灰皮支黑豆抗大豆胞囊线虫转录组及蛋白质网络研究
发布时间：2021-07-11 07:55
大豆胞囊线虫（Heterodera glycines,Soybean cyst nematode,SCN）是全球范围影响大豆生产的重要病害,防治大豆胞囊线虫的方法包括物理防治、化学防治、生物防治及应用抗病品种;而抗线虫品种则是环境友好,防效显著的方法。大豆原产中国,因此我国具有丰富的抗线虫资源。灰皮支黑豆作为一种优秀的抗线虫品种可用于抗线虫育种的抗原材料,为了明确其抗大豆胞囊线虫的分子机制,开展了如下五部分的研究。一、SCN胁迫下灰皮支黑豆转录组分析:利用转录组学测序对灰皮支黑豆接种大豆胞囊线虫5 d、10 d和15 d的样本进行研究,对测序得到的reads标准化处理、基因组匹配、差异表达分析和功能富集分析。在接种大豆胞囊线虫后5 d、10 d和15 d分别检测到740、1165和2925条差异表达基因。其中有225条差异基因在全部三个测序时间表达。大豆胞囊线虫侵染灰皮支黑豆5 d、10 d和15 d差异表达基因参与了众多的生物学功能类型。上调表达基因富集在防御反应、激素介导的信号过程和胁迫的响应。为了验证GO和KEGG富集的结果;分析生物胁迫代谢途径中激素对大豆胞囊线虫的影响,水杨酸...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：107 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
利用CRISPR/Cas9系统的gRNA介导的基因组编辑(ShanQ.etal.,2014)
豆有效的降低大豆胞囊线虫的繁殖能力和胞囊中卵的数量。灰皮支龄幼虫 5 d、10 d 和 15 d 后根内部不同龄期幼虫、以及 35 d 后的胞囊数量以及 10 次生物学重复（t-test，*表示 p<0.05，**表示 p-value < 0.005，***表示 p<0豆胞囊线虫 35 d 后的胞囊数量。灰色表示辽豆 15，黑色表示灰皮支黑豆，结果低于辽豆 15 中胞囊中卵的数量。Mean ± SD 包含了 10 次生物学重复（t-test，表示 p-value < 0.005，***表示 p<0.001）。izhi Heidou could reduce SCN reproduction and decreased the eggs per cformation on Huipizhi Heidou and Liaodou15 at 35 days post infection: the gray colun Liao15 as control, and the black column represents number of cysts on Huipizhi Hng data from 10 biological replicates (t-test, *p-value < 0.05, *** p-value<0.001, andeen Huipizhi Heidou and Liaodou15: the result showed that the eggs per cyst betwe different. Mean and SD were examined using data from 2 biological replicates (t-te**p-value < 0.005, ***p-value<0.001, and n = 10).q 的质量检测和基因组 mapping灰皮支黑豆抑制大豆胞囊线虫的分子生物学机制，利用 R
胞囊线虫侵染后的差异表达基因。A）火山图所示灰皮支黑豆上调与下调表达的基因在三样本中的分布 （padj<0.05）和维恩图所示上调和下调表达基因在每个测序样本中的分布2 Differentially expressed genes after SCN infection. A). The volcano plots show the numbers differentially expressed genes in each comparison group (padj < 0.05). B). Venn diagrams show the disof up- and down-regulated genes at each time point (padj < 0.05).CR 鉴定 RNA Seq 数据鉴定 RNA-Seq 数据，利用 qPCR 来分析在全部检测时间点共同表达的 条差异基因序列用于该部分的验证，结果表明 qPCR 的结果与 RNA-Se相同的表达趋势（图 2-3）；qPCR 的引物详见附表 2-1。
本文编号：3277675
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：107 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
利用CRISPR/Cas9系统的gRNA介导的基因组编辑(ShanQ.etal.,2014)
豆有效的降低大豆胞囊线虫的繁殖能力和胞囊中卵的数量。灰皮支龄幼虫 5 d、10 d 和 15 d 后根内部不同龄期幼虫、以及 35 d 后的胞囊数量以及 10 次生物学重复（t-test，*表示 p<0.05，**表示 p-value < 0.005，***表示 p<0豆胞囊线虫 35 d 后的胞囊数量。灰色表示辽豆 15，黑色表示灰皮支黑豆，结果低于辽豆 15 中胞囊中卵的数量。Mean ± SD 包含了 10 次生物学重复（t-test，表示 p-value < 0.005，***表示 p<0.001）。izhi Heidou could reduce SCN reproduction and decreased the eggs per cformation on Huipizhi Heidou and Liaodou15 at 35 days post infection: the gray colun Liao15 as control, and the black column represents number of cysts on Huipizhi Hng data from 10 biological replicates (t-test, *p-value < 0.05, *** p-value<0.001, andeen Huipizhi Heidou and Liaodou15: the result showed that the eggs per cyst betwe different. Mean and SD were examined using data from 2 biological replicates (t-te**p-value < 0.005, ***p-value<0.001, and n = 10).q 的质量检测和基因组 mapping灰皮支黑豆抑制大豆胞囊线虫的分子生物学机制，利用 R
胞囊线虫侵染后的差异表达基因。A）火山图所示灰皮支黑豆上调与下调表达的基因在三样本中的分布 （padj<0.05）和维恩图所示上调和下调表达基因在每个测序样本中的分布2 Differentially expressed genes after SCN infection. A). The volcano plots show the numbers differentially expressed genes in each comparison group (padj < 0.05). B). Venn diagrams show the disof up- and down-regulated genes at each time point (padj < 0.05).CR 鉴定 RNA Seq 数据鉴定 RNA-Seq 数据，利用 qPCR 来分析在全部检测时间点共同表达的 条差异基因序列用于该部分的验证，结果表明 qPCR 的结果与 RNA-Se相同的表达趋势（图 2-3）；qPCR 的引物详见附表 2-1。
本文编号：3277675
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3277675.html
最近更新
教材专著
