美国大豆中大豆脉坏死病毒检疫鉴定

发布时间：2021-08-21 06:27

　　大豆脉坏死病毒（soybean vein necrosis virus,SVNV）在北美大豆种植区大范围流行,我国尚无该病毒报道。本研究通过RT-PCR、DAS-ELISA以及序列比对分析等方法,在一批美国进口大豆中检出SVNV。这是全国口岸首次截获SVNV。 

【文章来源】：植物检疫. 2020,34(05)北大核心

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

一步法RT-PCR扩增结果

测序结果表明，SV-8726的SVNV-NP-f/SVNV-NP-r扩增片段大小为239 bp,SVNV-F/SVNV-R扩增片段为699 bp（图2）。通过NCBI Blastn比对，SVNV-NP-f/SVNV-NP-r片段与SVNV NP基因序列（MH029494.1）相似性最高，两者相差4个碱基，序列相似度为99.16%。SVNV-F/SVNV-R片段与SVNV NP基因序列（KJ955719.1）相似性最高，两者相差5个碱基，序列相似度为99.28%，确定SV-8726为SVNV。以SVNV-F/SVNV-R扩增序列构建系统发育树（图3），结果显示本次在美国大豆中检出的SV-8726与GenBank中SVNV独自聚为一支，其相似度达98.14%～99.28%；与同属其他病毒相似度相对较低，其中与BeNMV(JN587268.1）相似度为71.43%,TCSV(AF413110.1）为77.03%,TSWV(MF326511.1）为73.81%，而与其他属病毒关系较远，进一步表明SV-8726为SVNV。图3 基于SVNV NP序列构建的系统发育树

基于SVNV NP序列构建的系统发育树

【参考文献】：
期刊论文
[1]美国进口大豆中菜豆荚斑驳病毒和玉米褪绿斑驳病毒的检疫鉴定[J]. 柳吉芹,王立杉,吴曦,钱云开,高飞,王海洋.  植物检疫. 2019(03)
[2]小麦线条花叶病毒研究进展[J]. 王佳莹,崔俊霞,张吉红,陈先锋,黄素文.  植物检疫. 2018(03)



本文编号：3355063