大豆疫霉OG5 1 54821新型外泌蛋白家族部分成员功能鉴定和ADA2基因在植物免疫过程中的作用
发布时间:2021-07-18 14:25
大豆根腐病是大豆生产上的毁灭性病害之一,是一种典型的土传性病害,其中部分病害就是由大豆疫霉(Phytophthorasojae)侵染大豆引起的。由大豆疫霉单独引起的生产损失在世界范围内每年达到了 10-20亿美元。大豆疫霉隶属于卵菌,呈丝状生长,在进化上与藻类相近,但是与真菌相差甚远。生物信息学分析发现在大豆疫霉中存在超过400个RXLR效应分子。越来越多的研究证明,效应分子对于病原菌的侵染过程中发挥着至关重要的作用,能够从多个层面,以不同的机制完成侵染过程。利用植物表达载体对OG5<sub>154821外泌家族蛋白的功能进行研究。在大豆疫霉的基因组中存在着许多的外泌蛋白基因。除了典型的RXLR,CRN和NLP等家族外,还有许多功能未知的蛋白家族。通过生物信息学分析筛选到OG5154821外泌家族,在侵染过程中高表达。利用植物表达载体在烟草上过表达该家族的部分成员基因,筛选到候选效应分子Ps128701能够引起细胞坏死,SignalP3.0在线预测发现,该候选效应分子具有信号肽,利用酵母信号肽序列预测系统对其...
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:87 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-3?CRN类效应分子的结构分析
?下篇研宄内容?第一章大豆疫霉OG5_154821新型外泌蛋白家族功能鉴定???1.6利用酵母系统验证信号肽的功能??1.6.1重组质粒的构建??利用信号肽在线预测工具?Signal?P?3,0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0/)??对目的蛋白序列进行预测,然后将预测到的信号肽氨基酸残疾序列构建在??pSUC2T7M130RI(pSUC2)载体上,该载体含有一个缩短的逆转录酶基因SUC2,但??是缺少起始密码子和信号肽(Jacobs?a/.,1997),载体上含有EcoR?I和Xho丨两个??限制性内酶切位点用于将目的基因片段构建在载体上(图丨-1)。??
?1.9.2?SgRNA?的克隆??在大豆疫霉中,用pYF2.2-GFP-Ribo-gRNA作为sgRNA的载体图(图1-2),??RPL41为启动子,用RNA聚合酶II型调控元件来调控SgRNA的转录。同时在sgRNA??的5'和3'端同时引入了核糖酶来移除围绕在sgRNA周围的过多的核苷酸从而保证??sgRNA在转录过程中的准确性(图1-2)。核糖酶的设计是根据Gao?&?Zhao在2014年??发表的文章中提供的方法(Gao?2014)。从给出的图示中可以看到,两个剪刀状的??位置即为sgRNA的剪切位点。为了确保HH-Rjbo形成正确的二级结构来发挥核糖酶??功能,在我们设计靶标序列引物时,根据20?bp的靶序列,应在HH-Ribo区域的前??后设计6个碱基的互补序列,如图1-3中绿色标记的碱基序列所示。??p-?.h?y????pYF2.2-GfP-Ribo-gRNA??UA?^?产3,??G?G?AU?—〇?/??A?C?C-G?G—C??r、U?G-C\?U-?A??C?C?G-c\?C-G??C-G?\?C-G??AAA''Uf,?_?\r-c?\?A-u??〇A?G?
本文编号:3289754
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:87 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-3?CRN类效应分子的结构分析
?下篇研宄内容?第一章大豆疫霉OG5_154821新型外泌蛋白家族功能鉴定???1.6利用酵母系统验证信号肽的功能??1.6.1重组质粒的构建??利用信号肽在线预测工具?Signal?P?3,0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0/)??对目的蛋白序列进行预测,然后将预测到的信号肽氨基酸残疾序列构建在??pSUC2T7M130RI(pSUC2)载体上,该载体含有一个缩短的逆转录酶基因SUC2,但??是缺少起始密码子和信号肽(Jacobs?a/.,1997),载体上含有EcoR?I和Xho丨两个??限制性内酶切位点用于将目的基因片段构建在载体上(图丨-1)。??
?1.9.2?SgRNA?的克隆??在大豆疫霉中,用pYF2.2-GFP-Ribo-gRNA作为sgRNA的载体图(图1-2),??RPL41为启动子,用RNA聚合酶II型调控元件来调控SgRNA的转录。同时在sgRNA??的5'和3'端同时引入了核糖酶来移除围绕在sgRNA周围的过多的核苷酸从而保证??sgRNA在转录过程中的准确性(图1-2)。核糖酶的设计是根据Gao?&?Zhao在2014年??发表的文章中提供的方法(Gao?2014)。从给出的图示中可以看到,两个剪刀状的??位置即为sgRNA的剪切位点。为了确保HH-Rjbo形成正确的二级结构来发挥核糖酶??功能,在我们设计靶标序列引物时,根据20?bp的靶序列,应在HH-Ribo区域的前??后设计6个碱基的互补序列,如图1-3中绿色标记的碱基序列所示。??p-?.h?y????pYF2.2-GfP-Ribo-gRNA??UA?^?产3,??G?G?AU?—〇?/??A?C?C-G?G—C??r、U?G-C\?U-?A??C?C?G-c\?C-G??C-G?\?C-G??AAA''Uf,?_?\r-c?\?A-u??〇A?G?
本文编号:3289754
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