南方根结线虫毒性相关基因筛选及MiV901抑制植物免疫分析

发布时间：2021-04-10 19:28

　　南方根结线虫（Meloidogyne incognita）是一类重要的植物寄生线虫。南方根结线虫在寄生过程中,将其食道腺分泌的大量效应蛋白注入植物细胞,其中类毒液过敏原蛋白（venom allergen-like proteins）在线虫侵染早期阶段起着重要的作用。本文通过转录组测序技术（RNAseq）对南方根结线虫无毒群体和毒性群体侵入Mi-l番茄后的转录组进行分析,选取在毒性群体中表达显著上调的类毒液过敏原Mi V901基因为研究对象,利用烟草瞬时表达以及拟南芥过表达等方法探索MiV901在根结线虫寄生过程中的生物学功能。主要结果如下:1.南方根结线虫无毒和毒性群体侵染Mi-1番茄的差异表达基因分析为了探究南方根结线虫与Mi-1番茄亲和与非亲和互作过程中导致的基因表达差异,本文对南方根结线虫无毒群体MIJS8-AV和毒性群体MIJS8-Ⅵ侵染Mi-1番茄’Tanaki,3 d后的转录组进行测序和生物信息学分析。结果表明,分别由MIJS8-AV和MIJS8-VI侵染的’Tanaki’根尖构建的AVTL文库和VITL文库之间,共存在93个根结线虫差异表达基因（DEGs）;与AVTL文库... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：106 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．根结线虫的生活史??Ｆｉｇ．?１?Ｒｏｏｔ－ｋｎｏｔ?ｎｅｍａｔｏｄｅ?ｌｉｆｅ?ｃｙｃｌｅ?（Ｊｏｎｅｓ?＆?Ｇｏｔｏ，?２０１１）??１．３根结线虫的防治??

Ｕａ？＞?ｍ？ｒｅ??Ｅ?Ｆ?＿??＜Ｋ?ｔｆｏｎｓｃｅｒ?６？ｋ?？ｖ??ｙ＾＼?Ｘ．?？０？＊？？？？？？＜?ｒｓＭＵＳＨｚ?７＊＼?ｆｔＣ（？ｅ？ａ？Ｋ？＊??／／?＼＼?／〇．＼?？〇？＊＊？？??：：１：：Ａ??ｓ?ｒ；ｔＴ＞Ｔｉ＾Ｚｉ?ｔ）?ｗ?ａ?ｉ＊?：＊?ｉｉ?？?？?？ｔ?＜？?４９?ｖ?？?ｗ?？ｉ?ｔｓｂＴｆ；?Ｖ？?ｎｗｓｎ?ｎ?ｗＴ；?ｘ?ｍ?ｉ？?＜ｉ?？：？?＜？?ｖ?？?？?？；?？?ｗ?ｊ；?？ｓ?；５ｗ？?？ｖｖ？？?ｗ．??图１－２?ＲＮＡｓｅｑ数据质量检测分析??Ｆｉｇ．?１－２?Ｑｕａｌｉｔｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＲＮＡｓｅｑ?ｄａｔａ?ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ??Ａ，Ｃ，Ｅ：?ＡＶＴＬ?文库；Ｂ，Ｄ，Ｆ：?ＶＩＴＬ?文库。??Ａ－Ｂ：每个碱基序列质量；Ｃ－Ｄ：每条序列的质量；Ｅ－Ｆ：每条序列ＧＣ含量。??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｒｙ?ＡＶＴＬ；?Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａ＾?ＶＩＴＬ．??Ａ，?Ｂ：?Ｐｅｒ?ｂａｓｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｑｕａｌｉｔｙ；?Ｃ，?Ｄ：?Ｐｅｒ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅｓ；?Ｅ，?Ｆ：?Ｐｅｒ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ＧＣ?ｃｏｎｔｅｎｔ．??通过高通量测序得到ＡＶＴＬ文库２２０１０６５５条ｒａｗ?ｒｅａｄｓ和ＶＩＴＬ文库２２０４５３４８??条ｒａｗｒｅａｄｓ，去除低质量、污染片段后，ＡＶＴＬ得到了?２１９７１０８６条ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ，ＶＩＴＬ??文库得到了?２２００８５７１条ｄｅａｎ?ｒｅａｄｓ，分别占其ｒａｗ?ｒｅａｄｓ总数的９９．８２％和９９．８３％。表??明文库构建质量较好，获

?２?５６％?￣￣￣?四?０－１０％?（３０４３）??ｋ?―）?—５２）??／?０?２〇％－３〇％（４〇８）?９．００％?＾?０２〇％－３〇％?（４７８）??＊３０％－４０％（１９５）?？?３０％－概（２５５）??？４０％－５０％（１２８）?擎變＿?０４Ｏ％－５Ｏ％（１３７）??＼ｙ?＃－＝：：；；：?／?５７＇３０％－０：：：：：：；??口?８０％－９０％（１３＞?口８０％－９０％（２７＞??Ｅ?９０％－１００％?⑶?■?９０％－１００％?（１７）??图１－３映射到的南方根结线虫基因数据统计??Ｆｉｇ．?１－３?Ｓｔａｔｉｓｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｅｓ?ｏｆ?Ｍ?ｉｎｃｏｇｎｉｔａ?ｇｅｎｅｓ?ｍａｐｐｅｄ?ｂｙ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＡＶＴＬ?文库；Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＶＩＴＬ?文库??Ａ，?Ｂ：映射到某个基因次数的分布；Ｃ，?Ｄ：映射到某个基因总ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ数量的分布；Ｅ，?Ｆ：??基因覆盖度??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｒｙ?ＡＶＴＬ；?Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｉｙ?ＶＩＴＬ??Ａ，?Ｂ：?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｐｐｅｄ?ｇｅｎｅｓ；?Ｃ，?Ｄ：?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ；?Ｅ，?Ｆ：?Ｇｅｎｅ?ｃｏｖｅｒａｇｅ??注：Ａ－Ｄ中“１－５”指基因被映射到１－５次，Ａ，?Ｂ括号中为基因数量；Ｃ，?Ｄ括号中为ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ数??量；Ｅ，?Ｆ中“０－１０％”指基因覆盖度，括号中为基因数量。??Ｎｏｔｅ：?“１－５”?ｉｎ?Ａ－Ｄ?ｍｅａｎｓ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅ?ｏｒ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ?

【参考文献】：
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本文编号：3130207