2种叶线虫的转录组测序分析及其FAR蛋白的鉴定
发布时间：2022-01-13 19:02
水稻干尖线虫（Aphelenchoides besseyi Christie,1942）和菊花滑刃线虫（Aphelenchoides ritzemabosi（Schwartz,1911）Steiner&Buhrer,l932）属于线虫门（Nematoda）、侧尾腺口纲（Secernentea）、滑刃目（Aphelenchida）、滑刃亚目（Aphelenchina）、滑刃科（Aphelenchoididae）。这两种线虫均是寄生危害植物地上部分的重要植物病原线虫,又被称为叶线虫,分布广泛,危害许多植物。转录组de novo测序是指在不需要物种基因组序列信息的情况下,用新一代高通量测序技术对某一物种特定组织或器官在某一状态下的转录本进行测序、组装得到转录本序列信息。维生素和脂肪酸结合蛋白（FAR）是一种线虫特有的蛋白,参与了线虫中许多重要的生物过程。为了从分子水平上了解水稻干尖线虫和菊花叶枯线虫的发育繁殖和寄生特性,深入解析这两种线虫与寄主相互作用的机制,本论文利用转录组技术,通过Illumina HiSeq?2000平台,首次对水稻干尖线虫两个致病力不同的混合虫态种群和菊花叶枯...
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：166 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
水稻干尖线虫Contig的长度分布统计
26图 2.2 水稻干尖线虫 Unigene 的长度分布统计A：水稻干尖线虫 N10 种群的 Unigene 长度分布；B：水稻干尖线虫 S24 种群的 Unigene 长度分布；C：水稻干尖线虫两个种群的 Unigene 长度分布；横坐标是组装出来的 Unigene 的长度，纵坐标是对应长度的 Unigene 的数目。Figure 2.2 Unigene length distribution of Aphelenchoides besseyiA: Unigene length distribution of N10 A. besseyi, B: Unigene length distribution of S24 A. besseyi, C:Unigene length distribution of two populations of A.besseyi, the horizontal coordinates are Unigene lengthsand the vertical coordinates are numbers of Unigene
图 2.3 水稻干尖线虫两个混合虫态种群的 NR 分类图R 注释的 e-value 分布；B：NR 注释的相似度分布；C： NR 注释的物种分布re 2.3 The NR classification of unigenes in two mixed-stage populations ofAphelenchoides besseyihe E-value distribution of the result of NR annotation; B: The similarity distribution of the result nnotation; C: The species distribution of the result of NR annotation（3）GO 分类和 KEGG 注释在 GO 注释中，9896 个 unigenes 注释到 3 个大类别（生物过程、细胞定位和分子）中的 55 个小类别中，在生物过程、细胞定位和分子功能类别中注释到最多enes 的分别是单有机体过程类别（single-organism processes）、细胞中（cell）和结性（binding activity）（图 2.5）。水稻干尖线虫的 unigenes 注释在 KEGG 数据库的
【参考文献】：
期刊论文
[1]菊花滑刃线虫的培养条件和繁殖特性[J]. 彭晓放,陈德强,王东伟,王珂,吴文佳,徐春玲,谢辉. 华中农业大学学报. 2015(05)
[2]菊花叶枯线虫风险管理对策研究[J]. 董燕,赵宇翔,陈小平. 四川林业科技. 2013(03)
[3]中国水稻干尖线虫部分群体对水稻的致病力测定[J]. 裴艳艳,程曦,徐春玲,杨再福,谢辉. 中国水稻科学. 2012(02)
[4]温度和湿度及水稻不同生育期对水稻干尖线虫垂直迁移的影响[J]. 孙敏洁,刘维红,林茂松. 中国水稻科学. 2009(03)
[5]水稻干尖线虫室内人工培养条件研究[J]. 谢春芹,陈啸寅,潘以楼,杨鹤同,孙颖. 植物保护. 2008(05)
[6]辽宁省水稻品种种子携带干尖线虫的调查[J]. 段旭光,段玉玺,王胜君,陈立杰. 植物保护. 2008(03)
[7]水稻干尖线虫（Aphelenchoides besseyi）人工培养研究[J]. 王胜君,段玉玺,靳莹莹,陈立杰. 植物保护. 2008(03)
[8]菊花滑刃线虫及其检测和防疫方法[J]. 谢辉. 植物检疫. 2007(03)
[9]水稻干尖线虫病的发生与防治措施[J]. 宋虎彪,单文忠,张鹏里,李新永. 垦殖与稻作. 2006(04)
[10]河北省补充检疫病害——菊花叶枯线虫病、板栗疫病[J]. 任卫红,李跃,赵恒刚. 河北林业科技. 2006(02)
本文编号：3586978
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：166 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
水稻干尖线虫Contig的长度分布统计
26图 2.2 水稻干尖线虫 Unigene 的长度分布统计A：水稻干尖线虫 N10 种群的 Unigene 长度分布；B：水稻干尖线虫 S24 种群的 Unigene 长度分布；C：水稻干尖线虫两个种群的 Unigene 长度分布；横坐标是组装出来的 Unigene 的长度，纵坐标是对应长度的 Unigene 的数目。Figure 2.2 Unigene length distribution of Aphelenchoides besseyiA: Unigene length distribution of N10 A. besseyi, B: Unigene length distribution of S24 A. besseyi, C:Unigene length distribution of two populations of A.besseyi, the horizontal coordinates are Unigene lengthsand the vertical coordinates are numbers of Unigene
图 2.3 水稻干尖线虫两个混合虫态种群的 NR 分类图R 注释的 e-value 分布；B：NR 注释的相似度分布；C： NR 注释的物种分布re 2.3 The NR classification of unigenes in two mixed-stage populations ofAphelenchoides besseyihe E-value distribution of the result of NR annotation; B: The similarity distribution of the result nnotation; C: The species distribution of the result of NR annotation（3）GO 分类和 KEGG 注释在 GO 注释中，9896 个 unigenes 注释到 3 个大类别（生物过程、细胞定位和分子）中的 55 个小类别中，在生物过程、细胞定位和分子功能类别中注释到最多enes 的分别是单有机体过程类别（single-organism processes）、细胞中（cell）和结性（binding activity）（图 2.5）。水稻干尖线虫的 unigenes 注释在 KEGG 数据库的
【参考文献】：
期刊论文
[1]菊花滑刃线虫的培养条件和繁殖特性[J]. 彭晓放,陈德强,王东伟,王珂,吴文佳,徐春玲,谢辉. 华中农业大学学报. 2015(05)
[2]菊花叶枯线虫风险管理对策研究[J]. 董燕,赵宇翔,陈小平. 四川林业科技. 2013(03)
[3]中国水稻干尖线虫部分群体对水稻的致病力测定[J]. 裴艳艳,程曦,徐春玲,杨再福,谢辉. 中国水稻科学. 2012(02)
[4]温度和湿度及水稻不同生育期对水稻干尖线虫垂直迁移的影响[J]. 孙敏洁,刘维红,林茂松. 中国水稻科学. 2009(03)
[5]水稻干尖线虫室内人工培养条件研究[J]. 谢春芹,陈啸寅,潘以楼,杨鹤同,孙颖. 植物保护. 2008(05)
[6]辽宁省水稻品种种子携带干尖线虫的调查[J]. 段旭光,段玉玺,王胜君,陈立杰. 植物保护. 2008(03)
[7]水稻干尖线虫（Aphelenchoides besseyi）人工培养研究[J]. 王胜君,段玉玺,靳莹莹,陈立杰. 植物保护. 2008(03)
[8]菊花滑刃线虫及其检测和防疫方法[J]. 谢辉. 植物检疫. 2007(03)
[9]水稻干尖线虫病的发生与防治措施[J]. 宋虎彪,单文忠,张鹏里,李新永. 垦殖与稻作. 2006(04)
[10]河北省补充检疫病害——菊花叶枯线虫病、板栗疫病[J]. 任卫红,李跃,赵恒刚. 河北林业科技. 2006(02)
本文编号：3586978
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