基于交互度的层次聚类算法在紫茎泽兰种群基因流中应用与研究

发布时间：2021-09-23 15:00

　　同种或不同种的生物种群之间存在基因的交流,这种交流是指某一生物种群的遗传信息从该种群流向其他种群的过程。基因流可以揭示生物种群之间的亲缘关系,计算种群的传播速度、传播距离、定居过程以及预测种群未来的扩散趋势等。目前,在生物学领域对基因流的研究方法比较单一。Structure模型聚类是该领域中使用频率最高的一种研究方法,该方法是基于K-means算法的一种聚类算法。聚类开始前需要计算△K来预算所聚类的个数。然而在实际应用中,△K的值与所聚类的结果往往存在差异。在对聚类的结果分析时,并不能保证所聚类结果在生物学领域中的表达是否准确、合理。因此,本文提出基于交互度的层次聚类算法,并应用于基因流的研究,与Structure模型聚类算法相对比分析两种算法之间的优略。紫茎泽兰是极具危害性的恶性杂草,属于入侵生物。20世纪40年代由中缅边境传入中国云南南部。紫茎泽兰的入侵趋势和危害性日益严峻,严重影响和破坏当地的人畜健康和农林业、畜牧业的发展。仅云南省危害发生的总面积已达6.4万km2,给西南地区带来了巨大的经济损失。选择云南怒江河谷北段中紫茎泽兰的12个母本种群和子代种群个体的基因位点为数据样本。... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３：交互度示例一??

图５：簇之间的交互度??

图６：存在无交互顶点的簇之间的交互度??

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3405918