小麦赤霉病菌中维多利亚病毒FaVV1/2对寄主有性生殖的影响研究
发布时间：2021-03-28 23:29
小麦赤霉病主要是由禾谷镰孢菌和亚洲镰孢菌引起的一种真菌性病害,在世界温带小麦种植区发病普遍。随着全球气候变暖及秸秆还田等耕作方式的改变,小麦赤霉病在我国的发生范围逐渐由长江中下游向北向西扩展,流行频率有逐渐增高态势。赤霉病不仅造成严重的产量损失,病菌产生的脱氧雪腐镰孢菌烯醇等毒素还会影响人畜健康。化学防治是目前主要的防治措施,但面临病菌易产生抗药性及环境污染等问题。低毒真菌病毒能够降低寄主真菌的致病力,是一种潜在的生防资源。前期从亚洲镰孢菌菌株F16176中报道了一种新的维多利亚病毒Fa VV1（Fusarium asiaticum victorivirus 1）,本研究从同一个菌株中又发现了另外一个维多利亚病毒,命名为Fa VV2（Fusarium asiaticum victorivirus 2）。根据Rd Rp的氨基酸序列进行的系统发育分析表明这两种ds RNA病毒是维多利亚病毒属的2个新成员。另外,从禾谷镰孢菌菌株CF16158中检测到一种新的正义单链RNA病毒,对病毒编码的Hel和Rd Rp的氨基酸序列进行的系统发育分析表明,该（+）ss RNA真菌病毒是alphavirus...
【文章来源】：长江大学湖北省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
镰孢菌中dsRNA电泳图
20重叠在一起，即UAAUG。FaVV2的基因组结构与FaVV1相似；此外，FaVV2的CP和RdRp与FaVV1最相似（图2.3a）。通过保守域数据库搜索和多重蛋白比对，在RdRp-4区域检测到8个保守基序（I-VIII）（图2.3b）。但根据系统发育树的拓扑结构，FaVV2和MoV1聚成一个单独的分支，RdRp结构域相似度达到95%（图2.4）。图2.3FaVV2、FaVV1和RnVV1基因组结构及RdRp蛋白序列的多重对比Figure2.3FaVV2,FaVV1andRnVV1genomestructureandmultiplecomparisonofRdRpproteinsequences注：图a表示FaVV2与FaVV1、RnVV1的基因结构，长方形框表示CP和RdRp的ORF，该蛋白的氨基酸数在方框上比奥是，起始密码子和终止密码子的核苷酸位置在方框上显示，图中显示了重叠的五个核苷酸UAAUG的位置。图b表示FaVV2的RdRp基序与维多利亚病毒属中选定病毒的多重序列比对。序列上方的水平线表示八个基序，括号中的数字表示保守基序之间的残基数。FaVV1、RnVV1、MoV1、AfV-S1、BbVV-N22/1980、SnV1、SsRV1和UvRV1的GenBank的登录号显示在图2.4
21图2.4FaVV2在Victoriviurs中RdRp区域的氨基酸序列构建的系统发育树Figure2.4PhylogenetictreeconstructedbytheaminoacidsequenceoftheRdRpregionofFaVV2inVictoriviurs注：利用全病毒科病毒RdRp区域的氨基酸序列，采用邻接法构建系统发育树。在节点上显示百分比引导值（1000次重复），GenBank登录号放在病毒名称之前。2.3.4禾谷镰孢菌中FgALV1病毒的基因组结构及系统进化分析CF16158中大部分病毒基因组序列是从CF16158转录组测序数据中发现的（未发表的数据，在GenepioneerBiotech公司IlluminaHiSeqXTen平台上测序）。对菌株CF16158的7500bp左右的条带进行了克隆测序，获取序列在Geneious11.1.4软件上进行拼接组装，并根据拼接获得的序列再设计特异性引物补充Gap。从CF16158菌株中获取一条序列，大小为7501bp。利用Geneious11.1.4软件对该病毒的cDNA序列进行ORF翻译，并进行了保守结构域预测，发现该病毒有四个ORF，ORF2预测编码Hel和RdRp，根据预测的保守结构域进行BLAST搜索。FgALV1病毒基因组全长为7501bp（登录号：MN400076），5′和3′非翻译区（UTR）分别为70和245个核苷酸长，在3′UTR中有一个Poly(A)尾巴。ORF1（71-436nt）的长度为366nt，编码一个假定的121aa蛋白，其分子量为13.76kDa。ORF2（424-6387nt）长5964nt，与ORF1的3′端13nt重叠。ORF2被预测编码一个1987aa蛋白，分子量为223.54kDa，包含一个Hel(3652-4425nt)和一个RdRp(4987-6066nt)保
【参考文献】：
期刊论文
[1]2018年我国小麦赤霉病重发特点及原因分析[J]. 黄冲,姜玉英,吴佳文,邱坤,杨俊杰. 植物保护. 2019(02)
[2]小麦赤霉病抗性改良研究进展[J]. 刘易科,佟汉文,朱展望,陈泠,邹娟,张宇庆,焦春海,高春保. 麦类作物学报. 2016(01)
[3]小麦赤霉病的防治技术研究进展[J]. 张洁,伊艳杰,王金水,陈士华,李桂玲. 中国植保导刊. 2014(01)
博士论文
[1]禾谷镰刀菌中SR蛋白FgSrp1和FgSrp2的功能研究[D]. 张艺美.西北农林科技大学 2017
[2]禾谷镰刀菌细胞壁形成相关基因及其 RNAi 片段功能鉴定[D]. 宋修仕.华中农业大学 2015
硕士论文
[1]亚洲镰孢菌（Fusarium asiaticum）对氰烯菌酯的抗药性遗传多样性及其适合度研究[D]. 李斌.南京农业大学 2017
[2]禾谷镰刀菌病毒FgHV2/JS16和FgMTV1/SX64的功能鉴定[D]. 李鹏飞.中国农业科学院 2016
本文编号：3106443
【文章来源】：长江大学湖北省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
镰孢菌中dsRNA电泳图
20重叠在一起，即UAAUG。FaVV2的基因组结构与FaVV1相似；此外，FaVV2的CP和RdRp与FaVV1最相似（图2.3a）。通过保守域数据库搜索和多重蛋白比对，在RdRp-4区域检测到8个保守基序（I-VIII）（图2.3b）。但根据系统发育树的拓扑结构，FaVV2和MoV1聚成一个单独的分支，RdRp结构域相似度达到95%（图2.4）。图2.3FaVV2、FaVV1和RnVV1基因组结构及RdRp蛋白序列的多重对比Figure2.3FaVV2,FaVV1andRnVV1genomestructureandmultiplecomparisonofRdRpproteinsequences注：图a表示FaVV2与FaVV1、RnVV1的基因结构，长方形框表示CP和RdRp的ORF，该蛋白的氨基酸数在方框上比奥是，起始密码子和终止密码子的核苷酸位置在方框上显示，图中显示了重叠的五个核苷酸UAAUG的位置。图b表示FaVV2的RdRp基序与维多利亚病毒属中选定病毒的多重序列比对。序列上方的水平线表示八个基序，括号中的数字表示保守基序之间的残基数。FaVV1、RnVV1、MoV1、AfV-S1、BbVV-N22/1980、SnV1、SsRV1和UvRV1的GenBank的登录号显示在图2.4
21图2.4FaVV2在Victoriviurs中RdRp区域的氨基酸序列构建的系统发育树Figure2.4PhylogenetictreeconstructedbytheaminoacidsequenceoftheRdRpregionofFaVV2inVictoriviurs注：利用全病毒科病毒RdRp区域的氨基酸序列，采用邻接法构建系统发育树。在节点上显示百分比引导值（1000次重复），GenBank登录号放在病毒名称之前。2.3.4禾谷镰孢菌中FgALV1病毒的基因组结构及系统进化分析CF16158中大部分病毒基因组序列是从CF16158转录组测序数据中发现的（未发表的数据，在GenepioneerBiotech公司IlluminaHiSeqXTen平台上测序）。对菌株CF16158的7500bp左右的条带进行了克隆测序，获取序列在Geneious11.1.4软件上进行拼接组装，并根据拼接获得的序列再设计特异性引物补充Gap。从CF16158菌株中获取一条序列，大小为7501bp。利用Geneious11.1.4软件对该病毒的cDNA序列进行ORF翻译，并进行了保守结构域预测，发现该病毒有四个ORF，ORF2预测编码Hel和RdRp，根据预测的保守结构域进行BLAST搜索。FgALV1病毒基因组全长为7501bp（登录号：MN400076），5′和3′非翻译区（UTR）分别为70和245个核苷酸长，在3′UTR中有一个Poly(A)尾巴。ORF1（71-436nt）的长度为366nt，编码一个假定的121aa蛋白，其分子量为13.76kDa。ORF2（424-6387nt）长5964nt，与ORF1的3′端13nt重叠。ORF2被预测编码一个1987aa蛋白，分子量为223.54kDa，包含一个Hel(3652-4425nt)和一个RdRp(4987-6066nt)保
【参考文献】：
期刊论文
[1]2018年我国小麦赤霉病重发特点及原因分析[J]. 黄冲,姜玉英,吴佳文,邱坤,杨俊杰. 植物保护. 2019(02)
[2]小麦赤霉病抗性改良研究进展[J]. 刘易科,佟汉文,朱展望,陈泠,邹娟,张宇庆,焦春海,高春保. 麦类作物学报. 2016(01)
[3]小麦赤霉病的防治技术研究进展[J]. 张洁,伊艳杰,王金水,陈士华,李桂玲. 中国植保导刊. 2014(01)
博士论文
[1]禾谷镰刀菌中SR蛋白FgSrp1和FgSrp2的功能研究[D]. 张艺美.西北农林科技大学 2017
[2]禾谷镰刀菌细胞壁形成相关基因及其 RNAi 片段功能鉴定[D]. 宋修仕.华中农业大学 2015
硕士论文
[1]亚洲镰孢菌（Fusarium asiaticum）对氰烯菌酯的抗药性遗传多样性及其适合度研究[D]. 李斌.南京农业大学 2017
[2]禾谷镰刀菌病毒FgHV2/JS16和FgMTV1/SX64的功能鉴定[D]. 李鹏飞.中国农业科学院 2016
本文编号：3106443
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