绿僵菌新转录本及小泛素相关修饰基因功能的研究

发布时间：2021-03-10 13:24

　　绿僵菌在害虫生物防治中起重要作用,也已经广泛应用于蝗虫等的防治。罗伯茨绿僵菌（Metarhizium robertsii,下称绿僵菌）作为昆虫病原真菌的模式生物,在昆虫病原真菌的代谢调控,致病机理,遗传调节机制和生物技术防治研究中起重大作用。多年来,国内外学者致力罗伯茨绿僵菌致病和抗逆的分子机理研究,取得了丰硕的结果;但是作为生防真菌,罗伯茨绿僵菌仍有很多的弱点,如:杀虫速度较慢,易被环境影响等,因此,限制了绿僵菌在生产上的大规模应用。转录组测序可以得到某一种特定组织或者细胞的将近全部转录本和基因序列通过利用二代测序平台,而今,也已广泛应用于真核生物,包括绿僵菌,但罗伯茨绿僵菌的转录组学研究内容较少;且通过利用RNA-Seq技术,可以解决特定的生物学问题,包括可变剪切分析,优化基因结构,新转录本鉴定以及发掘新基因等。为此,本研究以罗伯茨绿僵菌为研究对象,首先在4个不同条件下（包括生长发育、逆境胁迫、侵染定殖以及退化）,培养绿僵菌,提取其总RNA,并完成转录组测序;其次,就测序所得转录组数据进行生物信息学分析,对预测的新转录本,完成功能注释;最后,针对从注释的新转录本中筛选到小泛素相关修... 

【文章来源】：安徽农业大学安徽省

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

绿僵菌主要侵染阶段

2) 合适温片段，一次3) 对此 cD接头，在此4) 使用 Ag的 cDNA 文度条件下，次为模板，得DNA 进行纯此之后选择gilent 2100文库检验质在仪器 The得到一条单链纯化，粘性择不同长短的Bioanalyze质量，最后利ermomixer链的cDNA性末端的修复的片段，并er 和仪器 A利用 Illumi里添加适量A，利用碱基复以及在其并完成的 PCABI StepOnna HiSeqTM量打断试剂配对原理，其 3’末端添加CR 扩增。nePlus RealM2000 完成剂，用以得到合成为双链加 polyA 尾l-Time PCR成测序。到 m链c尾巴R 对

图 2-2 信息分析流程Figure 2-2 Information analysis process2.2.3.2新转录本预测及分析为了发现所供样品里的新转录本信息，我们便比对所提供样品里测得的转录本和参考基因组中已有的转录本。然而，预测得到的新转录本都满足以下几个条件：不仅要与现存的已注释基因之间有大于 200bp 的间距；而且其序列长度≥ 180bp 以及序列测定深度≥2。如图 2-3 为新转录本预测方法。

【参考文献】：
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本文编号：3074733