柑橘抗/感溃疡病品种内生细菌菌群差异与寄主抗病的相关性研究
发布时间：2023-10-28 19:08
不同柑橘品种对溃疡病的抗性有明显差异,脐橙高度感病,而宽皮橘类抗性较强。植物内生细菌是一类生长在植物体内而不引起任何症状的微生物类群。大量研究表明,内生细菌对植物有多种有益的生物学作用。那么不同柑橘品种中内生细菌菌群是否存在差异,是否直接影响溃疡病的抗感性呢?为此,本研究以温州蜜柑和纽荷尔脐橙为材料,通过富集柑橘中的内生细菌、培养无菌苗以及采用Illumina测序对抗/感溃疡病柑橘的内生细菌菌群进行相关研究和分析,并初步探究内生细菌是否影响柑橘体内防御素的产生。本研究取得以下结果:(1)柑橘内生细菌菌群富集方法的筛选。样品组织经过溶液A(1.5%离析酶R-10+1.5%纤维素酶R-10+8.55%蔗糖)、溶液B(1.5%离析酶R-10+1.5%纤维素酶R-10+12.8%甘露醇+0.12%MES+0.36%CaCl2·2H2O+0.011%NaH2PO4)和溶液C(8.55%蔗糖)处理后,植物叶绿体DNA占宏基因组DNA的比例均有所减少,其中脐橙叶片和蜜柑果皮经过溶液A处理最佳,分别为7.34%、7...
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 柑橘溃疡病概述
1.1.1 柑橘溃疡病的分布及危害
1.1.2 柑橘溃疡病的症状、病原及发病相关因素
1.1.3 柑橘溃疡病的防治
1.2 内生细菌概述
1.2.1 内生细菌的概念及生物学作用
1.2.2 内生细菌在植物病害方面的相关研究
1.2.3 内生细菌的富集
1.3 Illumina高通量测序
1.3.1 Illumina高通量测序概述
1.3.2 Illumina高通量测序的技术应用
1.3.3 Illumina高通量测序技术在微生物检测中的应用
1.3.4 Illumina高通量测序信息分析
1.4 柑橘无菌苗的培育
1.4.1 外植体的消毒方法
1.4.2 外植体的激素配比
1.4.3 嫁接存活率的影响因素
1.5 植物防御素
1.6 本研究的意义、内容及技术路线
1.6.1 研究背景及意义
1.6.2 研究内容
1.6.3 技术路线
第二章 柑橘内生细菌菌群富集方法的比较
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验试剂
2.1.3 实验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 宏基因组DNA提取质量检验
2.2.2 富集效果分析
2.2.3 内生细菌菌群分析
2.2.4 OTU聚类分析
2.3 结论与讨论
第三章 柑橘内生细菌菌群的差异性分析
3.1 材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 主要仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 结果分析
3.2.1 OTU差异性分析
3.2.2 细菌菌群分布及动态变化分析
3.2.3 物种多样性分析
3.2.4 物种丰度聚类分析
3.3 结论与讨论
第四章 柑橘可培养内生细菌与寄主品种抗溃疡病之间的分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 内生细菌的分离
4.2.2 内生细菌对柑橘溃疡病菌的抑菌效果
4.2.3 拮抗内生细菌对脐橙抗溃疡病能力的影响
4.3 结论与讨论
第五章 柑橘无菌苗体系的构建
5.1 材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 温州蜜柑和纽荷尔脐橙外植体消毒方法的筛选
5.2.2 不同激素配比对外植体萌芽效果的影响
5.2.3 不同消毒方法对砧木种子萌发的影响
5.2.4 微芽嫁接结果
5.3 结论与讨论
第六章 拮抗内生细菌在宿主抗溃疡病中的作用初探
6.1 实验与方法
6.1.1 材料与试剂
6.1.2 柑橘溃疡病菌的分离及分子鉴定
6.1.3 柑橘溃疡病菌及内生细菌的培养
6.1.4 内生细菌对柑橘溃疡病发生的影响
6.1.5 防御素基因PDF1.2表达量的检测
6.2 结果分析
6.2.1 柑橘溃疡病菌鉴定
6.2.2 内生细菌对柑橘溃疡病发生的影响
6.2.3 RNA质量检测
6.3 结论与讨论
参考文献
致谢
作者简介
本文编号：3857601
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
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摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 柑橘溃疡病概述
1.1.1 柑橘溃疡病的分布及危害
1.1.2 柑橘溃疡病的症状、病原及发病相关因素
1.1.3 柑橘溃疡病的防治
1.2 内生细菌概述
1.2.1 内生细菌的概念及生物学作用
1.2.2 内生细菌在植物病害方面的相关研究
1.2.3 内生细菌的富集
1.3 Illumina高通量测序
1.3.1 Illumina高通量测序概述
1.3.2 Illumina高通量测序的技术应用
1.3.3 Illumina高通量测序技术在微生物检测中的应用
1.3.4 Illumina高通量测序信息分析
1.4 柑橘无菌苗的培育
1.4.1 外植体的消毒方法
1.4.2 外植体的激素配比
1.4.3 嫁接存活率的影响因素
1.5 植物防御素
1.6 本研究的意义、内容及技术路线
1.6.1 研究背景及意义
1.6.2 研究内容
1.6.3 技术路线
第二章 柑橘内生细菌菌群富集方法的比较
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验试剂
2.1.3 实验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 宏基因组DNA提取质量检验
2.2.2 富集效果分析
2.2.3 内生细菌菌群分析
2.2.4 OTU聚类分析
2.3 结论与讨论
第三章 柑橘内生细菌菌群的差异性分析
3.1 材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 主要仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 结果分析
3.2.1 OTU差异性分析
3.2.2 细菌菌群分布及动态变化分析
3.2.3 物种多样性分析
3.2.4 物种丰度聚类分析
3.3 结论与讨论
第四章 柑橘可培养内生细菌与寄主品种抗溃疡病之间的分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 内生细菌的分离
4.2.2 内生细菌对柑橘溃疡病菌的抑菌效果
4.2.3 拮抗内生细菌对脐橙抗溃疡病能力的影响
4.3 结论与讨论
第五章 柑橘无菌苗体系的构建
5.1 材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 温州蜜柑和纽荷尔脐橙外植体消毒方法的筛选
5.2.2 不同激素配比对外植体萌芽效果的影响
5.2.3 不同消毒方法对砧木种子萌发的影响
5.2.4 微芽嫁接结果
5.3 结论与讨论
第六章 拮抗内生细菌在宿主抗溃疡病中的作用初探
6.1 实验与方法
6.1.1 材料与试剂
6.1.2 柑橘溃疡病菌的分离及分子鉴定
6.1.3 柑橘溃疡病菌及内生细菌的培养
6.1.4 内生细菌对柑橘溃疡病发生的影响
6.1.5 防御素基因PDF1.2表达量的检测
6.2 结果分析
6.2.1 柑橘溃疡病菌鉴定
6.2.2 内生细菌对柑橘溃疡病发生的影响
6.2.3 RNA质量检测
6.3 结论与讨论
参考文献
致谢
作者简介
本文编号：3857601
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