根肿菌、寄主及根部内生微生物组交互作用研究

发布时间：2024-03-16 22:49

　　芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae Wor.)引起的十字花科植物根肿病在世界范围内发生和为害。近年来,根肿病已由长江上游扩散至长江中下游油菜产区,严重威胁我国油菜产业的安全,需要研制安全、高效和绿色的防控措施。本文研究了根肿菌寄主(拟南芥)应答病原菌侵染早期反应机制,研究了根肿菌、寄主与根部内生微生物之间的交互作用。取得阶段性研究进展如下:采用RNA-Seq技术研究了拟南芥对根肿菌侵染早期应答机制,建立了拟南芥应答根肿菌侵染早期(病原菌吸附根毛和侵染阶段)的数字基因表达谱,分析了在接种24 hpi和48 hpi与接种前相比差异表达的基因,其中24 hpi时拟南芥有536个基因上调表达,1367个基因下调表达;48 hpi时有374个基因上调表达,985个基因下调表达。通过Gene Ontology和Pathway富集分析对差异表达基因在不同功能模块和通路中的分布进行了分析,并通过MAPMAN将通路变化进行了深入展示分析。结果显示在根肿菌侵染早期(24 hpi和48 hpi),拟南芥中与类黄酮和木质素合成通路显著的增强;芥子油甙、帖类物质和原花青素等物质代谢产物...

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图2.1台盼蓝染色方法观察根肿菌侵染拟南芥早期过程

图2.1台盼蓝染色方法观察根肿菌侵染拟南芥早期过程Fig.2.1TheearlyprocessofP.brassicaeinfectingA.thalianabytrypanbluestainingtechnique注：红色箭头指示分别为不同阶段的....

图2.2拟南芥应答根肿菌侵染早期数字表达谱测序质量评估

图2.2拟南芥应答根肿菌侵染早期数字表达谱测序质量评估.2.2SequencingqualityevaluationofA.thalianaexpressionprofileattheinfectionstagebyP.brassicae

图2.3拟南芥应答根肿菌侵染早期数字表达谱测序饱和度Fig.2.3SequencingsaturationanalysisofA.thalianaexpressionprofileattheearlyinfectionstagebyP.brassicae

图2.2拟南芥应答根肿菌侵染早期数字表达谱测序质量评估.2.2SequencingqualityevaluationofA.thalianaexpressionprofileattheinfectionstagebyP.brassicae

图2.4拟南芥应答根肿菌侵染早期表达谱中基因覆盖度Fig.2.4TheresultsofgenecoveragestatisticsofA.thalianaexpressionprofileatthe

根肿菌、寄主及根部内生微生物组交互作用研究拟南芥应答根肿菌侵染早期数字表达谱测序覆盖度测序结果比对拟南芥的基因后，将比对的覆盖度进行了统计。结果如样品CK、样品24h和样品48h中基因的覆盖度在不同程度上的覆盖同时所有样品中一半以上的基因都能够达到50％以上的覆盖....

本文编号：3930209