烟草丛顶病毒不依赖帽子翻译机制的RNA结构基础与分子进化
发布时间：2021-08-14 18:24
烟草丛顶病毒（Tobacco bushy top virus,TBTV）属于番茄丛矮病毒科幽影病毒属,基因组由一条正义单链RNA（+ssRNA）组成,全长约4,152 nt。5’端缺乏帽子结构（m7GPPPN）,3’末端也不带poly（A）尾,编码4个ORF,包括复制酶组分p35蛋白及其-1位移码产物p98蛋白（RNA依赖RNA聚合酶,RdRp）,运动蛋白p26和p27。前人研究表明,TBTV基因组的3’UTR含有不依赖帽子翻译元件BTE,可以调控报告基因的表达。本文分析了BTE在全长TBTV中对p35蛋白翻译的调控作用以及对TBTV在BY-2原生质体中的RNA积累的作用。另外从中国云南地区克隆了3个新的TBTV弱毒分离物,发现其p35表达量相对于野生型（TBTV-Ch）明显降低,且p35表达量降低与BTE元件的结构变异相关。利用体外翻译系统WGE,以TBTV基因组全长RNA为材料全面分析其不依赖帽子翻译,发现TBTV基因组中除BTE外还存在至少1种类型的不依赖帽子翻译元件。具体结果如下:（1）TBTV全基因组克隆及分子进化:通过5’RACE和3’RACE结合一步RT-PCR的方法,克...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：115 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
真核细胞mRNA翻译模式图（Jacksonetal.,2005；Dresiosetal.,2006；Deforgesetal.,2015）
山东农业大学博士学位论文仅可以与 eIF4F 互作，还和 5’UTR 存在远距离的 RNA-RNA 互作，将 eIF4F 传递到 5’末端以高效的起始翻译（Nicholson et al., 2010）。玉米坏死条纹病毒的 5’端也会形成类似 TBSV 5’端形成的 T 型结构域，并且和其不依赖帽子翻译调控元件（I-Shape结构）存在远距离的RNA-RNA互作（Miller et al., 2007）。
图 1-3 结构分析原理图（Soukup and Breaker, 2009；Wilkinsone et al., 2006；Smola et al., 2015）A. 分子内转酯反应；B. NMIA 修饰后形成稳定的复合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 烟草丛顶病毒的研究进展烟草丛顶病是近年来我国云南西部烟区频繁爆发流行的一种烟草病害（李凡等，2001），感病烟株叶色淡绿或黄化，并伴有系统坏死枯斑或坏死线纹，苗期感病烟株严重矮化、缩顶，晚期感病烟株腋芽过度增生。烟草丛顶病最早发生在津巴布韦，对该国的烟草生产造成了严重威胁（Ndowora et al., 2002）。另外，烟草丛顶病还引起了几次大规模的损失，包括 1960 年在非洲南部国家（Gates et al., 1962）和 1990 年在中国云南省的大爆发（Chen et al., 2006）。从 1993 到 2001 年间，烟草从顶病造成我国云南烟区的 51,300 公顷烟草感染病害，直接经济损失近千万（Mo et al., 2003）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]2种类型的烟草扭脉病毒外壳蛋白基因的序列和结构分析[J]. 张振甲,王德亚,于成明,王增辉,师科荣,李凡,原雪峰. 植物病理学报. 2016(02)
[2]烟草丛顶病毒ORF1蛋白的多克隆抗体制备及应用[J]. 王国鲁,王德亚,于成明,原雪峰. 植物病理学报. 2016(01)
[3]烟草丛顶病穴TBTV雪传毒特性及寄主范围研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王晓云,谭仲夏. 中国烟草科学. 2003(04)
[4]云南烟草丛枝症病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡红,陈海如,李德葆. 植物病理学报. 2001(04)
本文编号：3342962
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：115 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
真核细胞mRNA翻译模式图（Jacksonetal.,2005；Dresiosetal.,2006；Deforgesetal.,2015）
山东农业大学博士学位论文仅可以与 eIF4F 互作，还和 5’UTR 存在远距离的 RNA-RNA 互作，将 eIF4F 传递到 5’末端以高效的起始翻译（Nicholson et al., 2010）。玉米坏死条纹病毒的 5’端也会形成类似 TBSV 5’端形成的 T 型结构域，并且和其不依赖帽子翻译调控元件（I-Shape结构）存在远距离的RNA-RNA互作（Miller et al., 2007）。
图 1-3 结构分析原理图（Soukup and Breaker, 2009；Wilkinsone et al., 2006；Smola et al., 2015）A. 分子内转酯反应；B. NMIA 修饰后形成稳定的复合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 烟草丛顶病毒的研究进展烟草丛顶病是近年来我国云南西部烟区频繁爆发流行的一种烟草病害（李凡等，2001），感病烟株叶色淡绿或黄化，并伴有系统坏死枯斑或坏死线纹，苗期感病烟株严重矮化、缩顶，晚期感病烟株腋芽过度增生。烟草丛顶病最早发生在津巴布韦，对该国的烟草生产造成了严重威胁（Ndowora et al., 2002）。另外，烟草丛顶病还引起了几次大规模的损失，包括 1960 年在非洲南部国家（Gates et al., 1962）和 1990 年在中国云南省的大爆发（Chen et al., 2006）。从 1993 到 2001 年间，烟草从顶病造成我国云南烟区的 51,300 公顷烟草感染病害，直接经济损失近千万（Mo et al., 2003）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]2种类型的烟草扭脉病毒外壳蛋白基因的序列和结构分析[J]. 张振甲,王德亚,于成明,王增辉,师科荣,李凡,原雪峰. 植物病理学报. 2016(02)
[2]烟草丛顶病毒ORF1蛋白的多克隆抗体制备及应用[J]. 王国鲁,王德亚,于成明,原雪峰. 植物病理学报. 2016(01)
[3]烟草丛顶病穴TBTV雪传毒特性及寄主范围研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王晓云,谭仲夏. 中国烟草科学. 2003(04)
[4]云南烟草丛枝症病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡红,陈海如,李德葆. 植物病理学报. 2001(04)
本文编号：3342962
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