群感信号AHLs对杨树幼苗细根形态建成的影响与调控
【学位单位】:山东农业大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S792.11
【部分图文】:
图 17 转录组拼接、测序流程图Figure 17 The flowchart of transcriptome splicing and sequencing序原始数据质量评估与转录本拼接 2 所示,共测了 49281244 条 reads,碱基数目为 7392186600;经过滤基,得到的 clean reads 数目为 46446436 条,碱基 6962046219 个。有,其中,Q30 占到 90.4%,GC 占到 47%。所以质量合格,可以进行后表 2 测序原始数据以及质控数据统计Table 2 Sequencing raw data and quality control data statistics样品名 Sample_Hy_1原始 reads 数目 49281244原始测序量,即碱基数目 7392186600过滤后得到的 clean reads 数目 46446436过滤后得到的测序量,碱基数目 6962046219有效碱基百分比 94.18%Q30(raw bases 中 Phred 数值大于 30 的碱基占总体
群感信号 AHLs 对杨树幼苗细根形态建成的影响与调控从样本的数据中随机抽取 25 万对 reads,然后与 ntverage 大于 80%的最好的一条结果。由图可得:前 1胡杨-18.74%;杞柳-4.54%;毛果杨×美洲黑杨-4.2%;2.05%;鳗弧菌- 1.17%;猫眼草-0.96%;红皮柳-0.9%;种基本为本物种或近缘物种,初步判断样本无污染。
山东农业大学硕士学位论文GC 含量是基因组碱基序列的重要特征之一,能反映基因的结构C 分布不均匀会导致基因组不同 GC 含量序列其性质和功能也有 GC 含量平均值为 42.50%,其中 GC 含量过高(大于 60%)或过nigenes 不存在,GC 含量基本呈正态分布。从另一方面说明测序
【参考文献】
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本文编号:2835217
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