甘蔗线条花叶病毒RT-LAMP检测方法的建立及应用（英文）

发布时间：2021-11-03 21:15

　　【目的】建立甘蔗线条花叶病毒（Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV）的RT-LAMP检测方法,为SCSMV的检测提供技术支持。【方法】根据甘蔗线条花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计特异引物,优化RT-LAMP的反应条件,对比分析RT-LAMP的检测灵敏度和特异性;并在RT-LAMP反应产物中加入SYBR GREEN I进行可视化检测,方便快速判定结果。【结果】成功建立了一种用于检测SCSMV的RT-LAMP方法,可在60 ～ 63 ℃下60 min完成对SCSMV的检测,且具有较高的灵敏度,比传统RT-PCR高100 倍,最低检测RNA浓度为167.9×10^-5 ng。此外,该方法具有较高的特异性,可特异检测SCSMV。【结论】建立了一种灵敏、简便、快速的SCSMV RT-LAMP检测方法并用于田间甘蔗样品的检测。 

【文章来源】：广东农业科学. 2020,47(04)

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 Materials and methods
    1.1 Source of viruses
    1.2 Total RNA extraction
    1.3 Primer designed for RT-LAMP
    1.4 Virus detection by RT-PCR
    1.5 RT-LAMP assay
    1.6 Specificity of RT-LAMP
    1.7 Sensitivity comparison between RT-LAMP and RT-PCR
    1.8 Detection of field samples by RT-LAMP
2 Results and analysis
    2.1 Reaction condition optimization for SCSMV detection by one-step RT-LAMP assay
    2.2 Specificity of RT-LAMP detection of SCSMV
    2.3 Sensitivity of RT-LAMP amplification
    2.4 Detection of SCSMV in field samples by RT-LAMP
3 Discussion
4 Conclusion


【参考文献】：
期刊论文
[1]RT-LAMP技术检测菜豆荚斑驳病毒的研究[J]. 闻伟刚,杨翠云,崔俊霞,张颖.  植物保护. 2010(06)
[2]侵染甘蔗的高粱花叶病毒遗传多样性分析[J]. 许东林,周国辉,沈万宽.  作物学报. 2008(11)
[3]侵染华南地区甘蔗的SCMV遗传多样性初探[J]. 许东林,周国辉.  植物病理学报. 2005(S1)



本文编号：3474361