基于转录组的苹小卷叶蛾杀虫剂靶标及解毒代谢相关基因分析

发布时间:2021-05-17 23:45
  【目的】建立苹小卷叶蛾Adoxophyes orana转录组数据库,挖掘杀虫剂靶标及解毒代谢相关基因。【方法】采用Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术对苹小卷叶蛾进行转录组测序,挖掘并分析杀虫剂靶标基因;利用qPCR检测6个杀虫剂靶标基因在苹小卷叶蛾卵、幼虫、蛹和成虫各不同发育阶段的表达;挖掘并分析苹小卷叶蛾转录组中解毒代谢相关基因的代谢通路及进化关系。【结果】通过组装有效序列共获得48 610条unigene(GenBank登录号:GGMW00000000)。挖掘鉴定到155个杀虫剂靶标unigene;qPCR结果显示,1个蜕皮激素受体(ecdysone receptor, ECR)、2个乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase, AChE)、1个氯离子通道蛋白(chloride channel, CLC)、1个几丁质酶(chitinase, CS)和1个鱼尼丁受体(ryanodine receptor, RyR)基因在苹小卷叶蛾不同发育阶段均存在表达差异。挖掘鉴定到69个羧酸酯酶(carboxylesterase, CarE)... 

【文章来源】:昆虫学报. 2020,63(04)北大核心CSCD

【文章页数】:12 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 害虫饲养
    1.2 cDNA文库构建和测序
    1.3 生物信息学分析
    1.4 杀虫剂靶标基因的鉴定及表达模式分析
    1.5 解毒代谢相关基因的挖掘及代谢通路、进化关系分析
    1.6 数据分析
2 结果
    2.1 苹小卷叶蛾转录组组装结果
    2.2 苹小卷叶蛾转录组中unigenes的功能注释及序列特征
    2.3 苹小卷叶蛾转录组中杀虫剂靶标基因的预测及表达模式分析
    2.4 苹小卷叶蛾转录组中解毒代谢相关基因的挖掘、代谢通路及进化关系分析
3 讨论



本文编号:3192687

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