禾谷镰刀菌MYB转录因子生物信息学分析

发布时间：2023-05-13 13:32

　　本研究利用生物信息学方法对真菌转录因子数据库收录的17条禾谷镰刀菌MYB转录因子序列进行了分析。基因序列和蛋白理化性质分析发现,禾谷镰刀菌17个MYB转录因子在核酸长度、蛋白大小、理论等电点、原子总数以及不稳定系数方面均存在差异;基序分析和蛋白二级、三级结构预测发现,这些转录因子包含2条特征基序,蛋白空间结构多样且均包含MYB转录因子特征结构(螺旋-转角-螺旋(HTH));系统进化树分析表明,17个禾谷镰刀菌MYB转录因子与12个已报道的其他物种MYB转录因子进化出两个大的分支,其中Fg MYB03、Fg MYB04、Fg MYB05、Fg MYB06、Fg MYB10、Fg MYB12和Fg MYB13与已知功能的动物、植物和真菌MYB转录因子c-MYB、ATMYB2、MoMyb1、FlbD和Pol5等具有较近的亲缘关系,推测它们具有类似的生物学功能。本研究结果为进一步研究禾谷镰刀菌MYB转录因子的生物学功能以及其他真菌MYB转录因子的家族特征提供了依据。

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 禾谷镰刀菌MYB转录因子鉴定和蛋白理化性质分析
    1.2 禾谷镰刀菌MYB转录因子基序和蛋白结构分析
    1.3 禾谷镰刀菌MYB转录因子的进化分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 禾谷镰刀菌MYB转录因子筛选及序列获得
    3.2 禾谷镰刀菌MYB转录因子理化性质分析
    3.3 禾谷镰刀菌MYB转录因子的基序和蛋白结构分析
    3.4 MYB转录因子进化分析
作者贡献



本文编号：3815917