陕西榆林地区马铃薯腐烂茎线虫的特异性分子鉴定
发布时间:2021-07-20 17:04
旨在对陕西榆林8个县区马铃薯腐烂茎线虫群体进行特异性分子鉴定,明确该地区线虫病害的种群类型,为马铃薯腐烂茎线虫病的快速诊断和及时防控提供理论依据。采用通用引物rDNA1/rDNA2和特异性引物DdS1/DdS2 (A型)、DdL1/DdL2(B型)进行基因扩增、测序、序列分析并构建系统发育树,对线虫种类进行鉴定。结果显示,陕西榆林8个采样点线虫病害种类均为马铃薯腐烂茎线虫B型,并且这8个地理种群的马铃薯腐烂茎线虫具有较高的亲缘关系。
【文章来源】:陕西农业科学. 2020,66(03)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
通用引物扩增的rDNA-ITS序列凝胶电泳图
采用特异性引物DdS1/DdS2和DdL1/DdL2分别进行PCR,结果显示扩增出485 bp条带,无252 bp条带(图2)。采用特异性引物对陕西8个地区的马铃薯腐烂茎线虫进行分型鉴定,结果均为B型,与上述通用引物PCR扩增鉴定的结果一致。2.3 马铃薯茎线虫rDNA-ITS序列分析
特异性引物PCR扩增产物的测序结果显示,序列1~8与马铃薯腐烂茎线虫的同源性均达到99%以上。将榆林地区8个种群的特异性引物扩增序列与GenBank中7个国内外马铃薯腐烂茎线虫种群(EF062575、AM232227、AY987007、EF062572、FJ911551、KC923223、EF062574)的rDNA-ITS序列进行ClustalX比对分析并构建系统发育树。结果显示,在亲缘关系上所有的序列聚为3个分支,获得的榆林地区8个种群中,1、2、3、4、5、8和EF062575、AM232227群体聚为一个分支,6和KC923223、EF062574群体聚为一个分支,7和EF062572、AY987007、FJ911551群体聚为一个分支,榆林地区8个地理种群的马铃薯腐烂茎线虫具有较高的亲缘关系。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]甘肃定西地区马铃薯线虫病病原的分离鉴定[J]. 李惠霞,徐鹏刚,李健荣,坚晋卓,赵鹏,彭德良. 植物保护学报. 2016(04)
[2]完善马铃薯种薯质量监督控制体系 服务马铃薯主粮战略[J]. 赵建宗. 种子世界. 2015(03)
[3]腐烂茎线虫种群分化现状研究[J]. 王宏宝,李茹,魏利辉,陈香华,赵桂东,林茂松. 江西农业学报. 2011(01)
[4]甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因Dd-ace-1全长cDNA的克隆和序列分析[J]. 丁中,彭德良,高必达,何琪. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2010(04)
[5]危害马铃薯的茎线虫分离鉴定[J]. 郭全新,简恒. 植物保护. 2010(03)
[6]马铃薯腐烂线虫不同群体同工酶表型与致病力研究[J]. 王宏宝,戚龙君,王金成,宋绍祎,林茂松. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2009(04)
[7]马铃薯腐烂茎线虫28S rDNA-D2/D3区序列分析[J]. 于海英,彭德良,胡先奇,黄文坤. 植物病理学报. 2009(03)
[8]马铃薯腐烂茎线虫特异性分子检测技术研究[J]. 宛菲,彭德良,杨玉文,何月秋. 植物病理学报. 2008(03)
[9]腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育[J]. 王金成,季镭,黄国明,杨秀丽,林茂松. 河北农业大学学报. 2007(05)
[10]《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》发布[J]. 刘刚. 农药市场信息. 2007(13)
硕士论文
[1]马铃薯腐烂茎线虫的鉴定及分子检测[D]. 刘先宝.华南热带农业大学 2006
本文编号:3293230
【文章来源】:陕西农业科学. 2020,66(03)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
通用引物扩增的rDNA-ITS序列凝胶电泳图
采用特异性引物DdS1/DdS2和DdL1/DdL2分别进行PCR,结果显示扩增出485 bp条带,无252 bp条带(图2)。采用特异性引物对陕西8个地区的马铃薯腐烂茎线虫进行分型鉴定,结果均为B型,与上述通用引物PCR扩增鉴定的结果一致。2.3 马铃薯茎线虫rDNA-ITS序列分析
特异性引物PCR扩增产物的测序结果显示,序列1~8与马铃薯腐烂茎线虫的同源性均达到99%以上。将榆林地区8个种群的特异性引物扩增序列与GenBank中7个国内外马铃薯腐烂茎线虫种群(EF062575、AM232227、AY987007、EF062572、FJ911551、KC923223、EF062574)的rDNA-ITS序列进行ClustalX比对分析并构建系统发育树。结果显示,在亲缘关系上所有的序列聚为3个分支,获得的榆林地区8个种群中,1、2、3、4、5、8和EF062575、AM232227群体聚为一个分支,6和KC923223、EF062574群体聚为一个分支,7和EF062572、AY987007、FJ911551群体聚为一个分支,榆林地区8个地理种群的马铃薯腐烂茎线虫具有较高的亲缘关系。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]甘肃定西地区马铃薯线虫病病原的分离鉴定[J]. 李惠霞,徐鹏刚,李健荣,坚晋卓,赵鹏,彭德良. 植物保护学报. 2016(04)
[2]完善马铃薯种薯质量监督控制体系 服务马铃薯主粮战略[J]. 赵建宗. 种子世界. 2015(03)
[3]腐烂茎线虫种群分化现状研究[J]. 王宏宝,李茹,魏利辉,陈香华,赵桂东,林茂松. 江西农业学报. 2011(01)
[4]甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因Dd-ace-1全长cDNA的克隆和序列分析[J]. 丁中,彭德良,高必达,何琪. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2010(04)
[5]危害马铃薯的茎线虫分离鉴定[J]. 郭全新,简恒. 植物保护. 2010(03)
[6]马铃薯腐烂线虫不同群体同工酶表型与致病力研究[J]. 王宏宝,戚龙君,王金成,宋绍祎,林茂松. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2009(04)
[7]马铃薯腐烂茎线虫28S rDNA-D2/D3区序列分析[J]. 于海英,彭德良,胡先奇,黄文坤. 植物病理学报. 2009(03)
[8]马铃薯腐烂茎线虫特异性分子检测技术研究[J]. 宛菲,彭德良,杨玉文,何月秋. 植物病理学报. 2008(03)
[9]腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育[J]. 王金成,季镭,黄国明,杨秀丽,林茂松. 河北农业大学学报. 2007(05)
[10]《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》发布[J]. 刘刚. 农药市场信息. 2007(13)
硕士论文
[1]马铃薯腐烂茎线虫的鉴定及分子检测[D]. 刘先宝.华南热带农业大学 2006
本文编号:3293230
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3293230.html
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