玉米螟的分子连接性指数模糊聚类分析

发布时间：2021-12-23 10:48

　　玉米螟危害多种作物,对我国玉米产量与质量的影响尤为明显,我国作为农业大国,防治玉米螟至关重要。为进一步研究不同种类玉米螟生长发育历程及习性,以达到更好地防治效果,利用遗传多样性分析和分子连接性指数模糊聚类方法对不同地理位置和不同寄主的玉米螟进行生物进化研究,分析玉米螟基于不同地理位置和不同寄主2种情况是否各自存在生物型分类。结果表明,在不同地理位置上玉米螟存在生物型分类,而在不同寄主上玉米螟不存在生物型分类。这一研究成果为玉米螟的分类研究和玉米螟防治提供了一种有效的方法。

【文章来源】： 江苏农业科学. 2020,48(06)

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样本获取
    1.2 数据获取
        1.2.1 试验器材与试剂
        1.2.2 基因提取
        1.2.2 引物设计与PCR扩增
    1.3 玉米螟遗传研究
        1.3.1 采自不同地理位置的玉米螟种群遗传研究
        1.3.2 采自不同寄主的玉米螟种群遗传研究
    1.4 碱基饱和度检验
    1.5 聚类分析
        1.5.1 分子连接性指数
        1.5.2 提取DNA序列的特征向量并标准化
            (1)随机在16种碱基对中选取碱基CG,计算每条序列碱基对CG的中心位置。
            (2)定义各序列每个碱基对CG的中心位置为变量L,则
            (3)构建变量L的支化度序列L1—L2—L3—…—Ln,计算δn
            (4)计算各序列的分子连接性指数(xp),构建特征向量。
        1.5.3 模糊相似矩阵的建立
        1.5.4 模糊等价矩阵的构建
2 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米螟综合防治技术 [J]. 刘明华,黄巧云.  上海农业科技. 2018(06)
[2]中国秆野螟属昆虫线粒体COⅠ基因遗传多样性及其分子系统学研究(鳞翅目:草螟科) [J]. 杨瑞生,王振营,何康来,白树雄,姜义仁.  南京农业大学学报. 2011(05)

博士论文
[1]氟苯虫酰胺和NK130102对亚洲玉米螟的分子作用机理研究[D]. 崔丽.中国农业科学院. 2014

硕士论文
[1]分子连接性指数计算软件制作及应用[D]. 单俐经.华东理工大学. 2011



本文编号：3548335