贵州喀斯特地区斑叶蝉遗传多样性及谱系生物地理学研究

发布时间：2022-05-10 20:38

　　斑叶蝉族隶属于半翅目Hemiptera、叶蝉科Cicadellidae、小叶蝉亚科Typhlocybinae,是小叶蝉亚科中最大的类群。目前,关于叶蝉的遗传多样性和谱系生物地理学研究成果较少,本研究利用分子生物学手段对斑叶蝉进行了线粒体基因序列研究,探究了斑叶蝉的遗传多样性和谱系生物地理学,主要结果如下:1、通过3个线粒体联合基因序列对利川顶斑叶蝉6个地理种群的遗传多样性进行了研究。线粒体联合基因序列为1824bp,保守位点1816个,变异位点8个,简约信息位点2个,自裔位点6个。不同地理种群间的核苷酸多样性为0.00172,说明不同地理种群间的遗传多样性不大。研究表明,TR地理种群最原始,与其他地理种群间的遗传距离最大。2、首次测定了利川顶斑叶蝉Empoascanara sipra、武昌顶斑叶蝉Empoascanara dwalata和翁昂顶斑叶蝉Empoascanara wengangensis三种斑叶蝉的线粒体基因组,并对每种斑叶蝉序列进行了详细的注释与分析。三种斑叶蝉线粒体基因组序列全长分别为14827bp、15271bp、14830bp。3、通过对四种代表斑叶蝉线粒体基因组中... 

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
前言
    1 选题背景及立题依据
    2 研究的理论意义与现实意义
一 国内外研究现状
    1 斑叶蝉族分类研究
    2 叶蝉遗传多样性
    3 叶蝉生物地理学
二 材料与方法
    1 研究区与研究样地选择
        1.1 研究区概况
        1.2 研究样地分析
            1.2.1 喀斯特地区
            1.2.2 非喀斯特地区
    2 研究方法
        2.1 样品采集
        2.2 标本鉴定
        2.3 DNA提取
        2.4 PCR扩增及电泳
        2.5 序列拼接和注释分析
        2.6 分子数据分析方法
三 利川顶斑叶蝉遗传多样性研究
    1 基于线粒体16S rRNA基因序列的遗传多样性分析
        1.1 利川顶斑叶蝉标本信息
        1.2 线粒体16S rRNA基因序列分析
        1.3 不同地理种群遗传多样性分析
        1.4 不同地理种群亲缘关系分析
        1.5 分析与讨论
    2 基于线粒体COI基因序列的遗传多样性分析
        2.1 利川顶斑叶蝉标本信息
        2.2 线粒体COI基因序列分析
        2.3 不同地理种群遗传多样性分析
        2.4 不同地理种群亲缘关系分析
        2.5 分析与讨论
    3 基于线粒体Cytb基因序列的遗传多样性分析
        3.1 利川顶斑叶蝉标本信息
        3.2 线粒体Cytb基因序列
        3.3 不同地理种群遗传多样性分析
        3.4 不同地理种群亲缘关系分析
        3.5 分析与讨论
    4 基于3个线粒体联合基因序列的遗传多样性分析
        4.1 利川顶斑叶蝉标本信息
        4.2 3个线粒体联合基因序列分析
        4.3 不同地理种群遗传多样性分析
        4.4 不同地理种群亲缘关系分析
        4.5 分析与讨论
四 斑叶蝉代表种类线粒体基因组测序及分析
    1 利川顶斑叶蝉基因组序列分析
        1.1 利川顶斑叶蝉线粒体基因结构
        1.2 利川顶斑叶蝉蛋白基因及密码子
        1.3 利川顶斑叶蝉转运 RNA 基因和核糖体 RNA 基因
    2 武昌顶斑叶蝉基因组序列分析
        2.1 武昌顶斑叶蝉线粒体基因结构
        2.2 武昌顶斑叶蝉蛋白基因及密码子
        2.3 武昌顶斑叶蝉转运RNA基因和核糖体RNA基因
    3 翁昂顶斑叶蝉基因组序列分析
        3.1 翁昂顶斑叶蝉线粒体基因结构
        3.2 翁昂顶斑叶蝉蛋白基因及密码子
        3.3 翁昂顶斑叶蝉转运RNA基因和核糖体RNA基因
五 四种代表斑叶蝉线粒体基因组成对比
    1 四种斑叶蝉整体概述
    2 碱基成分差异分析
    3 四种斑叶蝉基因间隔区和重叠区差异分析
    4 蛋白编码基因差异分析
    5 核糖体RNA和转运RNA差异分析
    6 小结和讨论
六 斑叶蝉谱系生物地理学初探
    1 基于线粒体COI 基因的谱系生物地理学研究
        1.1 数据来源
        1.2 遗传距离分析
        1.3 系统发育关系
    2 基于线粒体16S rRNA基因的谱系生物地理学研究
        2.1 数据来源
        2.2 遗传距离分析
        2.3 系统发育关系
    3 分析与讨论
七 结论与讨论
    1 基于线粒体基因序列的利川顶斑叶蝉遗传多样性分析
    2 三种代表斑叶蝉线粒体基因组测序及分析
    3 四种代表斑叶蝉线粒体基因组数据比较
    4 斑叶蝉谱系生物地理学初探
参考文献
附录 实验室内、外工作照片
致谢
攻读学位期间科研成果及获奖情况
    参与科研项目
    发表论文
    获奖情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于COⅠ序列的陕西凹缘菱纹叶蝉种群关系与遗传多样性[J]. 杨金宏,孔卫青.  基因组学与应用生物学. 2019(08)
[2]施秉世界自然遗产地景观美学特征及价值提升研究[J]. 陈品冬,肖时珍.  中国地名. 2019(07)
[3]基于28S rDNA D2区序列的陕南凹缘菱纹叶蝉分子系统学与遗传多样性研究[J]. 杨金宏,孔卫青.  西北农业学报. 2019(08)
[4]基于cyt b基因的假眼小绿叶蝉11个地理种群遗传分化研究[J]. 祝愿,李俊,庞宏宇,王震,杜楠,熊胜利,蔡滔.  生物资源. 2019(03)
[5]基于地形地貌因子的贵州省NDVI时空变化分析[J]. 陈海喜,钟九生,兰安军,刘娇,赵妮平.  贵州科学. 2019(02)
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[7]丛枝菌根真菌生物地理学研究进展[J]. 陈保冬,李雪静,徐天乐,谢伟.  生态学报. 2018(04)
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[9]梵净山世界自然遗产提名地裸子植物区系与地理分布分析[J]. 朱佳运,熊康宁,容丽,陈浒,游美玲,王琦.  贵州科学. 2017(04)
[10]基于线粒体COⅠ基因部分序列的缅甸安小叶蝉地理种群遗传多样性研究[J]. 董梦书,杨琳,陈祥盛,张余杰.  四川动物. 2017(03)

博士论文
[1]叶蝉科生物地理学研究（半翅目：头喙亚目）[D]. 袁忠林.西北农林科技大学 2004

硕士论文
[1]苔藓植物对石漠化过程及不同土地利用方式的生态响应[D]. 李玉杰.贵州师范大学 2019
[2]施秉白云岩喀斯特地区苔藓退化后土壤微生物群系变化分析[D]. 方敏.贵州师范大学 2019
[3]岩溶地下水对城市土地利用及景观格局演变的响应过程研究[D]. 杨应增.贵州大学 2019
[4]梵净山五种森林类型的土壤丛枝菌根真菌多样性[D]. 袁腾.贵州大学 2019
[5]梵净山水青冈林的全球对比分析与世界遗产价值[D]. 高香琴.贵州师范大学 2018
[6]基于线粒体CO Ⅰ和CO Ⅱ基因的茶园假眼小绿叶蝉地理种群的遗传分化研究[D]. 周宁宁.中国计量学院 2014
[7]基于线粒体基因的假眼小绿叶蝉遗传多样性研究[D]. 李乐.中国农业科学院 2012
[8]基于GIS的中国小叶蝉亚科生物地理学研究（半翅目：叶蝉科）[D]. 王秀爽.西北农林科技大学 2012
[9]中国斑叶蝉族分类研究[D]. 宋月华.贵州大学 2007
[10]千岛湖岛屿化景观及其对植物多样性的影响[D]. 丁立仲.浙江大学 2005



本文编号：3652659