植物病原丝状真菌寄生性与RGS蛋白的关系研究

发布时间：2022-02-12 07:32

　　以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子（regulators of G-protein signaling,RGS）同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发现,49个真菌中共有229个RGS蛋白,每种真菌中所含有RGS蛋白的数量范围为3～9个,且死体营养型病原菌和半活体营养型病原菌的RGS蛋白数量高于活体营养型病原菌;根据RGS蛋白中保守结构域进行分类,可以划分为DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6种,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS这2种特殊保守结构域的RGS蛋白主要集中在半活体营养型病原菌和死体营养型病原菌;进一步对229个RGS蛋白进行遗传关系分析,发现具有同种保守结构域的RGS蛋白亲缘关系较近。上述研究结果表明植物病原丝状真菌的寄生性与RGS蛋白数量和种类之间存在着一定的关联性。 

【文章来源】：华中农业大学学报. 2020,39(06)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

不同真菌中RGS蛋白数量对比分析

对49个真菌的229条RGS蛋白序列进行遗传关系分析,结果发现,229个序列聚为6类,该结果与通过保守结构域预测结果所分类别一致。其中类型Ⅰ、Ⅵ和Ⅲ亲缘关系上较近,类型Ⅱ和Ⅳ在亲缘关系上较近,Ⅴ类单独为一支(图3)。图3 不同真菌中RGS蛋白序列之间的遗传关系

不同真菌中RGS蛋白序列之间的遗传关系

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]稻瘟病菌RGS家族蛋白RGS结构域的功能解析及Dynamin家族蛋白MoDnm2、MoDnm3的生物学功能研究[D]. 乐鑫怡.南京农业大学 2017



本文编号：3621299