镰孢菌DNA条形码及多样性研究

发布时间：2024-05-17 21:32

　　镰孢菌是真菌界一类重要的植物病原菌,它可侵染诱发多种植物病害。山西气候独特,作物种类多样,镰孢菌引起的病害发生普遍,其种类亦多。由于镰孢菌的多型性与易变异等特点,使得其被认为是所有真菌类群中在形态分类上最难鉴定的属之一。因此,筛选适宜的基因序列作为镰刀菌鉴定的分子标记,对准确鉴定镰刀菌具有重要的理论和实践价值。DNA条形码技术是利用一个短而通用的DNA片段对物种快速识别和鉴定的技术,与动物、植物相比,真菌DNA条形码技术的研究进展相对缓慢,ITS序列作为真菌DNA条形码的基本序列,在一些属内的适用性不高,对近缘种的分辨率较低。因此,本研究对适用于镰孢菌的DNA条形码进行了筛选,并以所筛选的条形码分析了镰孢菌种内及种间遗传多样性,并对山西省植物病原镰孢菌种群多样性进行了分析,以便为镰孢菌的分类鉴定、系统发育关系分析、检验检疫及相关病害的综合防治等提供理论基础和科学依据。主要研究结果如下:1、本研究以ITS、EF-1α和ββ-tubulin序列为候选DNA条形码,通过对概念清晰的23种50株镰孢菌的150条序列进行适用于镰孢菌的DNA条形码的筛选,结果表明,EF-1a基因序列是3个候选基因...

【文章页数】：122 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图2镰抱菌属各候选基因序列种内及种间遗传距离的频率分布(使用MEGAandExcel)，种内与种间遗传距离分别由白色条带和黑色条带表示

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图２镰孢菌种类鉴定候选基因序列种内及种间遗传距离的频率分布（使用ＭＥＧＡ?ａｎｄ?Ｅｘｃｅｌ），种内??与种间遗传距离分别由白色条带和黑色条带表示

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图３ａ构建基于序列的邻接系?

Ｃｌａｄｅｌ－ＩＶ的支持率依次为８８％、９９％、９７％和１００％；除了与图３ａ中??相同的Ａ未表现出单系性，还包括Ｆ加Ｍ和厂??／ａｆｅｒｚＹ／ｗｗ，其中厂ｚ＿？ｃｒａｍａ；？ｗｍ的两株菌株分别分布在了?Ｃｌａｄｅ?ＩＩ和Ｃｌａｄｅ?ＩＩＩ中；物种鉴??定率为?７３°／。（１１／....

图３ｂ构建基于／序列的邻接系统发育?

—Ｉ??０．０２??图３ａ构建基于序列的邻接系统发育树，自展检验重复１０００次，仅标注支持率大于等于５０％的分支，以??Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ?ｒａｍｕｌａｒｉａｅ?为外群?〇??Ｆｉｇ．?３ａ?Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ?（ＮＪ）?ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?ｉｎｆ....

本文编号：3976006