芽胞杆菌YL1的分类鉴定及其次级代谢产物分离纯化分析

发布时间：2021-09-05 10:24

　　本实验从污染的黑曲霉平板上分离到一株菌,该菌对黑曲霉有很强抑制效果。通过平板对峙法和牛津杯法检测到了该菌的发酵液对各种植物病原菌如立枯丝核菌和水稻黄单胞菌等有很明显的抑制效果。由此可知该菌在农业植物病防治和水果保藏方面有重要的应用价值。为进一步了解该菌,本论文通过分类学、生物信息学、分离纯化和初步鉴定等技术对该菌进行了阐述,其研究内容如下:1.从基因型特征上,确定了所分离获得的菌株YL1为Bacillus velezensis。16S rDNA序列比对结果显示:其与Bacillus velezensis CR-502相似度为99.85%。通过基因组中平均核苷酸一致性（ANI）比对发现:该菌株与Bacillus velezensis CR-502同源性为98.29%,确定该菌株与Bacillus velezensis CR-502为同一个种。由于菌株不同,将此菌株命名为Bacillus velezensis YL1。2.获得Bacillus velezensis YL1全基因序列并预测其可能产生的抗生素。通过第二代基因组测序拼接获得该菌株的基因组草图,然后利用antismash网站对基因... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：71 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

非核糖体合成肽类抗生素以及合成的NRPSs的基因结构

R 克隆 16S rRNA 后跑琼脂糖 DNAMarker，条带位于 100ose gel detection result of 16Sarker 条带对比可知，其片段rRNA 长度范围内。然后对目常会有两端测不准的情况，，转化至 E. Coli DH5α菌株的 16S rRNA 全长为 1,393 bpzTaxon server 对所测得的 16株 YL116S rRNA 序列比对

度来进行分类的方法，即 ANI 相似度在 96％以上时被认为是同一种菌。如表 3.示，这株菌YL1与Bacillus velezensis CR-502同源性为98.29％且与Bacillus velezeCR-502 相似度为 99.85％，即可以确定株菌 YL1 与 Bacillus velezensis CR-502 为胞杆菌属的同一个种。由于菌株不一样，因此将株菌 YL1 命名为 Bacillus velezeYL1。3.1.3 形态学特征Bacillus velezensis YL1 菌株在 LB 平板上划线生长 24h 即可看到单菌落，直3mm 左右，表面粗糙，中间凹陷，边缘有褶皱，菌落不透明白色，与枯草芽胞杆菌落形态具有相似的特征。其单细胞通过戊二醛固定，通过扫描电镜放大 10 倍，测结构如图 3.3 所示。

【参考文献】：
期刊论文
[1]白菜黑斑病拮抗细菌Bacillus velezensis DL-59的筛选鉴定及田间防效实验[J]. 杜淑涛,李术娜,朱宝成.  河北农业大学学报. 2010(06)
[2]番茄灰霉病拮抗细菌的筛选与X-75菌株鉴定[J]. 王伟,李术娜,李红亚,郝志敏,王全,王树香,朱宝成.  园艺学报. 2010(02)
[3]生防枯草芽孢杆菌的研究进展[J]. 李晶,杨谦.  安徽农业科学. 2008(01)
[4]微生物菌种对大庆原油的降解作用[J]. 伍晓林,侯兆伟,陈坚,伦世仪.  大庆石油学院学报. 2004(06)



本文编号：3385177