不同侵染时间点稻粒黑粉病菌的转录组分析

发布时间:2021-07-05 16:46
  由土传真菌稻粒黑粉菌引起的稻粒黑粉病是水稻杂交制种田中的主要病害之一。为初步解析稻粒黑粉病菌侵染过程中与寄主的互作分子机制,本研究用稻粒黑粉病菌强毒力菌株JY-521侵染感病不育系材料"9311A",于侵染8、12、24、48和72 h 5个时间点取菌样进行转录组测序分析。结果表明,与未侵染对照组相比,在侵染8 h时,差异表达基因(DEGs)数最多,有337个DEGs;其中上调的DEGs有120个,下调的DEGs有217个。337个DEGs的KEGG富集分析表明,脂肪酸代谢和过氧化物酶体可能是稻粒黑粉病菌侵染过程中的关键代谢途径。此外,对编码碳水化合物酶、分泌蛋白和宿主植物—病原互作蛋白的DEGs在5个侵染时间点的表达模式进行解析,结果表明,一些显著上调表达的DEGs可能是稻粒黑粉病菌侵染的关键致病因子。该研究结果为解析稻粒黑粉病菌的致病分子机制,进一步防控该病害奠定了理论基础。 

【文章来源】:草业学报. 2020,29(09)北大核心CSCD

【文章页数】:13 页

【部分图文】:

不同侵染时间点稻粒黑粉病菌的转录组分析


稻粒黑粉病菌在5个不同侵染时间点的遗传统计

模块图,黑粉病,基因,中共


稻粒黑粉病菌中共表达差异基因的表达模块

黑粉病,侵染,富集,生物学


将筛选阈值定为corrected P-value≤0.05,对不同时间获得的差异表达基因进行GO注释分析(图3),这些DEGs被富集注释到3个GO分类,分别是生物学过程(biological process)、细胞组成(cellular component)和分子功能(molecular function)。以未侵染为对照,对稻粒黑粉菌侵染8 h显著差异表达基因进行GO富集分析,结果显示,上调DEGs在生物学过程分类中的生长、细胞组成分类中的细胞器组件和分子功能分类中的酶调节活性、分子功能调节显著富集。显著下调DEGs在生物学过程的代谢过程和分子功能的结合、催化活性显著富集。推测该7条富集条目可能与稻粒黑粉病菌致病途径相关。2.5 KEGG代谢途径分析

【参考文献】:
期刊论文
[1]水稻幼穗与Ustilaginoidea virens互作早期的转录组分析[J]. 韩彦卿,韩渊怀,张春来,孙文献.  植物病理学报. 2019(03)
[2]基于转录组测序的异常汉逊酵母菌不同发酵时期差异表达基因功能分析[J]. 唐朝,张寒玉,王婷,冯光文,钱卫东,蔡长龙,毛培宏.  食品与发酵工业. 2019(04)
[3]78个水稻不育系对稻粒黑粉病的抗性评价[J]. 王爱军,殷得所,富蓉,盘林秀,顾思思,江波,郑爱萍.  植物病理学报. 2018(02)
[4]一种简单高质量的黄伞菌总RNA分离提取方法[J]. 郭陈刚,李顺国,魏志敏,夏雪岩.  华北农学报. 2016(S1)
[5]中国水稻高产栽培技术创新与实践[J]. 朱德峰,张玉屏,陈惠哲,向镜,张义凯.  中国农业科学. 2015(17)
[6]碳水化合物活性酶数据库(CAZy)及其研究趋势[J]. 王帅,陈冠军,张怀强,王禄山.  生物加工过程. 2014(01)
[7]稻瘟菌P-ATPase基因MoCTA3的克隆及表达分析[J]. 彭陈,陈洪亮,王俊伟,郭士伟,张玉琼,方先文.  江苏农业学报. 2012(03)
[8]稻瘟病菌分泌蛋白质在致病过程中的作用初探[J]. 刘永锋,陈志谊,俞文渊,于俊杰,胡建坤,刘邮洲,聂亚锋.  中国水稻科学. 2011(04)
[9]稻粒黑粉菌冬孢子萌发影响因素及其产孢培养基的筛选[J]. 陈胜军,王艳丽,张震,姜华,柴荣耀,毛雪琴,邱海萍,王教瑜,杜新法,孙国昌.  浙江农业学报. 2011(03)
[10]氮胁迫条件下稻瘟病菌分泌蛋白致病性分析[J]. 周晓罡,苏源,李成云,丁玉梅,张绍松,孙茂林,李进斌.  植物病理学报. 2009(05)

硕士论文
[1]小麦条锈菌几丁质酶基因Pst23943的功能分析[D]. 林颢丞.西北农林科技大学 2019



本文编号:3266447

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