小麦品种西农979抗赤霉病基因的转录组测序鉴定

发布时间：2021-04-22 01:21

　　小麦品种西农979对赤霉病具有较好的抗性。为了发掘西农979的抗赤霉病基因,本研究采用禾谷镰刀菌菌株BN-8分别接种抗病品种西农979与感病品种周麦18,取接种前西农979颖壳及接种后12、24和96 h的西农979与周麦18颖壳进行转录组分析,筛选抗感赤霉病差异表达基因,并对其进行GO功能注释及KEGG富集分析。结果表明,接种后12、24和96 h各出现14、1 978和142个差异表达基因,共计2 122个基因。这些基因经GO功能注释分类分成3大类43个亚类,主要涉及代谢过程、细胞过程、应激反应、生物调控、细胞部件、细胞、催化活性、结合、转运活性等。KEGG通路分析结果显示,内质网中的蛋白质加工通路中差异基因最多,有48个;其次是光合作用—天线蛋白通路及淀粉和蔗糖代谢通路,各含41和30个差异基因;显著富集的通路有光合作用—天线蛋白、内质网中的蛋白质加工、萜骨架的生物合成等。植物激素信号转导通路中发现27个差异基因,参与脱落酸和茉莉酸等路径;植物-病原体互作通路中发现19个差异基因,编码钙结合蛋白、WRKY转录因子、抗病蛋白等。此外,还筛选到UDP-葡萄糖基转移酶基因等脱毒相关蛋白... 

【文章来源】：麦类作物学报. 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试材料
    1.2 赤霉病田间鉴定方法
    1.3 转录组测序样品的准备
    1.4 RNA提取和反转录
    1.5 转录组测序及基因表达定量分析
    1.6 差异表达基因的筛选和功能注释
    1.7 荧光定量PCR验证差异表达基因
2 结果与分析
    2.1 西农979和周麦18田间抗病性鉴定结果
    2.2 转录组测序数据及其质量控制
    2.3 差异表达基因分析
    2.4 共同差异表达基因的GO功能注释
    2.5 共同差异基因的KEGG通路富集分析
    2.6 共同差异表达基因的功能归类及表达
    2.7 差异表达基因的荧光定量PCR验证
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]Characterization of a PDR type ABC transporter gene from wheat （Triticum aestivum L.）[J]. SHANG Yi1,2, XIAO Jin1, MA LuLin1, WANG HaiYan1, QI ZengJun1, CHEN PeiDu1, LIU DaJun1 & WANG XiuE11 State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cytogenetics Institute, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China; 2 Institute of Crop Research and Nuclear Technique Utilization, Zhejiang Academy of Agricultural Science, Hangzhou 310021, China.  Chinese Science Bulletin. 2009(18)
[2]小麦抗赤霉病性田间自然鉴定与抗赤霉病育种中的问题[J]. 方毅敏,肖碧玉,黄继平,许文真,朱涵.  植物保护学报. 1999(04)
[3]我国小麦赤霉病穗部镰刀菌种类、分布及致病性[J]. All China Corporation of Research on Wheat Scab.  上海师范学院学报(自然科学版). 1984(03)

博士论文
[1]小麦抗赤霉病相关基因的克隆及功能分析[D]. 马信.山东农业大学 2014



本文编号：3152877