家畜遗传育种中的应用[J]. 张自富,昝林森. 中国牛业科学. 2006(04)
[9]微卫星位点筛选方法综述[J]. 曾庆国,陈艺燕. 生态科学. 2005(04)
[10]影响毛细管电泳分析结果重现性的因素及其控制[J]. 郭怀忠,毕开顺,孙毓庆. 分析仪器. 2005(02)
博士论文
[1]中国普氏野马保护遗传学研究及保护对策[D]. 刘刚.北京林业大学 2014
[2]朱鹮（Nipponia nippon）分子遗传多样性研究[D]. 和雪莲.北京林业大学 2013
[3]浙江扬子鳄迁地保护种群的谱系构建和放归野外奠基种群的筛选[D]. 倪小伟.浙江大学 2012
[4]分子标记应用于文蛤遗传评价、图谱构建及QTL筛选的研究[D]. 卢霞.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
[5]应用微卫星DNA标记进行蓝狐（Alopex lagopus）亲权鉴定和分子遗传多样性研究[D]. 白玉妍.东北林业大学 2009
[6]群体遗传变异的信息学模型研究[D]. 郭满才.西北农林科技大学 2002
硕士论文
[1]蓝狐粪便中皮质醇激素和IgA水平的研究[D]. 喻月婷.东北林业大学 2018
[2]基于微卫星标记的紫貂亚种遗传结构分析[D]. 蔡莹莹.东北林业大学 2018
[3]秦岭金丝猴（Rhinopithecus roxellana）基因组微卫星位点的筛选及亲子鉴定[D]. 段燕梅.西北大学 2017
[4]紫貂微卫星位点的开发及群体遗传分析[D]. 朱万超.曲阜师范大学 2017
[5]东方蜜蜂（Apis cerana）全基因组微卫星的鉴定及其分子标记的筛选[D]. 刘璐.重庆师范大学 2016
[6]圈养斑嘴环企鹅的种群遗传管理[D]. 耿广耀.东北林业大学 2015
[7]北部湾二长棘鲷种群衰退的遗传学分析[D]. 杨兵.上海海洋大学 2015
[8]大熊猫（Ailuropoda melanoleuca）线粒体基因组研究及圈养种群遗传多样性分析[D]. 杨波.四川农业大学 2013
[9]黔金丝猴和圈养黑叶猴保护遗传学研究[D]. 史芳磊.北京林业大学 2013
[10]基于微卫星的亚洲黑熊个体识别技术研究[D]. 张小芳.东北林业大学 2011
本文编号：3048286
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图３－］部分样本的总ＤＮＡ提取电泳图??Ｍ：分子量标记（ＤＬ５０００?Ｍａｒｋｅｒ）??
?东北林业大学硕士学位论文???３．２．２信号峰面积随基因频率的变化趋势??为了确定信号峰面积与基因频率的关系，根据２２０６、２１４０、２１６８三个位点的４组??混合扩增产物（不包括ＭＴ１０扩增产物）中各等位基因的基因频率和信号峰面积，做二??者的回归分析。结果显示，信号峰面积与基因频率呈线性关系（图３－６），也就是说，在??］〇个样品以内，不同混合样品中等位基因的频率影响着扩增产物的量，即频率较高的等??位基因因有效模板数较多，可以表现为较大的信号峰面积，根据等位基因信号峰的面积??粗略地估算等位基因的频率。但是，２２０６、２］４０、２１６８三个位点的Ｒ２值分别为０．５５９、??０．６８５、０．３３０，且Ｐ值均等于０．０００，说明不同的位点因为扩增效率的差异，回归方程的??参数也有所不同，如果把三个位点的数据合并起来，这种关系就变得非常微弱??（Ｒ２＝０．２８０，?Ｐ＝０．０００），即等位基因频率的估算很难建立通用的模型。??１６０００??＊?２２０６??１－４０００?ｉ?＃?？??？?＊１１４０??１２０００?：?？?？?．：１６Ｓ??ｒｅ?＊?■．??＾?Ｉ?１００００?＃?＃?＊??）ｇ?＾?？?Ｘ’?？??＾?１?８０００?－Ｉ?＃?，?＼?．??＾?？?｜?？?’?匿?？?＊??５２?５，?＜５０００?１＊１??５５?＃?Ｉ?：，?！?＊?＿??４０００?＾?ｆ?？?＊?＊??！?．?？?＊?ｒ?．?？??０?０．２?０．４?０?６?０?８?１??基因频率??Ａｌｌｄｅｆｉｅｃｐｅｎｃ＼－??图３－６三个位点四组混合模板扩增产物
？?？?２１－１０??Ｓ?？??？?１２０００?．?？２１６８??Ｓ．?１００００?Ｊ?？??＾?２?？、乂??妒?３，?ｓｏｏｏ?？?＇?？?？??１５?｜??姬；ｉ?６０００?？?？??＿?１．?Ｉ－－、．？．?？??＂５?４０００?？?？?？??Ｐ?，》?５??２０００?｜?ｌ?Ｉ???〇－?．?．??０?２?－Ｉ?６?Ｓ?１０??混合模板数??Ｎｍｎｂｅｉ?ｏｆ?ｕｉＬＸｅｄ?．ｓａｍｐｌｅｓ：??图３－７三个位点四组混合模板扩增产物的最高信号峰面积与混合模板数的关系??三个位点都显示线性回归关系（２２０６：?Ｒ２＝０．２２８，?Ｐ＝０．０１８：?２１４０：?Ｒ２＝０．２１２，?Ｐ＝０．０２４：?２】６８：??Ｒ２＝０．０２０，?Ｐ＝０．５２０）??Ｆｉｇ．?３－７?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ?ｓｉｇｎａｌ?ｐｅａｋ?ａｒｅａ?ａｎｄ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｏｆ?ｆｏｕｒ?ｇｒｏｕｐｓ??ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｔｅｍｐｌａｔｅ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｎ?ｔｈｒｅｅ?ｌｏｃｉ??Ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ?ｓｉｇｎａｌ?ｐｅａｋ?ａｒｅａｓ?ａｒｅ?ｌｉｎｅａｒｌｙ?ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ?ｗｉｔｈ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｔｈｅ?ｔｈｒｅｅ?ｌｏｃｉ??（２２０６：?Ｒ：＝０．２２８．?Ｐ＝０．０１８；?２１４０：?Ｒ２＝０．２１２，?Ｐ＝０．０２４；?２１６８：?Ｒ２＝０．０２０，?Ｐ＝０．５２０）??３．２．３．２最高峰与最低峰的面积
【参考文献】：
期刊论文
[1]毛皮动物选育及生产性能遗传参数研究进展[J]. 张志明,刘宗岳,丛波,刘琳玲,宋兴超,杨福合. 特产研究. 2016(02)
[2]Simultaneous polyandry and heteropaternity in tiger（Panthera tigris altaica）:Implications for conservation of genetic diversity in captive populations of felids[J]. LIU Dan,MA Yue,LI HuiYi,XU YanChun,ZHANG Yan,DAHMER Thomas,BAI SuYing,WANG Jian. Chinese Science Bulletin. 2013(18)
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[9]微卫星位点筛选方法综述[J]. 曾庆国,陈艺燕. 生态科学. 2005(04)
[10]影响毛细管电泳分析结果重现性的因素及其控制[J]. 郭怀忠,毕开顺,孙毓庆. 分析仪器. 2005(02)
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[1]中国普氏野马保护遗传学研究及保护对策[D]. 刘刚.北京林业大学 2014
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[3]浙江扬子鳄迁地保护种群的谱系构建和放归野外奠基种群的筛选[D]. 倪小伟.浙江大学 2012
[4]分子标记应用于文蛤遗传评价、图谱构建及QTL筛选的研究[D]. 卢霞.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
[5]应用微卫星DNA标记进行蓝狐（Alopex lagopus）亲权鉴定和分子遗传多样性研究[D]. 白玉妍.东北林业大学 2009
[6]群体遗传变异的信息学模型研究[D]. 郭满才.西北农林科技大学 2002
硕士论文
[1]蓝狐粪便中皮质醇激素和IgA水平的研究[D]. 喻月婷.东北林业大学 2018
[2]基于微卫星标记的紫貂亚种遗传结构分析[D]. 蔡莹莹.东北林业大学 2018
[3]秦岭金丝猴（Rhinopithecus roxellana）基因组微卫星位点的筛选及亲子鉴定[D]. 段燕梅.西北大学 2017
[4]紫貂微卫星位点的开发及群体遗传分析[D]. 朱万超.曲阜师范大学 2017
[5]东方蜜蜂（Apis cerana）全基因组微卫星的鉴定及其分子标记的筛选[D]. 刘璐.重庆师范大学 2016
[6]圈养斑嘴环企鹅的种群遗传管理[D]. 耿广耀.东北林业大学 2015
[7]北部湾二长棘鲷种群衰退的遗传学分析[D]. 杨兵.上海海洋大学 2015
[8]大熊猫（Ailuropoda melanoleuca）线粒体基因组研究及圈养种群遗传多样性分析[D]. 杨波.四川农业大学 2013
[9]黔金丝猴和圈养黑叶猴保护遗传学研究[D]. 史芳磊.北京林业大学 2013
[10]基于微卫星的亚洲黑熊个体识别技术研究[D]. 张小芳.东北林业大学 2011
本文编号：3048286
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