基于转录组水平的橡胶丛枝病发病机理研究

发布时间：2022-02-27 22:00

　　巴西橡胶树（Hevea brasiliensis（Willd.Ex A.Juss.）Muell.Arg）生产的天然橡胶是重要的工业原料和战略物资。目前我国植胶面积超过1700万亩,主要分布在云南、海南、广东三省,年产超80万吨,种植面积与产胶量均居世界第四位。橡胶树褐皮病是世界植胶国家普遍发生的一种重要的割面病害。褐皮病危害引起的干胶损失平均超过10%,造成的经济损失极其巨大。橡胶树丛枝病是由MLO和RLO混合侵染引起的一种传染性病害,橡胶树丛枝病的发生与橡胶树褐皮病的发生有密切关系,增殖苗圃丛枝病芽条是大田褐皮病的重要初侵染来源之一。本研究以橡胶丛枝病枝条和健康枝条为材料,应用石蜡切片法对病健枝茎和叶片进行光学显微镜解剖学观察对比其结构差异,分析患病组织结构变化与其外部形态的相关性;同时基于转录组测序比较患丛枝病橡胶与健康橡胶的基因差异,分析差异基因的生物学功能,挖掘影响橡胶树丛枝病症状形成的关键调控基因,旨在以进一步从分子水平探索患病原因。在橡胶丛枝病转录组分析的基础上,利用转录组测序技术初步探索橡胶丛枝病及印度紫檀丛枝病之间的相关性。研究结果如下:1、采用石蜡切片法进行的光学显微... 

【文章来源】：海南大学海南省211工程院校

【文章页数】：88 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1.前言
    1.1.橡胶产业发展概况
        1.1.1.橡胶在全球的种植概况
        1.1.2.我国天然橡胶发展历程
        1.1.3.海南橡胶产业发展概况
    1.2.丛枝病研究概况
        1.2.1.植物感染丛枝病的症状表现
        1.2.2.橡胶丛枝病现象概况
        1.2.3.植物感染丛枝病的分子研究
    1.3.植原体研究概况
        1.3.1 植原体致病机理研究概况
        1.3.2.植原体侵染对寄主植物基因差异表达分子检测技术的影响
    1.4.激素失调致病的研究概况
    1.5.石蜡切片在植物病害研究中的应用
    1.6.转录组应用概况
        1.6.1.转录组测序在植物胁迫研究中的应用
        1.6.2.转录组测序在植物抗病中的研究应用
    1.7.研究的目的和转录组技术路线
2.丛枝病橡胶和健康橡胶的解剖学观察
    2.1.材料与方法
        2.1.1.海南橡胶丛枝现状田间调研
        2.1.2.样本采集与处理
        2.1.3.试验方法
    2.2.结果与分析
        2.2.1.枝茎的组织结构变化
        2.2.2.叶片的组织结构变化
3.基于转录组技术的橡胶丛枝病研究
    3.1.材料与方法
        3.1.1.样本采集与处理
        3.1.2.RNA提取及质量检测
    3.2.转录组测序
        3.2.1.建库测序
        3.2.2.信息分析流程
        3.2.3.实时荧光定量PCR验证
    3.3.结果与分析
        3.3.1.RNA提取和质量检测
        3.3.2.数据质控结果
        3.3.3.差异基因的筛选及分析
        3.3.4.GO功能富集分析
        3.3.5.KEGG通路富集分析
        3.3.6.橡胶丛枝病相关差异基因的代谢通路分析
        3.3.7.橡胶丛枝病差异显著性表达基因
        3.3.8.荧光定量PCR验证
4.基于转录组的橡胶丛枝病和印度紫檀丛枝病间的初步探索
    4.1.转录本拼接
    4.2.Unigene功能注释结果与分析
        4.2.1.NR注释
        4.2.2.GO功能注释
        4.2.3.KOG功能注释
        4.2.4.KEGG功能注释
    4.3.代谢通路的表达分析
5.讨论
    5.1.罹丛枝病植物与健康植物的外部形态差异
        5.1.1.患丛枝病橡胶与健康橡胶外部形态差异
        5.1.2.其它植物患丛枝病与健康外部形态差异
    5.2.患丛枝病橡胶与健康橡胶的解剖学差异
    5.3.激素信号转导途径影响橡胶患丛枝病
    5.4.关键基因代谢通路影响橡胶患丛枝病
    5.5.关键基因及表达模式影响橡胶患丛枝病
6.结论
参考文献
附录一 硕士期间发表的文章
附录二 硕士期间参与的项目
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]车桑子丛枝病的病原分子检测鉴定及风险分析[J]. 李龙,刘乐荷,伍建榕,蒋勇,冯立,赵霞.  中国森林病虫. 2018(03)
[2]酰胺酶的挖掘及在有机合成中的应用进展[J]. 吴哲明,金建强,郑仁朝.  生物加工过程. 2018(01)
[3]Comparative transcriptome analysis of sweet corn seedlings under low-temperature stress[J]. Jihua Mao,Yongtao Yu,Jing Yang,Gaoke Li,Chunyan Li,Xitao Qi,Tianxiang Wen,Jianguang Hu.  The Crop Journal. 2017(05)
[4]转录组学在植物应答逆境胁迫中的研究进展[J]. 张纯,唐承晨,王吉永,郭龙妹,王莉莉,黎万奎.  生物学杂志. 2017(02)
[5]橡胶丛枝植原体两个株系的tuf基因克隆及序列分析[J]. 杨毅,车海彦,曹学仁,罗大全.  农业科技与信息. 2017(01)
[6]吲哚生物碱生物合成研究进展[J]. 陈越,张青磊,黄玉香,谭何新,刁勇,张磊.  世界科学技术-中医药现代化. 2016(11)
[7]IRSG发布世界橡胶市场最新研究报告[J]. 朱永康.  橡胶科技. 2016(06)
[8]高羊茅在低氮胁迫下的蛋白组学分析[J]. 李小冬,舒健虹,于二汝,吴佳海,蔡一鸣,王小利.  草业学报. 2016(03)
[9]血红素的生理分布与调控[J]. 宋艳群,祝融峰,陈鹏.  中国科学:化学. 2015(11)
[10]一种优化的橡胶树木质部石蜡切片制作方法[J]. 蔡海滨,涂敏,胡彦师,程汉,安泽伟,华玉伟,黄华孙.  热带农业科学. 2015(06)

博士论文
[1]同核异质雄性不育小麦花粉发育的调控模型构建及育性相关基因TaUGP1-6A的功能分析[D]. 刘子涵.西北农林科技大学 2019
[2]石斛新种鉴定及铁皮石斛（Dendrobium catenatum）组培苗丛枝病的分子机理研究[D]. 田迎秋.四川农业大学 2017
[3]番茄斑萎病毒核衣壳蛋白胞内运动和移动蛋白胞间运动机制研究[D]. 冯致科.南京农业大学 2016
[4]类黄酮调控基因AtMYB12的异源表达及其对植物抗病性的贡献[D]. 李明.山东农业大学 2012
[5]巴西橡胶树HbMyb1调控基因的克隆及表达[D]. 张云霞.华南热带农业大学 2005

硕士论文
[1]基于转录组测序的小麦抗秆锈病机制初步探究[D]. 廖凯.沈阳农业大学 2018
[2]桑树韧皮部汁液植原体响应基因的研究[D]. 袁传忠.山东农业大学 2014
[3]桑树响应植原体侵染的新miRNAs的生物学功能研究[D]. 李轶群.山东农业大学 2014
[4]枇杷果胶酯酶基因克隆及表达特性分析[D]. 唐佳佳.西南大学 2014
[5]棉花1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶（GhACS1）基因的克隆及功能分析[D]. 王霞.山东农业大学 2008
[6]果梅完全花与不完全花相关性状的差异及其蛋白质组学的初步分析[D]. 王珊.南京农业大学 2008



本文编号：3645364