产毒条件下层出镰刀菌总RNA提取方法的比较研究

发布时间：2024-01-30 06:50

　　目的通过比较研究不同总RNA提取方法,建立一种产毒条件下层出镰刀菌总RNA提取的方法。方法样品在低温液氮高通量组织研磨仪中快速冷冻研磨,分别采用RNA提取试剂盒、Trizol法、CTAB法和改良的Trizol和试剂盒合并法提取其总RNA,并通过微量核酸检测仪、琼脂糖凝胶电泳和逆转录定量PCR(quantitative reverse transcription PCR, qRT-PCR)对提取的总RNA样品进行品质检测。结果试剂盒法不能提取到总RNA;Trizol法和CTAB法均可提取到总RNA,但质量较低,有明显降解现象;而改良的Trizol法更适合产毒条件下层出镰刀菌总RNA的提取,此方法可在30min内完成操作,获得的总RNA质量高,完整性好,条带清晰均无降解现象。结论该方法快速、方便、高效、通用,提取到的总RNA纯度高,浓度和完整性完全满足后续层出镰刀菌全转录组测序文库构建的要求。

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图2层出镰刀菌管家基因β-tubulin的qRT-PCR扩增曲线

图3层出镰刀菌全转录组测序RNA样品提取检测报告

图1不同提取方法对总RNA提取效果的琼脂糖凝胶电泳检测

本文编号：3889719