FRG3在抗番茄枯萎病过程中的功能研究以及番茄枯萎病病原菌的快速检测

发布时间:2021-10-12 11:17
  尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)是一类既可以侵染宿主植物又可以在土壤内生存的兼性寄生真菌,存在种下分化,具有多种专化型。尖孢镰)刀菌的寄主范围非常广泛,可引起茄科、豆科、瓜类等100多种植物枯萎病的发生。尖孢镰刀菌番茄专化型(Fusarium oxysporf.sp.Lycopersici,FOL,FGSC 9935)导致的番茄枯萎病给全球农业生产造成巨大的经济损失。目前对于番茄抗枯萎病的研究主要集中在抗性品种的培育等方面,从寄主抗性相关基因的功能方面的探索番茄抗尖孢镰刀菌分子机理的研究还处于初期阶段。1 FRG3在抗番茄枯萎病过程中的功能研究NBS-LRR(Nucleotide-binding site-Leucine-reach repeats)类蛋白是植物抗性基因(R)编码的R蛋白,是植物机体内数量最多的一类R蛋白家族。本论文以NBS-LRR类抗性基因FRG3为研究对象,分析其在抗番茄枯萎病过程中的功能。(1)本研究利用番茄枯萎病病原菌尖孢镰刀菌番茄专化型(FOL),对具有相似遗传背景的番茄抗病品系Motelle(Mot)和感病品系Moneymaker(MM)进行... 

【文章来源】:扬州大学江苏省

【文章页数】:78 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

FRG3在抗番茄枯萎病过程中的功能研究以及番茄枯萎病病原菌的快速检测


图1-1:植物与病原菌互作模式[32]??

灰度分析,尖孢镰刀菌,侵染,成员


提取根部总RNA,对slmiR482家族的七个成员进行miRNANorthem?Blot分析。sRNA??NorthemBlot结果显示,FOL侵染后,slmiR482家族的七个成员在两个番茄品种中都存在??差异表达,这与之前的sRNA-seq结果不同(图2-1A)。在FOL侵染条件下,slmiR482a,??slmiR482c?和?slmiR482e-5p?在?MM?和?Mot?中均是下调表达;slmiR482b,?slmiR482d-3p?和??slmiR482e-3p在Mot中下调表达,在MM中上调表达。然而,sImiR482d-5p呈现出的趋势??是,在FOL侵染后,在MM中下调表达,在Mot中上调表达(图2-1B)。这些数据结果??表明,sImiR482家族成员在防御番煎枯萎病过程中起着不同的作用。??基于sRNA-seq和sRNANorthern?Blot的结果分析,确定的是在病原菌FOL侵染后,??

靶序列,蛋白质结构域,靶基因


slmiR482家族的每个成员,都预测到了几个靶基因。有趣的是,S〇lycl2g099060是??slmiR482d-3p和slmiR482e-3p的共同预测到的一个靶基因,但在结合位点上存在2-nt的位??移(图2-2A)。通过对蛋白结构域的分析表明,Solycl2g099060蛋白是由699-nt组成,一??个含有卷曲螺旋(CC)和P环结构域的233氨基酸的NBS类抗性蛋白。并且预测到这两??个miRNA的靶向位点在P环结构域上(图2-2B)。??slmiR482f?-?CCAUACCCUCCUCAQCCUUUCU?-5^?22??FRG3?5f-?GGTATGGGAGGATTAGGCAAAA?-3,?22??-k-k'k-k'k'k-k-k'k-k-k-k?*?*?*?*? ̄k?-k?-k??E??I??0?〇?2??FRG3?—?=|?1?■??i?:_:.i........??i?1?1?1??1?50?100?150?200?233?aa??图2-2slmiRNA靶基因预测和蛋白质结构域分析。??A:?mRNA靶序列和觀向位点的预测;红色表示mRNA与相应的miRNA的碱基错配;B:蛋白结构域??的预测;红色箭头表示miRNA在P环区域的结合位点??为了阐明/2家族和Solycl2g099060之间的遗传同源性,从己知的醋栗番茄的显性基??因12基因座中分离出6个同源物刚,包括仏/2C-7,?/2C-2,?/2C-3,?/2C4和72匸-5[40]和??本课题组之前报道的4个NBS-LRR抗性基因Solyc08g075630

【参考文献】:
期刊论文
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博士论文
[1]番茄基因组多样性和演化的遗传学基础[D]. 林涛.中国农业大学 2016
[2]番茄抗晚疫病基因Ph-3的克隆及其效应子的筛选[D]. 张春芝.中国农业科学院 2014
[3]作物枯萎病生防细菌的研究[D]. 郝晓娟.浙江大学 2006



本文编号:3432474

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