烟草丛顶病毒RNA依赖RNA聚合酶的-1型移码翻译机制研究
发布时间：2021-08-21 07:56
烟草丛顶病是由番茄丛矮病毒科（Tombusviridae）幽影病毒属（Umbravirus）成员烟草丛顶病毒（Tobacco bushy top virus,TBTV）和黄症病毒科（Luteoviridae）成员烟草扭脉病毒（Tobacco vein distorting virus,TVDV）复合侵染引起的一种系统性侵染病害。TBTV基因组为一条正义单链RNA,全长4,152个核苷酸,5’端没有帽子,3’端没有poly（A）尾,共有4个开放阅读框（ORF）。ORF1编码35 KDa蛋白,ORF1的C末端与ORF2的N端有8个密码子的重叠区,ORF2编码63 KDa蛋白。ORF1通过-1位的移码翻译机制表达产生TBTV RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase,RdRp）,其分子量约等于ORF1和ORF2的分子量之和。本研究在已经完成TBTV RdRp-1位移码翻译表达的定性分析基础上,主要对TBTV RdRp的-1位移码翻译机制的多层次调控元件进行定位和结构特征分析。首先通过序列分析,初步定位了-1型移码必需的七核苷酸滑动序列（特征为:XXx...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：112 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
RNA病毒采用的常规和非常规翻译机制示意图(FirthandBrierley,2012)
Hentze et al., 1997; Le et al., 1997; Dreher and Miller, 2006; Wang et al., 2009）。翻译过程包括四个步骤：翻译的起始，蛋白的延伸，翻译的终止，以及核糖体的再循环(图 1-2)。图1-2 真核生物mRNA的翻译机制示意图（Dreher and Miller, 2006）Fig.1-2 Translational mechanism in eukaryotic mRNAs.1.2.1 翻译的起始真核生物的蛋白翻译起始是由许多翻译起始因子（eIF）调控的。首先是翻译起始因子（eIF）4E 识别并结合 5’端帽子结构然后招募 eIF4G，继续结合 eIF4A、eIF4B 以及poly（A）结合蛋白（PABP），最终使得 mRNA 连同核糖体形成一个环状结构复合体。核糖体 40S 亚基与各种翻译起始因子 eIF3，eIF1，eIF1A，eIF5 以及 eIF2-Met-tRNAi-GTP结合形成 43S 核糖体复合物。在翻译起始因子 eIF4G 和 eIF3 的作用下，43S 核糖体复合物与环状结构复合体结合，核糖体被招募到 mRNA 的 5’端并在解旋酶 eIF4A 和辅助因子 eIF4B 的作用下沿 mRNA 的 5’→3’方向滑动
图1-3四种不同类型的IRES元件（Jeffrey, 2008）Fig.1-3 Four different IRES groups.1.3.2 渗漏扫描（Leaky scanning）策略渗漏扫描是一种翻译同一条 mRNA 链上具有重叠区开放阅读框（O立的两个蛋白时发生的翻译机制。在蛋白翻译的起始阶段，40S 核糖体亚的帽子结构之后，会沿着 mRNA 从 5’端往 3’端方向扫描，直到遇到起始开始翻译（Kozak, 2002）。但是在有些情况下，会有一定比例的核糖体在始密码子时不发生翻译的起始，而是继续向 3’端方向滑动，直到遇到后面才开始进行翻译（Kozak, 2002）（图 1-4），这种翻译的起始机制便是渗扫描的最终结果是表达两个相互独立的蛋白，这两个蛋白可以是 C 末端重开放阅读框中的不同起始位点），可以是两个有重叠区的 ORF（不同的也可以是两个没有重叠区而是顺序性的开放阅读框（Andrew E. Firth a
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草丛顶病毒ORF1蛋白的多克隆抗体制备及应用[J]. 王国鲁,王德亚,于成明,原雪峰. 植物病理学报. 2016(01)
[2]ICTV第九次报告以来的植物病毒分类系统[J]. 洪健,周雪平. 植物病理学报. 2014(06)
[3]ICTV第九次报告对病毒分类系统的一些修改[J]. 张忠信. 病毒学报. 2012(05)
[4]烟草丛顶病毒（TBTV）ORF3和ORF4的原核表达、抗血清制备及应用[J]. 龙亚芹,王万东,左瑞娟,李凡,尹朝先,陈海如. 农业生物技术学报. 2011(02)
[5]TBTV卫星RNA不同分离物的序列测定及系统进化分析[J]. 尹朝先,包娜,冉志伟,陈海如,李凡. 云南农业大学学报(自然科学版). 2010(06)
[6]我国植物病毒学的研究现状及发展策略[J]. 李大伟. 植物保护. 2010(02)
[7]烟草丛顶病研究进展[J]. 李凡,吴建宇,陈海如. 植物病理学报. 2005(05)
[8]烟草丛顶病在中国的发现及研究进展[J]. 秦西云. 中国烟草科学. 2005(03)
[9]烟草丛顶病穴TBTV雪传毒特性及寄主范围研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王晓云,谭仲夏. 中国烟草科学. 2003(04)
[10]云南烟草丛枝症病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡红,陈海如,李德葆. 植物病理学报. 2001(04)
本文编号：3355202
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：112 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
RNA病毒采用的常规和非常规翻译机制示意图(FirthandBrierley,2012)
Hentze et al., 1997; Le et al., 1997; Dreher and Miller, 2006; Wang et al., 2009）。翻译过程包括四个步骤：翻译的起始，蛋白的延伸，翻译的终止，以及核糖体的再循环(图 1-2)。图1-2 真核生物mRNA的翻译机制示意图（Dreher and Miller, 2006）Fig.1-2 Translational mechanism in eukaryotic mRNAs.1.2.1 翻译的起始真核生物的蛋白翻译起始是由许多翻译起始因子（eIF）调控的。首先是翻译起始因子（eIF）4E 识别并结合 5’端帽子结构然后招募 eIF4G，继续结合 eIF4A、eIF4B 以及poly（A）结合蛋白（PABP），最终使得 mRNA 连同核糖体形成一个环状结构复合体。核糖体 40S 亚基与各种翻译起始因子 eIF3，eIF1，eIF1A，eIF5 以及 eIF2-Met-tRNAi-GTP结合形成 43S 核糖体复合物。在翻译起始因子 eIF4G 和 eIF3 的作用下，43S 核糖体复合物与环状结构复合体结合，核糖体被招募到 mRNA 的 5’端并在解旋酶 eIF4A 和辅助因子 eIF4B 的作用下沿 mRNA 的 5’→3’方向滑动
图1-3四种不同类型的IRES元件（Jeffrey, 2008）Fig.1-3 Four different IRES groups.1.3.2 渗漏扫描（Leaky scanning）策略渗漏扫描是一种翻译同一条 mRNA 链上具有重叠区开放阅读框（O立的两个蛋白时发生的翻译机制。在蛋白翻译的起始阶段，40S 核糖体亚的帽子结构之后，会沿着 mRNA 从 5’端往 3’端方向扫描，直到遇到起始开始翻译（Kozak, 2002）。但是在有些情况下，会有一定比例的核糖体在始密码子时不发生翻译的起始，而是继续向 3’端方向滑动，直到遇到后面才开始进行翻译（Kozak, 2002）（图 1-4），这种翻译的起始机制便是渗扫描的最终结果是表达两个相互独立的蛋白，这两个蛋白可以是 C 末端重开放阅读框中的不同起始位点），可以是两个有重叠区的 ORF（不同的也可以是两个没有重叠区而是顺序性的开放阅读框（Andrew E. Firth a
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草丛顶病毒ORF1蛋白的多克隆抗体制备及应用[J]. 王国鲁,王德亚,于成明,原雪峰. 植物病理学报. 2016(01)
[2]ICTV第九次报告以来的植物病毒分类系统[J]. 洪健,周雪平. 植物病理学报. 2014(06)
[3]ICTV第九次报告对病毒分类系统的一些修改[J]. 张忠信. 病毒学报. 2012(05)
[4]烟草丛顶病毒（TBTV）ORF3和ORF4的原核表达、抗血清制备及应用[J]. 龙亚芹,王万东,左瑞娟,李凡,尹朝先,陈海如. 农业生物技术学报. 2011(02)
[5]TBTV卫星RNA不同分离物的序列测定及系统进化分析[J]. 尹朝先,包娜,冉志伟,陈海如,李凡. 云南农业大学学报(自然科学版). 2010(06)
[6]我国植物病毒学的研究现状及发展策略[J]. 李大伟. 植物保护. 2010(02)
[7]烟草丛顶病研究进展[J]. 李凡,吴建宇,陈海如. 植物病理学报. 2005(05)
[8]烟草丛顶病在中国的发现及研究进展[J]. 秦西云. 中国烟草科学. 2005(03)
[9]烟草丛顶病穴TBTV雪传毒特性及寄主范围研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王晓云,谭仲夏. 中国烟草科学. 2003(04)
[10]云南烟草丛枝症病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡红,陈海如,李德葆. 植物病理学报. 2001(04)
本文编号：3355202
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