浙江省马铃薯病毒病检测分析
发布时间：2021-06-27 14:23
马铃薯病毒病是影响马铃薯产量和品质的主要因素之一,其症状表现为花叶、黄化和卷曲等。2019年4月-5月,在浙江省湖州、杭州、绍兴、宁波、金华、台州和丽水等7个地市的主要马铃薯产区采集了具有典型病毒病症状的马铃薯样品,采用转录组测序和RT-PCR验证的方法进行病毒检测,共筛查并验证出6种马铃薯病毒,包括马铃薯X病毒Potato virus X（PVX）、马铃薯Y病毒Potato virus Y（PVY）、马铃薯S病毒Potato virus S（PVS）、马铃薯H病毒Potato virus H（PVH）、马铃薯M病毒Potato virus M（PVM）以及马铃薯奥古巴花叶病毒Potato aucuba mosaic virus（PAMV）。检测结果表明,在调查的这7个地市中每个地市都具有2种以上的病毒发生,其中PVH作为一种新鉴定的麝香石竹潜隐病毒属成员在除宁波以外的各地区都有发生;此外杭州市、湖州市以及绍兴市均检测出了PAMV。对检测到的PVS、PVH、PVM和PAMV外壳蛋白（coat protein,CP）序列进行系统发育分析表明,这些病毒均存在地域差异性。本研究为浙江省马铃薯...
【文章来源】：植物保护. 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
浙江省马铃薯病毒病的典型症状
我们将代表7个地市的混池马铃薯样品送往诺禾致源公司进行转录组测序分析,共检测到6种马铃薯病毒,分别为PVX、PVY、PVS、PVH、PVM以及PAMV。根据转录组获得的CP序列设计引物进行PCR验证,各病毒CP引物都能扩增出相应的条带(图2)。根据转录组检测结果,结合RT-PCR验证,该7个地市马铃薯种植区中发生的病毒种类情况如表2。表2 浙江省7个地市马铃薯病毒病的病原检测情况1)Table 2 Pathogen detection of potato virus diseases in various cities of Zhejiang province 采集地 Location PVX PVY PVS PVH PVM PAMV 杭州 Hangzhou - + + + + + 宁波 Ningbo - + - - + - 绍兴 Shaoxing - - + + - + 湖州 Huzhou + - - + - + 金华 Jinhua + - - + + - 丽水 Lishui + - - + + - 台州 Taizhou + + + + - - 1) “+”表示在该地区检测到此种病毒;“-”表示在该地区未检测到此种病毒。“+”indicates that the virus is detected in the area; “-” indicates that the virus is not detected in the area.
我们将在各地检测到的以及NCBI上所报道的PAMV CP序列的氨基酸进行进化树构建分析,结果如图3。图3显示湖州市所发生的PAMV与孟加拉国所发生的PAMV(MG356505.1、MG356506.1)相似度最高,亲缘关系最近。本次杭州地区检测到的PAMV分离物和曾经在杭州检测的序列号为MH379106.1的PAMV亲缘关系最近,表明在杭州地区PAMV的发生并没有较大的差异。然而发生在绍兴的PAMV与已报道的S73580.1和NC 003632.1相似度最高,具有最近的亲缘关系。但是通过分支情况来看,绍兴市与湖州、杭州两市处于两个不同的分支,因此杭州市和湖州市的PAMV亲缘关系相对绍兴市则更近一些。2.3.2 PVH的系统发育分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省马铃薯主要病毒病发生情况调查[J]. 齐恩芳,刘石,贾小霞,文国宏,吕和平,黄伟,高彦萍. 植物保护. 2018(04)
[2]浙江省鲜食马铃薯春、秋季高效栽培技术[J]. 蔡仁祥. 浙江农业科学. 2015(06)
[3]马铃薯不同级别脱毒种薯病毒再侵染情况及产量变化[J]. 黄萍,何庆才,颜谦. 贵州农业科学. 2008(04)
硕士论文
[1]山西省马铃薯病毒病区系分布及综合防治的研究[D]. 郭喜文.山西农业大学 2014
本文编号：3253017
【文章来源】：植物保护. 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
浙江省马铃薯病毒病的典型症状
我们将代表7个地市的混池马铃薯样品送往诺禾致源公司进行转录组测序分析,共检测到6种马铃薯病毒,分别为PVX、PVY、PVS、PVH、PVM以及PAMV。根据转录组获得的CP序列设计引物进行PCR验证,各病毒CP引物都能扩增出相应的条带(图2)。根据转录组检测结果,结合RT-PCR验证,该7个地市马铃薯种植区中发生的病毒种类情况如表2。表2 浙江省7个地市马铃薯病毒病的病原检测情况1)Table 2 Pathogen detection of potato virus diseases in various cities of Zhejiang province 采集地 Location PVX PVY PVS PVH PVM PAMV 杭州 Hangzhou - + + + + + 宁波 Ningbo - + - - + - 绍兴 Shaoxing - - + + - + 湖州 Huzhou + - - + - + 金华 Jinhua + - - + + - 丽水 Lishui + - - + + - 台州 Taizhou + + + + - - 1) “+”表示在该地区检测到此种病毒;“-”表示在该地区未检测到此种病毒。“+”indicates that the virus is detected in the area; “-” indicates that the virus is not detected in the area.
我们将在各地检测到的以及NCBI上所报道的PAMV CP序列的氨基酸进行进化树构建分析,结果如图3。图3显示湖州市所发生的PAMV与孟加拉国所发生的PAMV(MG356505.1、MG356506.1)相似度最高,亲缘关系最近。本次杭州地区检测到的PAMV分离物和曾经在杭州检测的序列号为MH379106.1的PAMV亲缘关系最近,表明在杭州地区PAMV的发生并没有较大的差异。然而发生在绍兴的PAMV与已报道的S73580.1和NC 003632.1相似度最高,具有最近的亲缘关系。但是通过分支情况来看,绍兴市与湖州、杭州两市处于两个不同的分支,因此杭州市和湖州市的PAMV亲缘关系相对绍兴市则更近一些。2.3.2 PVH的系统发育分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省马铃薯主要病毒病发生情况调查[J]. 齐恩芳,刘石,贾小霞,文国宏,吕和平,黄伟,高彦萍. 植物保护. 2018(04)
[2]浙江省鲜食马铃薯春、秋季高效栽培技术[J]. 蔡仁祥. 浙江农业科学. 2015(06)
[3]马铃薯不同级别脱毒种薯病毒再侵染情况及产量变化[J]. 黄萍,何庆才,颜谦. 贵州农业科学. 2008(04)
硕士论文
[1]山西省马铃薯病毒病区系分布及综合防治的研究[D]. 郭喜文.山西农业大学 2014
本文编号：3253017
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3253017.html
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