果生刺盘孢交配型基因M477-2-1的功能分析
发布时间：2021-07-15 15:06
近几年,苹果炭疽叶枯病（Glomerella leaf spot,GLS）在我国苹果产地迅速蔓延。果生刺盘孢（Colletotrichum fructicola）是该病害的的主要病原。田间条件下,果生刺盘孢在致病后期可以产生大量子囊孢子。子囊孢子能够随风远距离传播可能是苹果炭疽叶枯病迅速蔓延的重要原因。交配型基因是调控真菌有性生殖的关键因子。大多数丝状子囊真菌有性子实体发育和子囊孢子形成需要交配型基因MAT1-1-1和MAT1-2-1的互相识别。异宗配合真菌同一菌株仅含MAT1-1-1或MAT1-2-1,交配型基因不同的菌株间发生交配。同宗配合真菌同一菌株同时含有MAT1-1-1和MAT1-2-1,自身即可完成有性生殖。与其它子囊真菌不同,目前十几个已知的刺盘孢属真菌基因组中均只含有MAT1-2-1,而无MAT1-1-1,而且部分菌株仍能发生同宗配合。目前尚不清楚MAT1-2-1是否是刺盘孢真菌有性生殖的关键调控因子。果生刺盘孢1104-6-B菌株在固体培养基上产生大量散生不育子囊壳,该菌株与性亲和菌株1104-7-W-S对峙培养,则会形成由聚生可育子囊壳构成的杂交线。本研究以1104...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
刺盘孢真菌独特的交配型位点基因结构
12果生刺盘孢交配型基因MAT1-2-1的功能分析GATGAGGTAG2.根据交配型MAT1-2-1基因及其上下游2000bp左右的序列，再结合潮霉素磷酸转移酶基因（hph）序列设计基因敲除载体构建所用的PCR扩增引物。引物序列见表2-1，图2-1显示引物的位置。表2-1交配型MAT1-2-1基因敲除和检测所用引物Table.2-1DesignedprimersusedforgeneratinganddetectinggeneknockoutmutantsofthematingtypegeneMAT1-2-1引物名称PrimerName引物序列Sequence(5’-3’)Mat1-2-1LFGGGAAATGATGGGGTTTCTAACTGCMat1-2-1LRAscIGCATTGGCGCGCCGGCGCAGACGTTGCTAGAATTATGGMat1-2-1RFNotIATAAGAATGCGGCCGCCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGMat1-2-1RRCAGGAGAACAAGGCTGCAGTGCTAGMat1-2-1DFGTTGCTGTCTCTCAGAAGGATTACCMat1-2-1DRCAATAGCGATGCCGTTGACCGAGACMat1-2-1LFNestTGCATGGTTGCATGGAGACGTAAGCMat1-2-1RRNestTTGATCCCATCGAGACCAAAGAAGCXuHyRGTATTGACCGATTCCTTGCGGTCCGAAXuYgFGATGTAGGAGGGCGTGGATATGTCCTXu855RGCTGATCTGACCAGTTGCXu866FGTCGATGCGACGCAATCGT图2-1PCR扩增引物位置示意图Fig.2-1Schematicrepresentationoftheprimerpositions
18果生刺盘孢交配型基因MAT1-2-1的功能分析5.于接种后的第六天，观察发病状况并记录结果。2.3结果分析2.3.1果生刺盘孢ZW1104菌株MAT1-2-1蛋白序列的分析果生刺盘孢ZW1104菌株MAT1-2-1基因编码区长843bp，有两个内含子，外显子含一个726bp开放阅读框，编码241个氨基酸（图1）。编码蛋白序列144至220位为MATA_HMG(highmobilitygroup)box结构域（黄色区域），内含13个保守的DNA结合位点（红色），这些结构特征与已知MAT1-2-1蛋白一致。对NCBI数据库做BlastP比对，发现MAT1-2-1蛋白序列与果生刺盘孢MAT1-2-1最为接近。图2-1果生刺盘孢MAT1-2-1基因编码的预测蛋白序列。黄色区域为MATA_HMG(highmobilitygroup)box结构域，红色氨基酸为保守的DNA结合位点。Figure.2-1PredictedproteinsequenceencodedbytheColletotrichumfructicolaMAT1-2-1gene.MATA_HMG(highmobilitygroup)boxdomainishighlightedinyellowandtheconservedaminoacidsinvolvedinDNAbindingarehighlightedinred.将MAT1-2-1基因编码的蛋白与其在果生刺盘孢（Colletotrichumfructicola）、菜豆刺盘孢真菌（Colletotrichumlindemuthianum）尖孢镰刀菌（Fusariumoxysporum）、禾谷镰刀菌（Fusariumgraminearum）、冬虫夏草（Cordycepsmilitaris）、核盘菌（Sclerotiniasclerotiorum）、灰葡萄孢（Botrytiscinerea）、串孢镰刀菌（FusariumVerticillioides）、构巢曲霉（Aspergillusnidulans）、稻瘟菌（Magnaporthegrisea）、栗疫病菌（Cryphonectriaparasitica）、柄孢菌（Podosporaanserina）、大麦壳针孢（Septoriapasserinii）、蜂蜜球囊菌（Ascosphaeraapis）中的同源蛋白进行序列比对和系统进化树分析发现：其和果生刺盘孢（Colletotrichumfructicola）的亲缘关系最近。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetics and Molecular Marker Identification of a Resistance to Glomerella Leaf Spot in Apple[J]. LIU Yuanxia,LI Baohua,WANG Caihong,LIU Chunxiao,KONG Xianghua,ZHU Jun,DAI Hongyi. Horticultural Plant Journal. 2016(03)
[2]苹果对炭疽菌叶枯病抗性遗传的研究及其分子标记筛选[J]. 刘源霞,李保华,王彩虹,刘春晓,孔祥华,祝军,戴洪义. 园艺学报. 2015(11)
[3]子囊菌交配型基因MAT1-1的系统发育[J]. 王雪亮,史洋,张艳华,孙凤杰,潘洪玉. 菌物学报. 2015(06)
[4]苹果炭疽叶枯病病原学研究[J]. 王薇,符丹丹,张荣,孙广宇. 菌物学报. 2015(01)
[5]不同杀菌剂对苹果炭疽叶枯病的防治效果[J]. 王冰,王彩霞,史祥鹏,张振芳,李保华. 植物保护. 2014(06)
[6]炭疽菌叶枯病在我国苹果产区的发生分布及趋势分析[J]. 党建美,胡清玉,张瑜,王树桐,曹克强. 北方园艺. 2014(10)
[7]苹果炭疽菌叶枯病的研究初报[J]. 宋清,王素侠,杨春亮,贾德辉. 落叶果树. 2012(02)
[8]苹果新病害——炭疽菌叶枯病的发生与防控[J]. 孙共明,刘利民,朱其高,贾德辉,师忠轩,高付永. 果农之友. 2011(12)
博士论文
[1]中国苹果炭疽病病原菌的遗传多样性[D]. 符丹丹.西北农林科技大学 2014
硕士论文
[1]PEG介导的苹果果生刺盘孢Colletotrichum fructicola原生质体转化体系的研究[D]. 韩小路.西北农林科技大学 2015
[2]禾谷镰刀菌AMT1基因的功能研究[D]. 王光辉.西北农林科技大学 2010
本文编号：3285941
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
刺盘孢真菌独特的交配型位点基因结构
12果生刺盘孢交配型基因MAT1-2-1的功能分析GATGAGGTAG2.根据交配型MAT1-2-1基因及其上下游2000bp左右的序列，再结合潮霉素磷酸转移酶基因（hph）序列设计基因敲除载体构建所用的PCR扩增引物。引物序列见表2-1，图2-1显示引物的位置。表2-1交配型MAT1-2-1基因敲除和检测所用引物Table.2-1DesignedprimersusedforgeneratinganddetectinggeneknockoutmutantsofthematingtypegeneMAT1-2-1引物名称PrimerName引物序列Sequence(5’-3’)Mat1-2-1LFGGGAAATGATGGGGTTTCTAACTGCMat1-2-1LRAscIGCATTGGCGCGCCGGCGCAGACGTTGCTAGAATTATGGMat1-2-1RFNotIATAAGAATGCGGCCGCCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGMat1-2-1RRCAGGAGAACAAGGCTGCAGTGCTAGMat1-2-1DFGTTGCTGTCTCTCAGAAGGATTACCMat1-2-1DRCAATAGCGATGCCGTTGACCGAGACMat1-2-1LFNestTGCATGGTTGCATGGAGACGTAAGCMat1-2-1RRNestTTGATCCCATCGAGACCAAAGAAGCXuHyRGTATTGACCGATTCCTTGCGGTCCGAAXuYgFGATGTAGGAGGGCGTGGATATGTCCTXu855RGCTGATCTGACCAGTTGCXu866FGTCGATGCGACGCAATCGT图2-1PCR扩增引物位置示意图Fig.2-1Schematicrepresentationoftheprimerpositions
18果生刺盘孢交配型基因MAT1-2-1的功能分析5.于接种后的第六天，观察发病状况并记录结果。2.3结果分析2.3.1果生刺盘孢ZW1104菌株MAT1-2-1蛋白序列的分析果生刺盘孢ZW1104菌株MAT1-2-1基因编码区长843bp，有两个内含子，外显子含一个726bp开放阅读框，编码241个氨基酸（图1）。编码蛋白序列144至220位为MATA_HMG(highmobilitygroup)box结构域（黄色区域），内含13个保守的DNA结合位点（红色），这些结构特征与已知MAT1-2-1蛋白一致。对NCBI数据库做BlastP比对，发现MAT1-2-1蛋白序列与果生刺盘孢MAT1-2-1最为接近。图2-1果生刺盘孢MAT1-2-1基因编码的预测蛋白序列。黄色区域为MATA_HMG(highmobilitygroup)box结构域，红色氨基酸为保守的DNA结合位点。Figure.2-1PredictedproteinsequenceencodedbytheColletotrichumfructicolaMAT1-2-1gene.MATA_HMG(highmobilitygroup)boxdomainishighlightedinyellowandtheconservedaminoacidsinvolvedinDNAbindingarehighlightedinred.将MAT1-2-1基因编码的蛋白与其在果生刺盘孢（Colletotrichumfructicola）、菜豆刺盘孢真菌（Colletotrichumlindemuthianum）尖孢镰刀菌（Fusariumoxysporum）、禾谷镰刀菌（Fusariumgraminearum）、冬虫夏草（Cordycepsmilitaris）、核盘菌（Sclerotiniasclerotiorum）、灰葡萄孢（Botrytiscinerea）、串孢镰刀菌（FusariumVerticillioides）、构巢曲霉（Aspergillusnidulans）、稻瘟菌（Magnaporthegrisea）、栗疫病菌（Cryphonectriaparasitica）、柄孢菌（Podosporaanserina）、大麦壳针孢（Septoriapasserinii）、蜂蜜球囊菌（Ascosphaeraapis）中的同源蛋白进行序列比对和系统进化树分析发现：其和果生刺盘孢（Colletotrichumfructicola）的亲缘关系最近。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetics and Molecular Marker Identification of a Resistance to Glomerella Leaf Spot in Apple[J]. LIU Yuanxia,LI Baohua,WANG Caihong,LIU Chunxiao,KONG Xianghua,ZHU Jun,DAI Hongyi. Horticultural Plant Journal. 2016(03)
[2]苹果对炭疽菌叶枯病抗性遗传的研究及其分子标记筛选[J]. 刘源霞,李保华,王彩虹,刘春晓,孔祥华,祝军,戴洪义. 园艺学报. 2015(11)
[3]子囊菌交配型基因MAT1-1的系统发育[J]. 王雪亮,史洋,张艳华,孙凤杰,潘洪玉. 菌物学报. 2015(06)
[4]苹果炭疽叶枯病病原学研究[J]. 王薇,符丹丹,张荣,孙广宇. 菌物学报. 2015(01)
[5]不同杀菌剂对苹果炭疽叶枯病的防治效果[J]. 王冰,王彩霞,史祥鹏,张振芳,李保华. 植物保护. 2014(06)
[6]炭疽菌叶枯病在我国苹果产区的发生分布及趋势分析[J]. 党建美,胡清玉,张瑜,王树桐,曹克强. 北方园艺. 2014(10)
[7]苹果炭疽菌叶枯病的研究初报[J]. 宋清,王素侠,杨春亮,贾德辉. 落叶果树. 2012(02)
[8]苹果新病害——炭疽菌叶枯病的发生与防控[J]. 孙共明,刘利民,朱其高,贾德辉,师忠轩,高付永. 果农之友. 2011(12)
博士论文
[1]中国苹果炭疽病病原菌的遗传多样性[D]. 符丹丹.西北农林科技大学 2014
硕士论文
[1]PEG介导的苹果果生刺盘孢Colletotrichum fructicola原生质体转化体系的研究[D]. 韩小路.西北农林科技大学 2015
[2]禾谷镰刀菌AMT1基因的功能研究[D]. 王光辉.西北农林科技大学 2010
本文编号：3285941
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