葡萄蚕豆萎蔫病毒荧光定量PCR检测及对寄主的影响研究

发布时间:2021-12-23 02:54
  我国葡萄面积达1 080余万亩,居世界第二位。葡萄病毒病发生普遍,严重影响葡萄产量和品质。葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)是2016年新报道的葡萄病毒,普遍发生于各个葡萄产区。本研究针对GFabV分子检测方法欠缺、危害性不清等问题,扩增获得了我国首个GFabV全基因组序列,在此基础上,建立了高灵敏的荧光定量PCR检测技术,并初步明确了GFab V对葡萄的危害性,主要结果如下:采用小RNA测序方法从‘香妃’葡萄中鉴定出GFabV,并通过PCR和RACE方法扩增获得GFabV XF分离株基因组RNA1和RNA2的完整核苷酸序列。XF分离株基因组RNA1和RNA2的大小分别为5 822和3 134个核苷酸(nt),与其他GFabV分离物同源性进行比对,结果表明,RNA1的核苷酸(nt)和氨基酸(aa)同源性分别为81.7?82.8%和92.0?94.2%,RNA2分别为76.4?82.8%和89.2?96.1%。对国内外GFabV分离物序列进行系统进化分析,显示XF形成一个独立的进化分支。此外,分析了来源于GFabV小干扰RNA(vsiRNA)的长度及在... 

【文章来源】:中国农业科学院北京市

【文章页数】:59 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

葡萄蚕豆萎蔫病毒荧光定量PCR检测及对寄主的影响研究


侵染葡萄的DNA病毒Fig1-1DNAvirusesinfectinggrapes

侵染,葡萄,病毒,绪论


中国农业科学院硕士学位论文第一章绪论2图1-2侵染葡萄的单链RNA病毒Fig1-2Single-strandedRNAvirusesinfectinggrapes

葡萄,病毒,侵染


中国农业科学院硕士学位论文第一章绪论3图1-3侵染葡萄的双链RNA病毒Fig1-3Double-strandedRNAvirusesinfectinggrapes1.2葡萄蚕豆萎蔫病毒Fabavirus属的病毒种类多、寄主范围广,能侵染莴苣、菠菜、辣椒、豌豆等一些蔬菜和经济作物,造成严重危害(FERRERetal.,2008)。洪健等(2014)报道称Fabavirus属已有5个确定种,分别被命名为蚕豆萎蔫病毒1号(BBWV-1)、蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV-2)、葫芦轻型花叶病毒(CuMMV)、龙胆属花叶病毒(GeMV)和野芝麻轻型花叶病毒(LMMV)。最近,在表现病毒病症状的樱桃和桃树上也报道了两种新的Fabavirus病毒,分别被命名为李属病毒F(PrunusvirusF,PrVF)和桃裂果伴随病毒(Peachcrackingfruitassociatedvirus,PCFaV)(VILLAMORetal.,2017;HEetal.,2017)。葡萄蚕豆萎蔫病毒(Grapevinefabavirus,GFabV)是AlRWAHNIHetal.(2016)从两个日本鲜食葡萄‘黑色甜菜’(Vitisviniferacv.BlackBeet)和‘长野紫峰’(Vitisviniferacv.NaganoPurple)上鉴定出的一种新的葡萄病毒,被归类为Secoviridae家族中Fabavirus的新成员。迄今为止,该病毒已在北美、印度、中国、韩国和日本发现(FANetal.,2017;JOetal.,2017;CHIAKIetal.,2020)。先前的研究表明,感染GFabV的‘贝达’葡萄和‘阳光玫瑰’葡萄表现叶片褪绿畸形的症状(FANetal.,2019)。日本学者CHIAKIetal(2019)报道了“阳光玫瑰”母本树携带葡萄蚕豆萎蔫病毒、葡萄双生病毒A、啤酒花矮化类病毒和葡萄黄斑类病毒1等病毒和类病毒。由于生产中阳光玫瑰繁殖材料均来源于母本树,因此导致了田间栽植的阳光玫瑰普遍带毒。最近,对中国不同葡萄品种和地区的GFabV分离株的检测和遗传多样性的研究表明,中国22个省和地区的11个省存在GFabV,感染率达19.1%,不同来

【参考文献】:
期刊论文
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[4]葡萄病毒A实时荧光定量RT-PCR检测技术的建立及应用[J]. 任芳,董雅凤,张尊平,范旭东,胡国君.  园艺学报. 2018(11)
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[6]一种高效的苹果褪绿叶斑病毒TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法[J]. 秦子禹,孙建设,王娜,邵建柱.  植物保护学报. 2015(04)
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[9]葡萄病毒分子检测技术研究进展[J]. 范旭东,董雅凤,张尊平,任芳,胡国君,朱红娟.  园艺学报. 2014(05)
[10]我国部分地区沙地葡萄茎痘相关病毒分离物外壳蛋白序列变异分析[J]. 朱红娟,胡国君,范旭东,张尊平,任芳,董雅凤.  植物保护学报. 2014(02)

博士论文
[1]引起葡萄卷叶及环斑症状的病毒种类鉴定及其分子特性研究[D]. 范旭东.华中农业大学 2016

硕士论文
[1]沙地葡萄茎痘相关病毒PCR检测及外壳蛋白基因变异分析[D]. 朱红娟.中国农业科学院 2014
[2]我国葡萄卷叶病病原分子检测技术研究[D]. 裴光前.中国农业科学院 2010
[3]葡萄病毒种类调查及葡萄斑点病毒检测[D]. 刘永清.华中农业大学 2003



本文编号:3547633

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