苦瓜SSR遗传图谱的构建及白粉病抗性的QTL定位

发布时间：2023-05-04 01:45

　　苦瓜(Mmordica charantiaL.)为葫芦科蔬菜之一,适合在热带和温带地区栽培,白粉病是一种广泛发生的世界性病害,发病时会导致苦瓜产量和品质受到严重影响,因此苦瓜抗病育种研究是非常重要的科学问题。本研究首先利用苦瓜简化基因组测序开发SSR引物,利用正交设计L16(44)的方法对苦瓜SSR-PCR反应体系进行优化,并以4种表型差异较大的苦瓜材料DNA为模板,利用优化的体系对本实验室开发的SSR引物进行筛选,并利用筛选出来的多态性引物对黄瓜、甜瓜、西瓜、丝瓜、冬瓜、南瓜这6种瓜类进行PCR扩增,研究苦瓜SSR引物在这6种瓜类作物中通用性;其次以高抗白粉病野生型苦瓜高代自交系04-17与高感白粉病栽培种高代自交系25作为亲本,利用F2分离群体,构建了 SSR遗传图谱,并对F2:3代家系白粉病病情指数进行了初步定位。实验结果如下:1、本次测序获得Clean base 3.133G,总计Clean reads 12,533,97 条,有效率 99.02%,碱基的错误率为0.04%,碱基GC含量35.61%。根据测序质量分析结果,Q20≥94.69%,Q30≥90.28%,可知测序的质...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 引言
    1.2 SSR引物开发
        1.2.1 文库筛选法
        1.2.2 富集法
        1.2.3 STMP和SAM
        1.2.4 EST-SSR
    1.3 苦瓜SSR引物开发
    1.4 遗传图谱的构建
        1.4.1 作图群体的构建
        1.4.2 葫芦科作物遗传图谱的研究进展
    1.5 瓜类白粉病抗性的遗传研究
        1.5.1 白粉病病原菌及症状
        1.5.2 白粉病的发病规律
        1.5.3 苦瓜白粉病抗性的遗传规律研究
        1.5.4 瓜类抗白粉病分子标记辅助育种的研究进展
    1.6 研究的目的和意义
2 苦瓜SSR引物开发及其引物在瓜类作物中的穿梭性研究
    2.1 材料与方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 苦瓜DNA的提取及DNA质量检测
        2.1.3 RAD-seq技术开发苦瓜SSR引物
        2.1.4 苦瓜SSR-PCR反应体系的优化实验设计
        2.1.5 SSR-PCR扩增及检测
        2.1.6 筛选最佳的退火温度
        2.1.7 多态性引物的筛选
        2.1.8 苦瓜SSR多态性引物对六种瓜类作物的通用性及多态性
    2.2 结果与分析
        2.2.1 DNA检测
        2.2.2 苦瓜SSR引物开发
        2.2.3 SSR-PCR基本反应体系的建立
        2.2.4 筛选最佳退火温度
        2.2.5 多态性引物的筛选及其多态性分析
        2.2.6 苦瓜SSR多态性引物对六种瓜类作物扩增的通用性及多态性分析
    2.3 讨论
3 苦瓜SSR遗传图谱的构建
    3.1 材料与方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 基因组DNA的提取
        3.1.3 SSR分子标记实验步骤
        3.1.4 数据统计
    3.2 结果与分析
        3.2.1 多态性引物的筛选
        3.2.2 分子标记的偏分离
        3.2.3 苦瓜SSR遗传图谱的构建
    3.3 结论与讨论
4 苦瓜F_2:3代白粉病QTL定位
    4.1 材料与方法
        4.1.1 材料
        4.1.2 方法
    4.2 结果与分析
        4.2.1 不同测量时间F_2:3家系的白粉病抗性差异显著性分析
        4.2.2 苦瓜白粉病抗性QTL定位
    4.3 结论与讨论
5 全文结论
参考文献
缩写词组
附录
    附录1 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备及电泳
    附录2 论文发表
致谢



本文编号：3807699