Bt菌株KN11基因组及杀虫相关基因分析

发布时间：2025-04-18 05:27

　　苏云金芽胞杆菌（Bacillus thuringiensis,简称Bt）是一种革兰氏阳性细菌,它在生长过程中会形成芽胞和晶体,晶体蛋白具有杀虫作用,因为晶体的杀虫效果好,安全,高效等优点而逐渐成为了广泛使用的微生物杀虫剂。由苏云金芽胞杆菌生产的Bt制剂和转Bt作物对鳞翅目（Lepidoptera）和鞘翅目（Coleoptera）等害虫具有很好的防治效果,在害虫控制方面取得了巨大的成功。目前已知高效商业化菌株KN11对美国白蛾具有很好的杀虫活性,已知该菌株具有cry1Aa、cry1Ac、cry1Ca、cry1Da四种杀虫基因。为明确菌株KN11功能特性,进一步挖掘其杀虫性能潜力,本研究在常规形态观察、SDS-PAGE分析的基础上采用基因组高通量测序技术,对菌株KN11进行了基因组分析,包括基因的注释和预测,全基因组比较,更充分地鉴定杀虫基因,在基因组分析的基础上对杀虫蛋白进行了分析,结果如下:KN11营养生长状态的细胞为长杆状,芽胞为长卵形,晶体数量较多,为双锥形。SDS-PAGE分析结果显示KN11主要杀虫蛋白分子量约为130kD与60kD。切取SDS-PAGE主要蛋白条带,进行胰蛋白酶...

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

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摘要
英文摘要
1 前言
    1.1 苏云金芽胞杆菌
        1.1.1 杀虫晶体蛋白基因的命名
        1.1.2 杀虫晶体蛋白的作用机理
        1.1.3 杀虫晶体蛋白的质谱鉴定
        1.1.4 苏云金芽胞杆菌商业化及KN11简介
    1.2 微生物基因组学
        1.2.1 基因组及基因组学
        1.2.2 微生物基因组学及应用
        1.2.3 苏云金芽胞杆菌基因组
    1.3 高通量测序技术简介
        1.3.1 高通量测序技术的历史及发展
        1.3.2 高通量测序技术的优点
        1.3.3 高通量测序基因的拼接方法
    1.4 高通量测序技术在苏云金芽孢杆菌中的应用
        1.4.1 GO功能注释和基因预测
        1.4.2 比较基因组学
        1.4.3 Blast比对本地数据库和聚类分析
    1.5 商业菌株KN11的生物活性测试
    1.6 本研究的目的与意义
    1.7 技术路线
2 材料与方法
    2.1 实验材科
        2.1.1 菌株
        2.1.2 培养基与抗生素
        2.1.3 酶与生化试剂
        2.1.4 常用溶液和缓冲液
    2.2 仪器设备
    2.3 软件或平台
    2.4 研究方法
        2.4.1 菌株的形态学鉴定
        2.4.2 KN11杀虫蛋白的SDS-PAGE分析
        2.4.3 KN11菌株蛋白质谱
        2.4.4 KN11基因组高通量测序拼接
        2.4.5 KN11基因组生物信息学分析
        2.4.6 菌株KN11的防治效果
3 结果与分析
    3.1 菌株的形态学鉴定
    3.2 KN11杀虫蛋白的SDS-PAGE分析
    3.3 KN11菌株蛋白质谱分析
    3.4 KN11菌株基因组简要分析
        3.4.1 KN11基因组提取
        3.4.2 KN11基因组测序
        3.4.3 KN11基因组拼接组装
        3.4.4 KN11基因组注释与预测
        3.4.5 菌株KN11基因组比较分析
        3.4.6 菌株KN11编码杀虫基因情况
    3.5 菌株KN11的防治效果
4 讨论
5 结论
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文



本文编号：4040603