华南地区甘薯病毒病调查及其分子检测体系的建立
发布时间：2021-10-07 15:07
我国作为世界上最大的甘薯生产国,由于生产上长期采用无性繁殖,甘薯产量和品质受到病毒病的严重影响,甚至引起种性退化。种植脱毒种苗是目前防治病毒病提高甘薯产量最有效的措施之一。明确主要的甘薯病毒种类,建立灵敏高效的病毒检测技术在培育脱毒种苗中起至关重要的作用。华南地区是我国主要的甘薯产区之一,病毒病对甘薯的危害十分严重。本论文对华南地区三个省（区）十二个地区的甘薯病毒病进行调查和样品采集,运用小RNA深度测序技术和RT-PCR检测技术相结合的方法,鉴定出侵染华南地区甘薯的主要病毒种类,并建立同步检测7种甘薯病毒的多重RT-PCR检测技术,为脱毒甘薯种苗生产奠定技术基础。取得以下结果:1.对华南三省区12个甘薯种植区进行了病毒病调查。结果表明,各地甘薯均受到病毒病危害,田间病株率为1.6%51.7%不等,症状通常表现为褪绿斑点、明脉、皱缩、紫色斑驳、花叶、卷叶等,以褪绿斑点、紫色斑驳为主。2.利用小RNA深度测序技术鉴定了华南地区主要甘薯病毒种类。在广州和湛江地区的13个混样中检测到9种甘薯病毒,包括7种RNA病毒:甘薯褪绿斑病毒（SPCFV）、甘薯羽状斑驳病毒（SPF...
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甘薯样品采样地点分布图
结果表明，华南各地甘薯均有病毒病发生，病株率2.0％到50.0％不等，症状主要表现为褪绿斑驳、明脉、紫色斑驳、皱缩、畸形和花叶等症状，其中以褪绿斑驳最为常见（图3-1，表3-1）。不同地区田间甘薯的发病情况有所差异，其中发病情况最为严重的为广东梅州，其次为海南保亭，田间发病最轻的地区为广东惠州。总的来讲，在病毒侵染初期，大多数病株的叶片表现为不典型的褪绿斑或明脉，随着病程发展，不同品种症状表现有所差异，有的发展为斑驳花叶、褪绿斑，紫色素较重品种则常表现为紫色环斑、紫色斑驳。在调查的各个地区中，田间普遍存在褪绿斑点和紫色斑驳的典型症状，多数病株为几种症状混合发生。图 3-1 甘薯病毒病田间叶片症状图注：（A）：紫斑
电泳结果表明，从中可检测出 7 种 RNA 病毒（图 2A，Lane2-8）和 2 种毒（图 2B，Lane2-3），PCR 产物测序结果表明，所获得的扩增产物序列与基因组片段高度同源，核苷酸同一率在 92%至 100%之间。表 3-2 小 RNA 深度测序拼接片段比对病毒种类及基因组覆盖位点和覆毒种 病毒科 病毒属 总覆盖率对应病毒同源序列起始位点终止位点weet potato virus G Potyviridae Potyvirus 70.67% 1222 weet potato virus C Potyviridae Potyvirus 62.37% 1962 weet potato latent virus Potyviridae Potyvirus 38.67% 1986 weet potato feathery mottle virus Potyviridae Potyvirus 51.00% 1964 weet potato leafcurl virus Geminiviridae Begomovirus 22.50% 1416 weet potato golden vein virus Geminiviridae Begomovirus 9.77% 580 weet potato chlorotic fleck virus Betaflexiviridae Carlavirus 21.62% 217
【参考文献】：
期刊论文
[1]三种甘薯病毒多重RT-PCR检测技术的建立[J]. 蒋素华,程喜梅,宋彩霞,许申平,梁芳,崔波. 植物保护. 2017(01)
[2]甘薯病毒病防控措施研究进展与展望[J]. 董芳,张超凡. 作物杂志. 2016(03)
[3]广西甘薯病毒病的病原病毒种类检测[J]. 黄利利,Pham Binhdan,何芳练,刘奕君,刘义明,陈保善,廖咏梅. 基因组学与应用生物学. 2016(05)
[4]2014年广东甘薯产业发展形势与对策建议[J]. 李向伟,万忠,柯清标,谭俊. 广东农业科学. 2015(11)
[5]云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析[J]. 包改丽,左瑞娟,饶维力,LI Ru-Hui,李凡. 微生物学通报. 2013(02)
[6]马铃薯Y病毒病的检测技术及防治策略[J]. 贾霁,肖启明,刘剑峰,周志成,刘双清,唐前君. 园艺与种苗. 2013(01)
[7]葡萄卷叶伴随病毒4和5简并引物和多重PCR检测[J]. 范旭东,董雅凤,张尊平,任芳,裴光前. 植物保护. 2012(06)
[8]海南省甘薯产业发展调研报告[J]. 朱红林,陈健晓,王效宁,孟卫东. 热带农业科学. 2012(06)
[9]中国甘薯病毒种类的血清学和分子检测[J]. 乔奇,张振臣,张德胜,秦艳红,田雨婷,王永江. 植物病理学报. 2012(01)
[10]4种大豆种传病毒多重RT-PCR检测[J]. 李孝军,殷汉华,陈宇,王筱筱,陈峰,叶露飞,杨赛军. 植物检疫. 2011(06)
硕士论文
[1]多重PCR检测三种小麦病毒及小麦黄花叶病毒全基因组序列分析[D]. 魏姣.山东农业大学 2015
[2]西瓜病毒病的田间调查及多重RT-PCR同步检测[D]. 王威麟.西北农林科技大学 2010
[3]三种甘薯病毒多重RT-PCR检测方法的建立及甘薯脉花叶病毒（SPVMV）的分子鉴定[D]. 张业辉.河南农业大学 2009
[4]甘薯茎尖脱毒、快繁技术及其脱毒苗增产机理的研究[D]. 蒋明权.安徽农业大学 2004
本文编号：3422279
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甘薯样品采样地点分布图
结果表明，华南各地甘薯均有病毒病发生，病株率2.0％到50.0％不等，症状主要表现为褪绿斑驳、明脉、紫色斑驳、皱缩、畸形和花叶等症状，其中以褪绿斑驳最为常见（图3-1，表3-1）。不同地区田间甘薯的发病情况有所差异，其中发病情况最为严重的为广东梅州，其次为海南保亭，田间发病最轻的地区为广东惠州。总的来讲，在病毒侵染初期，大多数病株的叶片表现为不典型的褪绿斑或明脉，随着病程发展，不同品种症状表现有所差异，有的发展为斑驳花叶、褪绿斑，紫色素较重品种则常表现为紫色环斑、紫色斑驳。在调查的各个地区中，田间普遍存在褪绿斑点和紫色斑驳的典型症状，多数病株为几种症状混合发生。图 3-1 甘薯病毒病田间叶片症状图注：（A）：紫斑
电泳结果表明，从中可检测出 7 种 RNA 病毒（图 2A，Lane2-8）和 2 种毒（图 2B，Lane2-3），PCR 产物测序结果表明，所获得的扩增产物序列与基因组片段高度同源，核苷酸同一率在 92%至 100%之间。表 3-2 小 RNA 深度测序拼接片段比对病毒种类及基因组覆盖位点和覆毒种 病毒科 病毒属 总覆盖率对应病毒同源序列起始位点终止位点weet potato virus G Potyviridae Potyvirus 70.67% 1222 weet potato virus C Potyviridae Potyvirus 62.37% 1962 weet potato latent virus Potyviridae Potyvirus 38.67% 1986 weet potato feathery mottle virus Potyviridae Potyvirus 51.00% 1964 weet potato leafcurl virus Geminiviridae Begomovirus 22.50% 1416 weet potato golden vein virus Geminiviridae Begomovirus 9.77% 580 weet potato chlorotic fleck virus Betaflexiviridae Carlavirus 21.62% 217
【参考文献】：
期刊论文
[1]三种甘薯病毒多重RT-PCR检测技术的建立[J]. 蒋素华,程喜梅,宋彩霞,许申平,梁芳,崔波. 植物保护. 2017(01)
[2]甘薯病毒病防控措施研究进展与展望[J]. 董芳,张超凡. 作物杂志. 2016(03)
[3]广西甘薯病毒病的病原病毒种类检测[J]. 黄利利,Pham Binhdan,何芳练,刘奕君,刘义明,陈保善,廖咏梅. 基因组学与应用生物学. 2016(05)
[4]2014年广东甘薯产业发展形势与对策建议[J]. 李向伟,万忠,柯清标,谭俊. 广东农业科学. 2015(11)
[5]云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析[J]. 包改丽,左瑞娟,饶维力,LI Ru-Hui,李凡. 微生物学通报. 2013(02)
[6]马铃薯Y病毒病的检测技术及防治策略[J]. 贾霁,肖启明,刘剑峰,周志成,刘双清,唐前君. 园艺与种苗. 2013(01)
[7]葡萄卷叶伴随病毒4和5简并引物和多重PCR检测[J]. 范旭东,董雅凤,张尊平,任芳,裴光前. 植物保护. 2012(06)
[8]海南省甘薯产业发展调研报告[J]. 朱红林,陈健晓,王效宁,孟卫东. 热带农业科学. 2012(06)
[9]中国甘薯病毒种类的血清学和分子检测[J]. 乔奇,张振臣,张德胜,秦艳红,田雨婷,王永江. 植物病理学报. 2012(01)
[10]4种大豆种传病毒多重RT-PCR检测[J]. 李孝军,殷汉华,陈宇,王筱筱,陈峰,叶露飞,杨赛军. 植物检疫. 2011(06)
硕士论文
[1]多重PCR检测三种小麦病毒及小麦黄花叶病毒全基因组序列分析[D]. 魏姣.山东农业大学 2015
[2]西瓜病毒病的田间调查及多重RT-PCR同步检测[D]. 王威麟.西北农林科技大学 2010
[3]三种甘薯病毒多重RT-PCR检测方法的建立及甘薯脉花叶病毒（SPVMV）的分子鉴定[D]. 张业辉.河南农业大学 2009
[4]甘薯茎尖脱毒、快繁技术及其脱毒苗增产机理的研究[D]. 蒋明权.安徽农业大学 2004
本文编号：3422279
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