小麦3B染色体重测序及节节麦抗条锈病分析
发布时间：2021-12-18 18:31
普通小麦“中国春”作为小麦研究的模式被全世界广泛运用于小麦遗传学和基因组学研究。国际小麦基因组测序联盟采用对“中国春”的单条染色体和染色体臂进行物理作图和测序的策略,完成了小麦基因组草图拼接。“中国春”基因组序列草图的公布,为我们在基因组水平上全面比较不同小麦材料间的遗传变异提供了基础。本研究对六倍体小麦3B染色体重测序,并与“中国春”基因组序列比对,揭示了序列变异和基因型特异序列及其分布特征,主要研究结果总结如下:（1）通过染色体流式分选和高通量测序,获得了普通小麦-斯卑尔脱小麦衍生系“CRNIL1A”3B染色体的原始测序数据（36.6 Gb）。过滤后,87.9%的高质量“CRNIL1A”3B序列成功匹配到“中国春”3B染色体分子全序列;（2）同时,发现大约8.3 Mb的“CRNIL1A”序列不存在于“中国春”基因组中。通过PCR扩增对部分特异序列进行了验证,通过遗传图谱连锁分析,证实所验证的11条特异序列都是属于“CRNIL1A”3B染色体序列。“CRNIL1A”特异序列的功能主要涉及新陈代谢、细胞进程、分子锚定以及细胞壁组分;（3）利用来自全球亚洲、欧洲、美洲和非洲四个区域的22...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２－１?“ＣＲＮＩＬ１Ａ”?３Ｂ染色体测序数据与“中国春”测序数据比较后的分类
扩增出不同大小的ＰＣＲ片段，并进一步对两个分离群体的所有后代进行试验验??证。遗传连锁分析表明这些引物所对应的“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特异ｃｏｎｔｉｇｓ序列全部定??位于３Ｂ染色体上（
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【参考文献】：
期刊论文
[1]Genome-wide patterns of large-size presence/absence variants in sorghum[J]. Li-Min Zhang,Hong Luo,Zhi-Quan Liu,Yi Zhao,Jing-Chu Luo,Dong-Yun Hao,Hai-Chun Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(01)
[2]Synthetic hexaploid wheat and its utilization for wheat genetic improvement in China[J]. Wuyun Yang a, Dengcai Liu b, e, Jun Li a, Lianquan Zhang b, Huiting Wei a, Xiaorong Hu a, Youliang Zheng b, Zhouhu He c, d, Yuchun Zou a a Crop Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Science, Chengdu 610066, China. b Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Dujiangyan city, 611830, China c Institute of Crop Science/National Wheat Improvement Centre, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Beijing 100081, China d CIMMYT China Office, c/o CAAS, Beijing 100081, China e Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Qinghai 810001, China. 遗传学报. 2009(09)
[3]粗山羊草抗条锈病新基因YrY206遗传分析和微卫星标记[J]. 张海泉,郎杰,马淑琴,张宝石. 生物工程学报. 2008(08)
[4]细菌比较基因组学和进化基因组学[J]. 周冬生,杨瑞馥. 微生物学杂志. 2003(05)
[5]创新诱发材料SY95-71选育和利用价值研究[J]. 舒焕麟,杨足君,李光蓉. 四川农业大学学报. 1999(03)
本文编号：3542957
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２－１?“ＣＲＮＩＬ１Ａ”?３Ｂ染色体测序数据与“中国春”测序数据比较后的分类
扩增出不同大小的ＰＣＲ片段，并进一步对两个分离群体的所有后代进行试验验??证。遗传连锁分析表明这些引物所对应的“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特异ｃｏｎｔｉｇｓ序列全部定??位于３Ｂ染色体上（
６５０?ｂｐ??罨??图２－２?“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特异ｃｏｎｔｉｇｓ序列在“ＣＲＮＩＬ１Ａ”和“中国春”全基因组??ＤＮＡ中的ＰＣＲ验证。??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２．?Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＣＲＮＩＬ１?Ａ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ?ｃｏｎｔｉｇｓ?ａｇａｉｎｓｔ?ＣＲＮＩＬ１Ａ?（１Ａ）?ａｎｄ??Ｃｈｉｎｅｓｅ?Ｓｐｒｉｎｇ?（ＣＳ）?ｂｙ?ＰＣＲ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ．?Ｍ?＝?ｍａｒｋｅｒ；?１?＝?ｃｏｎｔｉｇ」０９８４；?２?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿５５；??３?＝?ｃｏｎｔｉｇ—１４３０４；?４?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿１８５９４；?５?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿２９６８；?６?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿４０４８－ｌ；?ａｎｄ?７?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿７５５２．??使用这３４对在“ＣＲＮＩＬｌ?Ａ”中得到目标大小ＰＣＲ片段的引物，对两个分离??群体的亲本材料进行ＰＣＲ扩增。其中，有１１对引物能在两个群体的亲本材料中??扩增出不同大小的ＰＣＲ片段，并进一步对两个分离群体的所有后代进行试验验??证。遗传连锁分析表明这些引物所对应的“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特异ｃｏｎｔｉｇｓ序列全部定??位于３Ｂ染色体上（图２－３
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genome-wide patterns of large-size presence/absence variants in sorghum[J]. Li-Min Zhang,Hong Luo,Zhi-Quan Liu,Yi Zhao,Jing-Chu Luo,Dong-Yun Hao,Hai-Chun Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(01)
[2]Synthetic hexaploid wheat and its utilization for wheat genetic improvement in China[J]. Wuyun Yang a, Dengcai Liu b, e, Jun Li a, Lianquan Zhang b, Huiting Wei a, Xiaorong Hu a, Youliang Zheng b, Zhouhu He c, d, Yuchun Zou a a Crop Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Science, Chengdu 610066, China. b Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Dujiangyan city, 611830, China c Institute of Crop Science/National Wheat Improvement Centre, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Beijing 100081, China d CIMMYT China Office, c/o CAAS, Beijing 100081, China e Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Qinghai 810001, China. 遗传学报. 2009(09)
[3]粗山羊草抗条锈病新基因YrY206遗传分析和微卫星标记[J]. 张海泉,郎杰,马淑琴,张宝石. 生物工程学报. 2008(08)
[4]细菌比较基因组学和进化基因组学[J]. 周冬生,杨瑞馥. 微生物学杂志. 2003(05)
[5]创新诱发材料SY95-71选育和利用价值研究[J]. 舒焕麟,杨足君,李光蓉. 四川农业大学学报. 1999(03)
本文编号：3542957
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