油菜附加系EE抗根结线虫的蛋白质组学初步研究
发布时间：2021-03-22 23:31
【目的】通过蛋白质组技术寻找抗线虫油菜附加系EE和感病油菜接种根结线虫后根系表达蛋白的差异,筛选出抗根结线虫相关蛋白。【方法】以抗根结线虫的油菜附加系EE和感根结线虫的油菜根系为材料,通过蛋白质组学双向电泳技术和Image Master 5.0软件分析筛选差异表达蛋白,经MALDI-TOF-TOF/MS质谱测序鉴定蛋白。另外,通过Gene Ontology, KEGG, WoLF PSORT和STRING生物信息学分析对鉴定蛋白进行功能分类、代谢途径分析、亚细胞定位和蛋白互作分析。【结果】Madora和油菜附加系EE分别有1184和1163个蛋白点。21个差异蛋白质经MALDI-TOF/TOF MS质谱测序成功鉴定,其中一半以上定位于细胞外（52.38%）,其次为细胞质（28.57%）,叶绿体（4.76%）,线粒体（4.76%）,内质网（4.76%）,液泡（4.76%）。蛋白质相互作用分析表明,与抗病相关的上调蛋白内源性α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂与3-异丙基苹果酸脱水酶大亚基,微管蛋白α-6链,表皮特异性分泌糖蛋白EP1,BnaC04g03560D和BnaC06g34210D 5...
【文章来源】：西南农业学报. 2020,33(10)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
植株根部的2-DE图谱
为了明确差异表达蛋白参与的代谢途径,KEGG用于确定它们属于哪种类型的生化代谢途径。结果显示,共有7种蛋白质参与代谢途径,分别为XP_013676805.1和XP_013673398.1共同参与氧化磷酸化; XP_013748848.1参与柠檬酸循环,半胱氨酸和蛋氨酸代谢,丙酮酸代谢,乙醛酸和二羧酸代谢,光合生物中的碳固定和碳代谢等多种代谢途径; XP_013723181.1和XP_013722790.1共同参与了氨基酸的生物合成;另外,核苷二磷酸激酶1样亚型X1(XP_013649391.1)参与了MAPK信号通路;微管蛋白α-6链(XP_013640865.1)参与了吞噬体。3 讨 论
为了阐明差异表达蛋白的功能,通过GO功能分类系统鉴定了这些蛋白的生物过程,分子功能和细胞成分。 结果表明这些蛋白主要分为细胞成分中的细胞,细胞部分和细胞器,分子功能中的结合和催化作用,生物过程中的细胞过程,代谢过程和应激反应(图2)。 WoLF PSORT预测了这些蛋白质的亚细胞定位,其主要定位于细胞外(52.38 %),其次是细胞质(28.57 %),叶绿体(4.76 %),线粒体(4.76 %),内质网(4.76 %),液泡(4.76 %,图3)。图3 鉴定蛋白质的亚细胞定位
本文编号：3094685
【文章来源】：西南农业学报. 2020,33(10)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
植株根部的2-DE图谱
为了明确差异表达蛋白参与的代谢途径,KEGG用于确定它们属于哪种类型的生化代谢途径。结果显示,共有7种蛋白质参与代谢途径,分别为XP_013676805.1和XP_013673398.1共同参与氧化磷酸化; XP_013748848.1参与柠檬酸循环,半胱氨酸和蛋氨酸代谢,丙酮酸代谢,乙醛酸和二羧酸代谢,光合生物中的碳固定和碳代谢等多种代谢途径; XP_013723181.1和XP_013722790.1共同参与了氨基酸的生物合成;另外,核苷二磷酸激酶1样亚型X1(XP_013649391.1)参与了MAPK信号通路;微管蛋白α-6链(XP_013640865.1)参与了吞噬体。3 讨 论
为了阐明差异表达蛋白的功能,通过GO功能分类系统鉴定了这些蛋白的生物过程,分子功能和细胞成分。 结果表明这些蛋白主要分为细胞成分中的细胞,细胞部分和细胞器,分子功能中的结合和催化作用,生物过程中的细胞过程,代谢过程和应激反应(图2)。 WoLF PSORT预测了这些蛋白质的亚细胞定位,其主要定位于细胞外(52.38 %),其次是细胞质(28.57 %),叶绿体(4.76 %),线粒体(4.76 %),内质网(4.76 %),液泡(4.76 %,图3)。图3 鉴定蛋白质的亚细胞定位
本文编号：3094685
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