基于全基因序列的中国北方3省（区）马铃薯Y病毒遗传多样性分析

发布时间：2021-11-14 13:16

　　本研究以马铃薯Y病毒（PVY）全基因组为基础,分析吉林、黑龙江和内蒙古3省（区）PVY群体遗传多样性和群体分化,并评估突变、重组、选择等遗传力所起的作用。根据已报道的PVY全基因序列保守区设计4对引物,采用片段重叠法对来自内蒙古和吉林的24个PVY分离物全基因序列进行测定,并联合NCBI中已登录的9个黑龙江分离物全基因组序列进行遗传多样性参数评估、群体分化检验和分子变异等分析。结果显示,我国北方3省（区）PVY群体遗传多样性高,其中内蒙古和黑龙江PVY群体遗传多样性高于吉林群体,并且3个群体之间呈现一定程度的遗传分化。分子变异分析发现在PVY基因组中存在1 786个变异位点,表明我国北方3省（区）PVY群体变异程度较高,并且这种高变异度有85.54%来自各个马铃薯种植区内PVY个体的遗传变异。重组分析和系统发育分析发现,我国北方3省（区）PVY群体中重组株系占比高达90.3%,并具有明显的株系多样性,表明PVY重组株系已成为我国北方3省（区）马铃薯种植区的流行株系。选择压力分析显示,使用FEL和IFEL法分别检测出501个和315个净化压力选择位点,这表明3省（区）PVY群体受净化选择... 

【文章来源】：植物保护. 2020,46(04)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

基于全基因组序列构建的中国北方3省(区)

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于小RNA深度测序和RT-PCR检测侵染广东省冬种马铃薯的病毒[J]. 路秉翰,汤亚飞,于琳,佘小漫,邓铭光,何自福.  植物保护学报. 2019(03)
[2]山东省马铃薯病害调查[J]. 王炳森,王丽,陈惠兰.  中国马铃薯. 2017(02)
[3]乌兰察布市马铃薯病毒病调查分析[J]. 苑智华.  江苏农业科学. 2015(11)
[4]马铃薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR检测[J]. 黄丹,余琨,陈建斌,蔡红,朱有勇.  云南农业大学学报(自然科学). 2015(04)
[5]马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析[J]. 高芳銮,沈建国,史凤阳,常飞,谢联辉,詹家绥.  遗传. 2013(09)
[6]湖南省马铃薯主产区马铃薯病毒种类及流行分析[J]. 胡新喜,雷艳,何长征,刘明月,李炎林,宋勇,黄科,秦玉芝,熊兴耀,Nie Xianzhou.  中国马铃薯. 2012(06)
[7]植物病原物的群体遗传学[J]. 祝雯,詹家绥.  遗传. 2012(02)
[8]四川省马铃薯主产区最新病毒病普查及血清学鉴定[J]. 钟婷婷,蒲志刚,何俊蓉,吴洁,杨春林,阎文昭.  西南农业学报. 2008(01)
[9]黑龙江省马铃薯病毒病的普查及鉴定[J]. 刘洪义,张洪祥,李明福,杨立群,腾丽雅,于恒纯,张有才.  东北农业大学学报. 2006(03)

硕士论文
[1]马铃薯Y病毒pipo基因的遗传结构分析[D]. 常飞.福建农林大学 2015
[2]中国4个省份马铃薯Y病毒（PVY）P1基因的群体遗传结构[D]. 史凤阳.福建农林大学 2014



本文编号：3494707