镰刀菌胁迫下香蕉DGE分析、新品种DUS测试及抗病性评价

发布时间：2023-08-06 18:21

　　香蕉(Musa spp.)是一种重要的水果和粮食作物。目前全球香蕉产业正面临着由古巴尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc)引起的枯萎病的严重威胁。研究香蕉的抗病机理可为香蕉枯萎病的防治及抗病育种提供理论依据。数字基因表达谱(Digital gene expression,DGE)分析技术已经被广泛应用于包括香蕉在内的植物抗病机理的研究。然而,与香蕉枯萎病抗性相关的基因本体论数据库(Gene ontology,GO)条目和东京基因与基因组百科全书(Kyto encyclopedia of genes and geneomes,KEGG)途径的信息非常有限。本研究采用DGE分析了高抗香蕉枯萎病4号生理小种(Foc 4)的‘粤优抗1号’(Musa spp.AAA)和高感的‘巴西蕉’(Musa spp.AAA)的组培苗在接种病原菌前、后基因的差异表达,并采用维恩图筛选出与抗/感病性密切相关的基因、GO和KEGG条目。随着育种业的快速发展,植物新品种保护变得日益重要。而植物特异性、一致性、稳定性(Distinctness,Uniformity,Sta...

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
1 前言
    1.1 香蕉枯萎病
    1.2 香蕉抗枯萎病研究机理的进展
    1.3 香蕉枯萎病的防治
    1.4 数字基因表达谱技术在植物抗病机理研究中的应用
    1.5 植物DUS测试
    1.6 本研究的研究目的与意义
2 材料与方法
    2.1 供试材料
    2.2 实验方法
        2.2.1 病原菌培养
        2.2.2 DGE测序
            2.2.2.1 植物材料培养及样品处理
            2.2.2.2 DGE测序方法
            2.2.2.3 差异表达基因的GO和KEGG富集分析
        2.2.3 荧光定量PCR
            2.2.3.1 总RNA提取及c DNA合成
            2.2.3.2 引物设计
            2.2.3.3 PCR扩增反应
        2.2.4 植物学性状指标的调查方法
        2.2.5 香蕉对枯萎病抗性的苗期鉴定
    2.3 主要试剂
    2.4 主要设备及实验用品
3 结果与分析
    3.1 DGE测序
        3.1.1 测序数据质量分析
        3.1.2 Reads在参考基因组不同区域的分布情况
        3.1.3 差异表达基因分析
            3.1.3.1 不同表达水平区间的基因数量统计
            3.1.3.2 各比较组差异表达基因统计
            3.1.3.3 GO富集分析
            3.1.3.4 KEGG富集分析
            3.1.3.5 qRT-PCR验证
    3.2 香蕉新品系DUS测试结果
        3.2.1 植株、叶片、苞片
        3.2.2 果指性状
        3.2.3 果穗性状
    3.3 部分新品系的苗期抗病性鉴定
4 讨论与结论
    4.1 讨论
        4.1.1 DGE分析
            4.1.1.1 差异表达基因
            4.1.1.2 GO分析
            4.1.1.3 KEGG分析
        4.1.2 DUS测试
        4.1.3 香蕉苗期抗病性鉴定
    4.2 结论
致谢
参考文献



本文编号：3839817