湖北省烟草赤星病病原学及遗传多样性分析
发布时间:2022-02-18 18:01
烟草是湖北省重要的经济作物,种植烟草是烟农脱贫致富的重要途径之一。近几年来,湖北省烟区烟草赤星病发生严重,降低了烟草品质和产量,影响了烟草种植业的发展。本研究通过形态学和分子生物学方法对湖北省烟草赤星病的病原进行鉴定,在此基础上研究病原菌的生物学特性和遗传多样性,主要研究结果如下:从湖北省恩施、十堰、襄阳和宜昌4个产烟区烟草赤星病样本上分离获得72株链格孢菌,在致病性测定基础上通过形态学和基于rDNA-ITS、Calmodulin和Plasma membraneATPase基因序列的分子辅助鉴定,证实引起湖北省烟草赤星病的病原菌为长柄链格孢(Alternaria longipes)、细极链格孢(Alternaria tenuissima)、链格孢(Alternaria alternata)和鸭梨链格孢(Alternaria yaliinficiens)。长柄链格孢和细极链格孢产孢链均为直链,少有分支,但长柄链格孢大部分孢子顶端常延伸成4070μm长的假喙,而细极链格孢成熟分生孢子孢身中部有颜色加深的横隔膜,且隘缩更明显;链格孢和鸭梨链格孢产孢链都有大量分支;但链格...
【文章来源】:华中农业大学湖北省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1 烟草赤星病
1.1 烟草赤星病发生与危害
1.2 烟草赤星病流行因素
2 烟草赤星病病原的分类鉴定
2.1 烟草赤星病病原种类
2.2 链格孢菌的鉴定
2.2.1 形态学鉴定
2.2.2 分子鉴定
3 烟草赤星病的生物学特性研究
3.1 烟草赤星病致病机理
3.1.1 致病相关毒素
3.1.2 致病相关酶类
3.2 烟草赤星病病原菌的致病力分化
3.3 不同温湿度、pH对烟草赤星病菌生长的影响
3.4 不同氮源、碳源对烟草赤星病菌生长的影响
4 烟草赤星病菌的遗传多样性的分子标记
4.1 限制性片段长度多态性(RFLP)
4.2 随机扩增多态性DNA(RAPD)
4.3 限制性扩增片段长度多态性(AFLP)
4.4 简单重复序列(SSR)
4.5 简单重复序列区间(ISSR)
5 研究的目的和意义
第二章 湖北省烤烟烟草赤星病病原鉴定
1 材料和方法
1.1 病害样来源
1.2 培养基及所用试剂
1.3 病原菌的单孢分离与保存
1.4 病原菌的致病性测定
1.5 病原菌的形态学鉴定
1.6 病原菌的分子鉴定
1.6.1 供试菌株
1.6.2 基因组DNA提取
1.6.3 PCR反应体系
1.6.4 PCR引物序列以及反应程序
1.6.5 PCR反应检测
1.6.6 PCR产物序列分析及系统发育树构建
2 结果与分析
2.1 湖北省烟草赤星病病原菌分离
2.2 致病性测定
2.3 病原菌的形态学鉴定结果
2.4 病原菌的分子鉴定
2.4.1 基于rDNA-ITS序列鉴定结果
2.4.2 基于Calmodulin序列鉴定结果
2.4.3 基于Plasma membrane ATPase序列鉴定结果
2.4.4 基于三个基因序列综合鉴定结果
2.5 四种链格孢致病菌在湖北的地理分布
3 小结和讨论
第三章 湖北省烟草赤星病菌生物学特性研究
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供试菌株
1.1.2 供试植物
1.2 试验方法
1.2.1 不同温度条件对菌丝生长影响
1.2.2 不同pH值对菌丝生长的影响
1.2.3 不同碳源对菌丝生长影响
1.2.4 不同氮源对菌丝生长影响
1.2.5 不同种烟草赤星病病菌的致病力测定
1.2.6 不同温度对长柄链格孢致病力的影响
1.2.7 不同保湿时间对长柄链格孢致病力的影响
1.2.8 数据统计与分析
2 结果
2.1 不同温度对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.2 不同pH值对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.3 不同碳源对4个种链格孢菌菌丝生长的影响
2.4 不同氮源对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.5 不同链格孢菌的致病力比较
2.6 不同温度对长柄链格孢菌致病力的影响
2.7 不同保湿时间对长柄链格孢致病力的影响
3 小结和讨论
第四章 湖北省烟草赤星病长柄链格孢遗传多样性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供试菌株
1.1.2 试验仪器
1.2 方法
1.2.1 基因组DNA提取及检测
1.2.2 ISSR-PCR反应体系的建立
1.2.2.1 PCR反应体系
1.2.2.2 ISSR-PCR扩增程序
1.2.2.3 引物的筛选及退火温度的确定
1.2.3 遗传多样性数据统计与分析
2 结果
2.1 ISSR引物的筛选及退火温度的确定
2.1.1 引物的初次筛选及最佳退火温度的确定
2.1.2 引物的复筛
2.1.2.1 基因组DNA浓度及纯度检测
2.1.2.2 ISSR引物的复筛
2.2 长柄链格孢菌菌株的遗传多样性分析
2.2.1 长柄链格孢菌菌株的遗传多态性
2.2.2 长柄链格孢不同地理来源菌株的遗传多样性
2.2.3 长柄链格孢不同地理种群的遗传距离分析
2.2.4 烟草长柄链格孢菌(A.longipes)ISSR聚类分析结果
3 小结与讨论
参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草根黑腐病菌ISSR标记的遗传多样性分析[J]. 窦彦霞,徐林,马冠华,李六英,张世渠. 烟草科技. 2017(11)
[2]重庆巫溪烟区烟草赤星病病原鉴定[J]. 耿莉娜,帅红,赵敏,江厚龙,李钠钾,夏茜,唐梅,陈益银. 江苏农业科学. 2016(08)
[3]玉米链格孢病菌生物学特性及防治药剂离体活性筛选[J]. 王媛媛,刘彬,周园园,朱晓峰,高增贵,陈立杰. 沈阳农业大学学报. 2015(05)
[4]橡胶链格孢叶斑病病原菌生物学特性研究[J]. 刘一贤,石兆武,余守宽,王勇方,蔡志英,蒋桂芝,周明. 湖北农业科学. 2015(17)
[5]贵州省烟草赤星病病原菌的鉴定[J]. 唐承成,曾琛,姜于兰,杨波. 湖北农业科学. 2015(15)
[6]链格孢属小孢子种ISSR和RAPD-PCR最佳反应体系的建立[J]. 刘振亚,熊仁次,朱天生. 北方园艺. 2015(14)
[7]利用ISSR-PCR技术分析香蕉枯萎病菌的遗传多样性[J]. 张贺,张欣,蒲金基,漆艳香,陆英,喻群芳,张辉强,谢艺贤. 微生物学报. 2015(06)
[8]烟草赤星病发生程度对烟叶产量及产值损失估测[J]. 华劲松,王强. 技术与市场. 2014(02)
[9]河南省烟草赤星病病原鉴定[J]. 祖艳青,蒋士君,王海涛,孙淑君,张猛. 中国烟草学报. 2013(04)
[10]烟草赤星病菌遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较分析[J]. 胡中会,赵立华,孔宝华,陈海如,范静华,刘飞,李小鹏,蔡红,杨根华,秦西云,方敦煌. 西南农业学报. 2012(03)
博士论文
[1]链格孢属真菌现代分类方法研究[D]. 孙霞.山东农业大学 2006
硕士论文
[1]柑橘中5种链格孢霉毒素检测技术及产生分布规律初探[D]. 蒋黎艳.西南大学 2016
[2]玉米丝黑穗病菌SSR分子标记开发及其应用研究[D]. 王士臻.山西农业大学 2014
[3]大樱桃黑斑果腐病病原学及防治基础研究[D]. 赵远征.沈阳农业大学 2013
[4]枣果实病原真菌的鉴定及链格孢属病原真菌多样性研究[D]. 王叶.河南农业大学 2013
[5]烟草赤星病对烟叶化学成分的影响及综合防治试验研究[D]. 王建文.湖南农业大学 2011
[6]黑龙江省链格孢属病原菌遗传多样性及杀菌剂抗药性分析[D]. 姚亮亮.东北农业大学 2011
[7]入侵植物紫茎泽兰叶链格孢菌生物学多样性研究[D]. 周振歆.云南大学 2010
[8]烟草赤星病菌角质酶的纯化、性质及在致病中的作用研究[D]. 刘辉.山东农业大学 2009
[9]重庆烟草赤星病菌的致病力分化及遗传差异性研究[D]. 张世才.西南大学 2009
[10]大豆疫霉分子检测及SSR标记的开发[D]. 徐静静.中国农业科学院 2008
本文编号:3631295
【文章来源】:华中农业大学湖北省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1 烟草赤星病
1.1 烟草赤星病发生与危害
1.2 烟草赤星病流行因素
2 烟草赤星病病原的分类鉴定
2.1 烟草赤星病病原种类
2.2 链格孢菌的鉴定
2.2.1 形态学鉴定
2.2.2 分子鉴定
3 烟草赤星病的生物学特性研究
3.1 烟草赤星病致病机理
3.1.1 致病相关毒素
3.1.2 致病相关酶类
3.2 烟草赤星病病原菌的致病力分化
3.3 不同温湿度、pH对烟草赤星病菌生长的影响
3.4 不同氮源、碳源对烟草赤星病菌生长的影响
4 烟草赤星病菌的遗传多样性的分子标记
4.1 限制性片段长度多态性(RFLP)
4.2 随机扩增多态性DNA(RAPD)
4.3 限制性扩增片段长度多态性(AFLP)
4.4 简单重复序列(SSR)
4.5 简单重复序列区间(ISSR)
5 研究的目的和意义
第二章 湖北省烤烟烟草赤星病病原鉴定
1 材料和方法
1.1 病害样来源
1.2 培养基及所用试剂
1.3 病原菌的单孢分离与保存
1.4 病原菌的致病性测定
1.5 病原菌的形态学鉴定
1.6 病原菌的分子鉴定
1.6.1 供试菌株
1.6.2 基因组DNA提取
1.6.3 PCR反应体系
1.6.4 PCR引物序列以及反应程序
1.6.5 PCR反应检测
1.6.6 PCR产物序列分析及系统发育树构建
2 结果与分析
2.1 湖北省烟草赤星病病原菌分离
2.2 致病性测定
2.3 病原菌的形态学鉴定结果
2.4 病原菌的分子鉴定
2.4.1 基于rDNA-ITS序列鉴定结果
2.4.2 基于Calmodulin序列鉴定结果
2.4.3 基于Plasma membrane ATPase序列鉴定结果
2.4.4 基于三个基因序列综合鉴定结果
2.5 四种链格孢致病菌在湖北的地理分布
3 小结和讨论
第三章 湖北省烟草赤星病菌生物学特性研究
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供试菌株
1.1.2 供试植物
1.2 试验方法
1.2.1 不同温度条件对菌丝生长影响
1.2.2 不同pH值对菌丝生长的影响
1.2.3 不同碳源对菌丝生长影响
1.2.4 不同氮源对菌丝生长影响
1.2.5 不同种烟草赤星病病菌的致病力测定
1.2.6 不同温度对长柄链格孢致病力的影响
1.2.7 不同保湿时间对长柄链格孢致病力的影响
1.2.8 数据统计与分析
2 结果
2.1 不同温度对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.2 不同pH值对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.3 不同碳源对4个种链格孢菌菌丝生长的影响
2.4 不同氮源对4种链格孢菌菌丝生长的影响
2.5 不同链格孢菌的致病力比较
2.6 不同温度对长柄链格孢菌致病力的影响
2.7 不同保湿时间对长柄链格孢致病力的影响
3 小结和讨论
第四章 湖北省烟草赤星病长柄链格孢遗传多样性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供试菌株
1.1.2 试验仪器
1.2 方法
1.2.1 基因组DNA提取及检测
1.2.2 ISSR-PCR反应体系的建立
1.2.2.1 PCR反应体系
1.2.2.2 ISSR-PCR扩增程序
1.2.2.3 引物的筛选及退火温度的确定
1.2.3 遗传多样性数据统计与分析
2 结果
2.1 ISSR引物的筛选及退火温度的确定
2.1.1 引物的初次筛选及最佳退火温度的确定
2.1.2 引物的复筛
2.1.2.1 基因组DNA浓度及纯度检测
2.1.2.2 ISSR引物的复筛
2.2 长柄链格孢菌菌株的遗传多样性分析
2.2.1 长柄链格孢菌菌株的遗传多态性
2.2.2 长柄链格孢不同地理来源菌株的遗传多样性
2.2.3 长柄链格孢不同地理种群的遗传距离分析
2.2.4 烟草长柄链格孢菌(A.longipes)ISSR聚类分析结果
3 小结与讨论
参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草根黑腐病菌ISSR标记的遗传多样性分析[J]. 窦彦霞,徐林,马冠华,李六英,张世渠. 烟草科技. 2017(11)
[2]重庆巫溪烟区烟草赤星病病原鉴定[J]. 耿莉娜,帅红,赵敏,江厚龙,李钠钾,夏茜,唐梅,陈益银. 江苏农业科学. 2016(08)
[3]玉米链格孢病菌生物学特性及防治药剂离体活性筛选[J]. 王媛媛,刘彬,周园园,朱晓峰,高增贵,陈立杰. 沈阳农业大学学报. 2015(05)
[4]橡胶链格孢叶斑病病原菌生物学特性研究[J]. 刘一贤,石兆武,余守宽,王勇方,蔡志英,蒋桂芝,周明. 湖北农业科学. 2015(17)
[5]贵州省烟草赤星病病原菌的鉴定[J]. 唐承成,曾琛,姜于兰,杨波. 湖北农业科学. 2015(15)
[6]链格孢属小孢子种ISSR和RAPD-PCR最佳反应体系的建立[J]. 刘振亚,熊仁次,朱天生. 北方园艺. 2015(14)
[7]利用ISSR-PCR技术分析香蕉枯萎病菌的遗传多样性[J]. 张贺,张欣,蒲金基,漆艳香,陆英,喻群芳,张辉强,谢艺贤. 微生物学报. 2015(06)
[8]烟草赤星病发生程度对烟叶产量及产值损失估测[J]. 华劲松,王强. 技术与市场. 2014(02)
[9]河南省烟草赤星病病原鉴定[J]. 祖艳青,蒋士君,王海涛,孙淑君,张猛. 中国烟草学报. 2013(04)
[10]烟草赤星病菌遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较分析[J]. 胡中会,赵立华,孔宝华,陈海如,范静华,刘飞,李小鹏,蔡红,杨根华,秦西云,方敦煌. 西南农业学报. 2012(03)
博士论文
[1]链格孢属真菌现代分类方法研究[D]. 孙霞.山东农业大学 2006
硕士论文
[1]柑橘中5种链格孢霉毒素检测技术及产生分布规律初探[D]. 蒋黎艳.西南大学 2016
[2]玉米丝黑穗病菌SSR分子标记开发及其应用研究[D]. 王士臻.山西农业大学 2014
[3]大樱桃黑斑果腐病病原学及防治基础研究[D]. 赵远征.沈阳农业大学 2013
[4]枣果实病原真菌的鉴定及链格孢属病原真菌多样性研究[D]. 王叶.河南农业大学 2013
[5]烟草赤星病对烟叶化学成分的影响及综合防治试验研究[D]. 王建文.湖南农业大学 2011
[6]黑龙江省链格孢属病原菌遗传多样性及杀菌剂抗药性分析[D]. 姚亮亮.东北农业大学 2011
[7]入侵植物紫茎泽兰叶链格孢菌生物学多样性研究[D]. 周振歆.云南大学 2010
[8]烟草赤星病菌角质酶的纯化、性质及在致病中的作用研究[D]. 刘辉.山东农业大学 2009
[9]重庆烟草赤星病菌的致病力分化及遗传差异性研究[D]. 张世才.西南大学 2009
[10]大豆疫霉分子检测及SSR标记的开发[D]. 徐静静.中国农业科学院 2008
本文编号:3631295
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