抗番茄黄化曲叶病毒病基因ty-5的精细定位及连锁标记的应用
发布时间：2021-11-02 11:29
番茄（Solanum lycopersicum）属于茄科番茄属,适应性强,易于栽培,产量高,品种多,具有较高的营养价值,在世界各地广泛种植。近年来番茄黄化曲叶病（Tomato yellow leaf curl disease,TYLCD）的发生制约着番茄生产的品质和产量。番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leaf curl virus TYLCV）属双生病毒,是导致世界各地番茄发病的重要病毒,对番茄的生产危害极大。TYLCV传播范围广、速度快,利用化学药剂、物理、生物等方式难以防治,而选育抗病品种能最经济有效的减轻该病害的发生。传统的番茄育种方式,存在育种周期长、耗费人力物力,不良连锁不易被打破等缺点。而分子标记辅助选择（marker-assisted selection,MAS）育种能够克服传统育种的缺陷,加快目标育种进程。目前已知抗TYLCV的基因有Ty-1、Ty-2、Ty-3、Ty-3a、Ty-4 ty-5、Ty-6,其中Ty-1和Ty-3基因已被克隆,抗病品种中的抗性基因主要以Ty-1、Ty-2.Ty--3和Ty-3a为主。ty-5基因是近年来新发现的抗TYLCV基...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?亲本材料接种ＴＹＬＣＶ的病情表型??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?ｐａｒｅｎｔ?ｍａｔｅｒｉａｌ?ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ?ａｆｔｅｒ?ｉｎｏｃｕｌａｔｅｄ?ｗｉｔｈ?ＴＹＬＣＶ??
?抗番茄黄化曲叶病毒病基因的精细定位及连锁标记的应用???２．４．３分子标记检测结果??用Ｓ１ＮＡＣ１标记检测亲本材料结果如图２－２，?Ｐ，为ＡＴＶ０１２２７抗病亲本材料，条带??大小为２０６ｂｐ；?Ｐ２为ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ感病亲本材料，条带大小为１６］ｂｐ，与基因特异??性条带大小一致。结果显示，本课题组引进的亲本材料中可以检测到与＜ｙ－５基因分子??连锁标记大小一致的特异性条带，证明该材料中的抗ＴＹＬＣＶ的基因为单隐性遗传基??因（ｙ－５。??Ｍ?ＰＩ?Ｐ２??■??图２－２?ＳＩＮ?ＡＣ?１标记检测亲本材料??注：Ｍ：?ｌＯＯｂｐ?Ｍａｒｋｅｒ；?Ｐｉ：?ＡＴＶ０１２２７?抗病亲本材料；Ｐ２：?ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ?感病亲本材料??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ｉ＇ｈｅ?ＳＩＮ?ＡＣ?１?ｍａｒｋｅｒ?ｄｅｔｅｃｔｓ?ｔｈｅ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅｓ??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?ｌＯＯｂｐ?Ｍａｒｋｅｒ；?Ｐｉ：?ＡＴＶ０１２２７?ｒｅｓｉｓｔａｎｔ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅ；?Ｐ２：?ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ?ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｌｅ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅ??２．５讨论??本研究通过对引进的ＡＶＴ０１２２７番茄材料的抗性鉴定和遗传分析表明，该亲本材??料ＡＶＴ０１２２７对ＴＹＬＣＶ表现出很高的抗性，Ｆｄｆ群体植株的田间表型为感病，Ｆ２代??分离群体的遗传分析符合孟德尔遗传规律抗感比为１：３，通过遗传分析得出ＡＶＴ０１２２７??材料具有抗ＴＹＬＣＶ基因为隐性遗传基因。用前人（Ａｎｂｉｎｄｅｒｅｔａ丨．，２００９）发现的ＴＹ１７２??中与少－５基因连锁的ＣＡＰＳ标记Ｓ１ＮＡＣ１检测亲本材料得出含有基因的条带，与?
ｎ?ｒｅａｄｓ，从Ｓ池中获得了?３９１１８５９０?ｃｌｅａｎ??ｒｅａｄｓ。ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ在番前染色体覆盖率几乎为９１．７％。测序数据符合正态分布规律（图??３－１?），取Ｒ池和Ｓ池的混合池的测序深度在ｌ〇ｘ？６〇ｘ之间的基因组序列为有效测序数??据。??４??￡?３．??（Ｊ）??〇??］２－?｜｜?｛??０．?！｜?［?！｜?ｉ?丨－??６?２０４０￣￣６０￣￣８０￣￣１００?１２０?１４０?１６０＋??Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄｅｐｔｈ??图３－１?Ｒ池和Ｓ池测序深度分布图??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１?Ｒ?ｐｏｏｌ?ａｎｄ?Ｓ?ｐｏｏｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄｅｐｔｈ??Ｒ池和Ｓ池的基因组序列的覆盖率分别为９６．６６％和９６．８６％。通过测序结果分析??在Ｒ池和Ｓ池的混合池之间检测到１７０９０４２个ＳＮＰ和９４０６６个ＩｎＤｅｌ?（表３－１?）。??表３－１混池样品间ＳＮＰ和ＩｎＤｅｌ统计???Ｔａｂｌｅ?３－１?ＳＮＰ?ａｎｄ?ＩｎＤｅｌ?ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｍｉｘ?ｐｏｏｌ?ｓａｍｐｌｅｓ???Ｐｏｏｌ?ＳＩＮＰ＿ＩＮｕｍ?ＩｎＤｅｌＪＮｕｍ??Ｒ０１?ｖｓ?Ｒ０２?１７０９０４２?９４０６６??注：Ｐｏｏｈ混池编号；ＳＮＰ＿Ｎｕｍ：混池间的ＳＮＰ数；ＩｎＤｅｌＪＭｕｍ：混池间的ＩｎＤｅｌ数。??１８??
【参考文献】：
期刊论文
[1]从生产市场需求谈我国番茄品种的变化趋势[J]. 马兆红. 中国蔬菜. 2017(03)
[2]上海市番茄黄化曲叶病毒病发生特点与防控措施探讨[J]. 严宝华,陈杰,杨国庆,李惠明. 中国农技推广. 2017(01)
[3]陕北设施番茄黄化曲叶病毒病发生规律与综合防控措施[J]. 贺志军,姚贵军,乔宏喜,赵文峰,李惠文,白明涛. 蔬菜. 2017(01)
[4]番茄ty-5和Mi-1基因多重PCR体系的建立[J]. 李亚茹,王银磊,赵丽萍,杨玛丽,姜静,赵统敏,余文贵. 江苏农业学报. 2016(04)
[5]多重PCR技术原理及在食品检测中的应用[J]. 王进,姚莉,王菲菲. 中国医院用药评价与分析. 2016(S1)
[6]番茄Ty-3、I-2和Mi基因多重PCR体系的建立与应用[J]. 李冬艳,薛东齐,李景富,许向阳,姜景彬. 东北农业科学. 2016(02)
[7]巴彦淖尔市保护地番茄黄化曲叶病毒病发生与防治[J]. 郑喜清,邸娜,李旭红,王靖. 内蒙古农业科技. 2015(04)
[8]多重PCR技术在植物生物学研究中的应用进展[J]. 任素贤,艾鹏飞,宋层孝,陈文静,宋建军. 安徽农业科学. 2015(06)
[9]番茄Ty-2、Ty-3和I-2基因多重PCR鉴定技术[J]. 孔凡慧,李帅,赵婷婷,李冬艳,许向阳,姜景彬,李景富. 分子植物育种. 2015(01)
[10]含Ty-5基因番茄材料的引进、评价及利用[J]. 王银磊,杨玛丽,赵丽萍,胡恩美,余文贵,赵统敏. 西南农业学报. 2014(05)
博士论文
[1]番茄抗黄化曲叶病基因Ty-2的精细定位及不同抗性基因效应比较[D]. 杨晓慧.中国农业科学院 2012
硕士论文
[1]番茄Ty基因对TYLCV复制、转录和移动的影响及TYLCV侵染后番茄的转录组分析[D]. 李佳蔚.中国农业科学院 2016
[2]不同番茄抗病基因型和温度对TYLCV复制的影响[D]. 林铭.中国农业科学院 2013
本文编号：3471896
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?亲本材料接种ＴＹＬＣＶ的病情表型??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?ｐａｒｅｎｔ?ｍａｔｅｒｉａｌ?ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ?ａｆｔｅｒ?ｉｎｏｃｕｌａｔｅｄ?ｗｉｔｈ?ＴＹＬＣＶ??
?抗番茄黄化曲叶病毒病基因的精细定位及连锁标记的应用???２．４．３分子标记检测结果??用Ｓ１ＮＡＣ１标记检测亲本材料结果如图２－２，?Ｐ，为ＡＴＶ０１２２７抗病亲本材料，条带??大小为２０６ｂｐ；?Ｐ２为ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ感病亲本材料，条带大小为１６］ｂｐ，与基因特异??性条带大小一致。结果显示，本课题组引进的亲本材料中可以检测到与＜ｙ－５基因分子??连锁标记大小一致的特异性条带，证明该材料中的抗ＴＹＬＣＶ的基因为单隐性遗传基??因（ｙ－５。??Ｍ?ＰＩ?Ｐ２??■??图２－２?ＳＩＮ?ＡＣ?１标记检测亲本材料??注：Ｍ：?ｌＯＯｂｐ?Ｍａｒｋｅｒ；?Ｐｉ：?ＡＴＶ０１２２７?抗病亲本材料；Ｐ２：?ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ?感病亲本材料??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ｉ＇ｈｅ?ＳＩＮ?ＡＣ?１?ｍａｒｋｅｒ?ｄｅｔｅｃｔｓ?ｔｈｅ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅｓ??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?ｌＯＯｂｐ?Ｍａｒｋｅｒ；?Ｐｉ：?ＡＴＶ０１２２７?ｒｅｓｉｓｔａｎｔ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅ；?Ｐ２：?ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ?ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｌｅ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅ??２．５讨论??本研究通过对引进的ＡＶＴ０１２２７番茄材料的抗性鉴定和遗传分析表明，该亲本材??料ＡＶＴ０１２２７对ＴＹＬＣＶ表现出很高的抗性，Ｆｄｆ群体植株的田间表型为感病，Ｆ２代??分离群体的遗传分析符合孟德尔遗传规律抗感比为１：３，通过遗传分析得出ＡＶＴ０１２２７??材料具有抗ＴＹＬＣＶ基因为隐性遗传基因。用前人（Ａｎｂｉｎｄｅｒｅｔａ丨．，２００９）发现的ＴＹ１７２??中与少－５基因连锁的ＣＡＰＳ标记Ｓ１ＮＡＣ１检测亲本材料得出含有基因的条带，与?
ｎ?ｒｅａｄｓ，从Ｓ池中获得了?３９１１８５９０?ｃｌｅａｎ??ｒｅａｄｓ。ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ在番前染色体覆盖率几乎为９１．７％。测序数据符合正态分布规律（图??３－１?），取Ｒ池和Ｓ池的混合池的测序深度在ｌ〇ｘ？６〇ｘ之间的基因组序列为有效测序数??据。??４??￡?３．??（Ｊ）??〇??］２－?｜｜?｛??０．?！｜?［?！｜?ｉ?丨－??６?２０４０￣￣６０￣￣８０￣￣１００?１２０?１４０?１６０＋??Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄｅｐｔｈ??图３－１?Ｒ池和Ｓ池测序深度分布图??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１?Ｒ?ｐｏｏｌ?ａｎｄ?Ｓ?ｐｏｏｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄｅｐｔｈ??Ｒ池和Ｓ池的基因组序列的覆盖率分别为９６．６６％和９６．８６％。通过测序结果分析??在Ｒ池和Ｓ池的混合池之间检测到１７０９０４２个ＳＮＰ和９４０６６个ＩｎＤｅｌ?（表３－１?）。??表３－１混池样品间ＳＮＰ和ＩｎＤｅｌ统计???Ｔａｂｌｅ?３－１?ＳＮＰ?ａｎｄ?ＩｎＤｅｌ?ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｍｉｘ?ｐｏｏｌ?ｓａｍｐｌｅｓ???Ｐｏｏｌ?ＳＩＮＰ＿ＩＮｕｍ?ＩｎＤｅｌＪＮｕｍ??Ｒ０１?ｖｓ?Ｒ０２?１７０９０４２?９４０６６??注：Ｐｏｏｈ混池编号；ＳＮＰ＿Ｎｕｍ：混池间的ＳＮＰ数；ＩｎＤｅｌＪＭｕｍ：混池间的ＩｎＤｅｌ数。??１８??
【参考文献】：
期刊论文
[1]从生产市场需求谈我国番茄品种的变化趋势[J]. 马兆红. 中国蔬菜. 2017(03)
[2]上海市番茄黄化曲叶病毒病发生特点与防控措施探讨[J]. 严宝华,陈杰,杨国庆,李惠明. 中国农技推广. 2017(01)
[3]陕北设施番茄黄化曲叶病毒病发生规律与综合防控措施[J]. 贺志军,姚贵军,乔宏喜,赵文峰,李惠文,白明涛. 蔬菜. 2017(01)
[4]番茄ty-5和Mi-1基因多重PCR体系的建立[J]. 李亚茹,王银磊,赵丽萍,杨玛丽,姜静,赵统敏,余文贵. 江苏农业学报. 2016(04)
[5]多重PCR技术原理及在食品检测中的应用[J]. 王进,姚莉,王菲菲. 中国医院用药评价与分析. 2016(S1)
[6]番茄Ty-3、I-2和Mi基因多重PCR体系的建立与应用[J]. 李冬艳,薛东齐,李景富,许向阳,姜景彬. 东北农业科学. 2016(02)
[7]巴彦淖尔市保护地番茄黄化曲叶病毒病发生与防治[J]. 郑喜清,邸娜,李旭红,王靖. 内蒙古农业科技. 2015(04)
[8]多重PCR技术在植物生物学研究中的应用进展[J]. 任素贤,艾鹏飞,宋层孝,陈文静,宋建军. 安徽农业科学. 2015(06)
[9]番茄Ty-2、Ty-3和I-2基因多重PCR鉴定技术[J]. 孔凡慧,李帅,赵婷婷,李冬艳,许向阳,姜景彬,李景富. 分子植物育种. 2015(01)
[10]含Ty-5基因番茄材料的引进、评价及利用[J]. 王银磊,杨玛丽,赵丽萍,胡恩美,余文贵,赵统敏. 西南农业学报. 2014(05)
博士论文
[1]番茄抗黄化曲叶病基因Ty-2的精细定位及不同抗性基因效应比较[D]. 杨晓慧.中国农业科学院 2012
硕士论文
[1]番茄Ty基因对TYLCV复制、转录和移动的影响及TYLCV侵染后番茄的转录组分析[D]. 李佳蔚.中国农业科学院 2016
[2]不同番茄抗病基因型和温度对TYLCV复制的影响[D]. 林铭.中国农业科学院 2013
本文编号：3471896
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