紫貂微卫星位点的开发及群体遗传分析
发布时间：2022-01-01 10:48
紫貂是典型的寒带、亚寒带哺乳动物,曾是一种分布广泛的物种。在我国,共有4种紫貂亚种,主要分布于东北和西北地区人口稀少、气候寒冷的针叶林地带。由于紫貂皮毛异常珍贵,所以该物种经常受到盗猎者的捕杀。再加上人类活动导致的栖息地破碎化,使得紫貂生存面临严峻的挑战。本研究通过传统方法（磁珠富集）,开发出紫貂基因组多态性微卫星位点22个。同时利用紫貂基因组高通量测序数据,开发了16个四碱基多态性微卫星位点。并且利用这16个四碱基位点,对来自中国东北地区的三个紫貂种群（牡丹江-尚志种群、漠河种群、根河种群）49个个体进行了遗传多样性和种群结构分析。主要研究结果如下:1.通过构建基因组文库,共挑取了2252个克隆,经过阳性克隆筛选（获343个）、测序（测序200个阳性克隆）及引物检测（共设计100对）,获得26对可以扩增出清晰、单一,且与预期大小相符条带的引物。利用22个紫貂样品对以上引物进行毛细管电泳检测,最终获得22个多态性微卫星位点。其等位基因数范围是311个,除了位点Mz24和Mz26的多态信息含量较低（0.25<PIC<0.5）,其余所有位点的多态性都呈较高...
【文章来源】：曲阜师范大学山东省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
紫貂的形态特征
.2 紫貂在中国的地理分布区（① 阿尔泰山，② 大兴安岭，③ 小兴安岭，④ 长白Fig. 1.2 The geographical distribution of sable in China群现状的亚种划分问题较为复杂，目前多为大家所接受的是 Wozencraft 等[7]将亚种。在中国，紫貂被划分为四个亚种，分别是阿尔泰亚种（M. zibellina亚种（M. zibellina princeps），小兴安岭亚种（M. zibellina linkouensis）M. zibellina hamgyenensis）[5]。皮绵软灵活, 底绒丰厚细密，毛色墨润有光泽，皮板轻薄且坚韧,在中国。正是由于其质优物美，价值高昂，使得该物种面临严峻的生存挑战。盲目地追求高经济价值，过度地捕捉紫貂个体，导致其种群数量急剧下类活动范围的增大，人类干扰不断扩大，紫貂的栖息地范围不断缩小，其种群数量减少的重要原因。1989年，紫貂被中国政府列为国家一级保护泰地区紫貂种群数量尚不清晰，东北地区紫貂估计有6000只左右[9]。19
第二章 传统方法（磁珠富集）开发紫貂微卫星标记13图2.1 部分紫貂样品总DNA电泳图（Marker 5000）Fig. 2.1 DNA electrophoretogram of partial sable samples2.2.2 酶切挑取6份优质DNA样品，各取15μl混合。取85ul混合DNA与其他液体充分混合，置于37℃酶切1.5-2h。酶切体系为：混合DNA 85μl10×H buffer 10μlSau3AI 5μl总计 100μl酶切结束后65℃变性15min，以使限制酶失活；取5μl酶切液，使用1%琼脂糖凝胶电泳检验酶切结果。电泳图见图2.2。图2.2 紫貂基因组经酶切后凝胶电泳图（两侧与中间均为Marker 2000）Fig. 2
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA分子标记研究进展[J]. 黄映萍. 中山大学研究生学刊（自然科学.医学版）. 2010 (02)
[2]黑龙江省完达山东部林区马鹿种群遗传多样性的微卫星分析[J]. 田新民,张明海,张辉,杨春文,金志民. 生态学杂志. 2010(03)
[3]绵羊mtDNAD-环序列与微卫星DNA遗传多样性和系统发育分析[J]. 成述儒,罗玉柱,韩建林,Olivier Hanotte,胡江. 农业生物技术学报. 2009(06)
[4]利用微卫星标记分析迪庆黄牛的遗传多样性[J]. 田应华,钱林东,凌军,霍金龙,祁宏,刘丽仙,苗永旺. 云南农业大学学报. 2009(06)
[5]微卫星位点获取方法的研究进展[J]. 孙波,鲍毅新,赵庆洋,张龙龙,胡知渊. 生态学杂志. 2009(10)
[6]微卫星在种公牛个体识别与亲缘鉴定方面的应用[J]. 王静,刘丑生,张利平,王志刚,于福清,张桂香,孙秀柱,韩旭,魏玉春. 遗传. 2009(03)
[7]东方粘虫（Pseudaletia separata（Walker））微卫星富集文库的构建与分析[J]. 张国彦,翟保平. 生态学报. 2008(08)
[8]应用微卫星对大足黑山羊进行亲缘关系鉴定[J]. 宋艳画,宋善道,孙燕,王鲜忠,张家骅. 西南大学学报(自然科学版). 2007(07)
[9]大、小兴安岭植物区及交错区物种多样性比较研究[J]. 张玲,袁晓颖,张东来. 植物研究. 2007(03)
[10]STR在野生东北马鹿个体识别中的应用[J]. 尹君,张明海,谢绪昌. 野生动物. 2007(03)
博士论文
[1]秦岭川金丝猴种群遗传结构与分子系统地理研究[D]. 黄康.西北大学 2014
[2]朱鹮多态性微卫星位点的筛选及物种的遗传多样性研究[D]. 何陆平.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于微卫星和线粒体基因的中国西北地区狼的分子生态学研究[D]. 李浩恬.曲阜师范大学 2016
[2]紫貂的微卫星筛选及种群遗传学研究[D]. 吴丹.东北林业大学 2014
[3]利用微卫星标记分析斑背大尾莺种群遗传结构[D]. 赵雪琼.东北林业大学 2012
[4]紫貂饲养繁殖及其产品贸易现状研究[D]. 朱妍.东北林业大学 2012
[5]基于微卫星标记及线粒体基因序列的云南省6个东方蜜蜂（Apis cerena）群体遗传多样性及遗传分化研究[D]. 殷玲.扬州大学 2009
[6]扬子鳄微卫星位点的筛选及其多态性分析[D]. 荆伟.浙江大学 2008
[7]基于微卫星分子标记的二斑叶螨和朱砂叶螨种群遗传结构研究[D]. 李婷.南京农业大学 2008
本文编号：3562217
【文章来源】：曲阜师范大学山东省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
紫貂的形态特征
.2 紫貂在中国的地理分布区（① 阿尔泰山，② 大兴安岭，③ 小兴安岭，④ 长白Fig. 1.2 The geographical distribution of sable in China群现状的亚种划分问题较为复杂，目前多为大家所接受的是 Wozencraft 等[7]将亚种。在中国，紫貂被划分为四个亚种，分别是阿尔泰亚种（M. zibellina亚种（M. zibellina princeps），小兴安岭亚种（M. zibellina linkouensis）M. zibellina hamgyenensis）[5]。皮绵软灵活, 底绒丰厚细密，毛色墨润有光泽，皮板轻薄且坚韧,在中国。正是由于其质优物美，价值高昂，使得该物种面临严峻的生存挑战。盲目地追求高经济价值，过度地捕捉紫貂个体，导致其种群数量急剧下类活动范围的增大，人类干扰不断扩大，紫貂的栖息地范围不断缩小，其种群数量减少的重要原因。1989年，紫貂被中国政府列为国家一级保护泰地区紫貂种群数量尚不清晰，东北地区紫貂估计有6000只左右[9]。19
第二章 传统方法（磁珠富集）开发紫貂微卫星标记13图2.1 部分紫貂样品总DNA电泳图（Marker 5000）Fig. 2.1 DNA electrophoretogram of partial sable samples2.2.2 酶切挑取6份优质DNA样品，各取15μl混合。取85ul混合DNA与其他液体充分混合，置于37℃酶切1.5-2h。酶切体系为：混合DNA 85μl10×H buffer 10μlSau3AI 5μl总计 100μl酶切结束后65℃变性15min，以使限制酶失活；取5μl酶切液，使用1%琼脂糖凝胶电泳检验酶切结果。电泳图见图2.2。图2.2 紫貂基因组经酶切后凝胶电泳图（两侧与中间均为Marker 2000）Fig. 2
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA分子标记研究进展[J]. 黄映萍. 中山大学研究生学刊（自然科学.医学版）. 2010 (02)
[2]黑龙江省完达山东部林区马鹿种群遗传多样性的微卫星分析[J]. 田新民,张明海,张辉,杨春文,金志民. 生态学杂志. 2010(03)
[3]绵羊mtDNAD-环序列与微卫星DNA遗传多样性和系统发育分析[J]. 成述儒,罗玉柱,韩建林,Olivier Hanotte,胡江. 农业生物技术学报. 2009(06)
[4]利用微卫星标记分析迪庆黄牛的遗传多样性[J]. 田应华,钱林东,凌军,霍金龙,祁宏,刘丽仙,苗永旺. 云南农业大学学报. 2009(06)
[5]微卫星位点获取方法的研究进展[J]. 孙波,鲍毅新,赵庆洋,张龙龙,胡知渊. 生态学杂志. 2009(10)
[6]微卫星在种公牛个体识别与亲缘鉴定方面的应用[J]. 王静,刘丑生,张利平,王志刚,于福清,张桂香,孙秀柱,韩旭,魏玉春. 遗传. 2009(03)
[7]东方粘虫（Pseudaletia separata（Walker））微卫星富集文库的构建与分析[J]. 张国彦,翟保平. 生态学报. 2008(08)
[8]应用微卫星对大足黑山羊进行亲缘关系鉴定[J]. 宋艳画,宋善道,孙燕,王鲜忠,张家骅. 西南大学学报(自然科学版). 2007(07)
[9]大、小兴安岭植物区及交错区物种多样性比较研究[J]. 张玲,袁晓颖,张东来. 植物研究. 2007(03)
[10]STR在野生东北马鹿个体识别中的应用[J]. 尹君,张明海,谢绪昌. 野生动物. 2007(03)
博士论文
[1]秦岭川金丝猴种群遗传结构与分子系统地理研究[D]. 黄康.西北大学 2014
[2]朱鹮多态性微卫星位点的筛选及物种的遗传多样性研究[D]. 何陆平.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于微卫星和线粒体基因的中国西北地区狼的分子生态学研究[D]. 李浩恬.曲阜师范大学 2016
[2]紫貂的微卫星筛选及种群遗传学研究[D]. 吴丹.东北林业大学 2014
[3]利用微卫星标记分析斑背大尾莺种群遗传结构[D]. 赵雪琼.东北林业大学 2012
[4]紫貂饲养繁殖及其产品贸易现状研究[D]. 朱妍.东北林业大学 2012
[5]基于微卫星标记及线粒体基因序列的云南省6个东方蜜蜂（Apis cerena）群体遗传多样性及遗传分化研究[D]. 殷玲.扬州大学 2009
[6]扬子鳄微卫星位点的筛选及其多态性分析[D]. 荆伟.浙江大学 2008
[7]基于微卫星分子标记的二斑叶螨和朱砂叶螨种群遗传结构研究[D]. 李婷.南京农业大学 2008
本文编号：3562217
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3562217.html
最近更新
教材专著
